荸荠查尔酮异构酶基因的克隆与表达分析

发布时间：2021-11-05 14:20

　　查尔酮异构酶（CHI）是植物黄酮合成途径的关键酶,为了研究鲜切荸荠贮藏过程中表面黄化的机理,利用RACE技术对荸荠CHI基因编码区cDNA全长进行克隆,并分析其在不同组织和鲜切荸荠贮藏过程中的表达。结果表明,荸荠CHI基因（CwCHI）cDNA序列长度为1 003 bp（GeneBank:MG719238）,含有一个744 bp的最大开放阅读框,其DNA包含3个内含子和4个外显子。Cw CHI可编码247个氨基酸,经预测其分子量为26.410 kD,理论等电点为4.89。Cw CHI蛋白的二级结构以α-螺旋为主,占38.06%。通过多重比对发现,CwCHI具有该家族特有的保守结构域,决定底物偏好性的第201位氨基酸为Ser,与其他Ⅰ型CHI蛋白相同。系统进化分析表明CwCHI与油棕榈和菠萝的CHI蛋白亲缘关系较近。荧光定量PCR分析表明,CwCHI基因在荸荠皮中的表达量最高,而在荸荠肉中的表达最低。鲜切荸荠黄化过程中CHI活性和CwCHI表达量快速上升,水杨酸处理抑制了CHI活性的上升和CwCHI的表达。 

【文章来源】：保鲜与加工. 2020,20(04)北大核心

【文章页数】：7 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料与设备
        1.1.1 材料与试剂
        1.1.2 仪器与设备
    1.2 方法
        1.2.1 总RNA提取
        1.2.2 基因克隆
        1.2.3 基因生物信息学分析
        1.2.4 酶活性测定
        1.2.5 基因表达分析
        1.2.6 数据处理
2 结果与分析
    2.1 荸荠CHI基因的克隆
    2.2 CwCHI生物信息学分析
    2.3 Cw CHI基因在荸荠不同组织中的表达分析
    2.4 鲜切荸荠黄化过程中CHI活性变化及CwCHI的表达分析
3 讨论与结论


【参考文献】：
期刊论文
[1]乙醇处理对鲜切荸荠黄化及相关酶的影响[J]. 姜悦,何凤平,钟慧玲,王藜颖,潘永贵.  食品工业科技. 2017(10)
[2]桂花查尔酮异构酶OfCHI基因的克隆与表达分析[J]. 张水明,涂佳丽,阿不都热扎克·依沙克,李川微,户倩,陈磊,董丽丽.  西北植物学报. 2016(09)
[3]芍药查尔酮异构酶基因（CHI）克隆、密码子偏好性分析以及蛋白结构功能预测[J]. 吴彦庆,赵大球,王静,陶俊.  华北农学报. 2016(02)
[4]荸荠种质资源品种遗传多样性ISSR分析[J]. 江文,陈丽娟,欧昆鹏,蔡炳华,高美萍,李杨瑞.  西南农业学报. 2015(02)
[5]巨峰葡萄查尔酮异构酶基因克隆及表达分析[J]. 周军,姚泉洪,彭日荷,熊爱生,蔡斌,徐锦涛,金晓芬,陶建敏,章镇.  西北植物学报. 2009(09)
[6]植物查耳酮异构酶生物信息学分析[J]. 陈克克,武雪.  生物信息学. 2009(03)

硕士论文
[1]柚果实黄酮合成相关基因cDNA克隆及生物信息学分析[D]. 任永康.福建农林大学 2010



本文编号：3477965