雨生红球藻HaeDGAT2-3的分子克隆和生物信息学分析

发布时间：2021-11-27 13:16

　　雨生红球藻被认为是天然虾青素的理想来源,虾青素主要储存于富含虾青素酯和三酰甘油（TAGs）的油体中,而二酰甘油酰基转移酶（DGAT）作为三酰甘油及虾青素酯生物合成的限速酶,在雨生红球藻中尚未见报道。试验通过同源克隆与RACE扩增技术相结合的方法获得了2型二酰甘油酰基转移酶（DGAT2-3）的c DNA序列全长,其中,HaeDGAT2-3序列编码区全长为1 149 bp,共编码383个氨基酸;BLASTp分析结果显示,Hae DGAT2-3与衣藻来源的DGAT2相似性达到54.02%;保守功能域分析表明,Hae DGAT2-3蛋白包含DGAT2家族典型的LPLAT超基因家族;多序列比对及系统进化分析结果表明,Hae DGAT2-3蛋白中包括7个保守的功能基序,说明其可能属于DGAT2家族。研究首次从雨生红球藻中克隆得到编码DGAT2的基因序列,生物信息学分析结果对进一步了解雨生红球藻虾青素酯化机制具有重要意义。 

【文章来源】：山西农业科学. 2020,48(05)

【文章页数】：8 页

【文章目录】：
1 材料和方法
    1.1 试验材料
        1.1.1 试验藻种及培养条件
        1.1.2 试验设备
    1.2 试验方法
        1.2.1 总RNA的提取及c DNA的获得
        1.2.2 同源克隆及RACE扩增
    1.3 生物信息学分析
2 结果与分析
    2.1 总RNA的提取和基因克隆结果分析
    2.2 雨生红球藻HaeDGAT2-3蛋白cDNA序列分析
    2.3 雨生红球藻HaeDGAT2-3蛋白理化性质分析
    2.4 雨生红球藻HaeDGAT2-3蛋白的高级结构分析
    2.5 雨生红球藻HaeDGAT2-3多序列比对分析
    2.6 雨生红球藻HaeDGAT2-3的系统进化分析
3 结论与讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]雨生红球藻UVR8的基因克隆和生物信息学分析[J]. 张宏江,杭伟,马浩天,王晓丹,李润植,崔红利.  西南农业学报. 2019(09)
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[3]不同培养模式对雨生红球藻细胞绿色生长以及虾青素积累的影响研究[J]. 李林品,张勇,吴秋瑾,王兴勇.  科技风. 2019(25)
[4]紫苏PfDGAT1酵母功能互补分析[J]. 王计平,周雅莉,任文燕,安茜,段露露,郝月茹,李润植.  山西农业大学学报(自然科学版). 2019(05)
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[6]籽粒苋优质贮藏蛋白AhAMA1基因功能分析[J]. 赵熙宁,张飞,岳敏,安茜,宋亚楠,季春丽,崔红利,李润植.  山西农业科学. 2019(05)
[7]微藻生物技术 助力功能农业[J]. 李润植,季春丽,崔红利.  山西农业大学学报(自然科学版). 2018(03)
[8]雨生红球藻PHOT的基因克隆和生物信息学分析[J]. 崔红利,陈军,王林萍,胡章立,秦松.  西南农业学报. 2017(12)
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[10]二酰基甘油酰基转移酶（DGAT）研究进展[J]. 唐桂英,柳展基,单雷.  中国油料作物学报. 2010(02)



本文编号：3522366