中华鳖il21和il22 cDNA的克隆及急性冷胁迫对部分细胞因子表达的影响
发布时间:2022-01-02 02:56
为了研究急性冷胁迫对中华鳖部分细胞因子表达的影响,本论文首先采用cDNA末端快速扩增技术克隆了中华鳖il21和il22的cDNA并进行了生物信息学分析,其次对il21和il22进行了组织表达模式分析,并从体外以LPS、ConA和poly I:C等免疫刺激剂刺激中华鳖脾脏原代细胞后,检测了il21和il22的表达情况,最后研究了中华鳖在急性冷胁迫以及嗜水气单胞菌胁迫的条件下,脾脏和肠道中的il1β、tnfα、il8、il21、il22和il23a等细胞因子在mRNA水平的应答情况。实验结果如下:1.中华鳖il21和il22 cDNA克隆及生物信息学分析克隆得到的中华鳖il21基因cDNA长为874 bp,ORF长为408 bp,编码135个氨基酸。二级结构主要包括α螺旋、延伸链、无规则卷曲和β转角,三级结构包括信号肽和IL15结构域(IL15家族成员)。系统进化分析表明其与鸟类首先聚类,其次为哺乳类。中华鳖il22 cDNA长度为2263 bp,ORF长度为624 bp,编码207个氨基酸,二级结构也主要包括α螺旋、延伸链、无规则卷曲和β转角,三级结构包括信号肽、跨膜结构域和IL22结构...
【文章来源】:山西大学山西省
【文章页数】:82 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
中华鳖il21ORF的PCR扩增验证100
中华鳖 il21 和 il22 cDNA 的克隆及急性冷胁迫对部分细胞因子表达的影响线示起始密码子或终止密码子,实线框示信号肽,删除线示核心结构域 IL15,双下不稳定信号Fig 2.2 Protein and cDNA sequences of Chinese soft-shelled turtle il21 underlined line indicates the starting codon or stopping codon. The solid frame shows the ide. The deleted line shows the core domain IL15. The double underlined line shows the unsignal
图 2.3 几种脊椎动物 il21 基因的共线性关系图Fig 2.3 Schematic diagram of the il21 homologs in several selected vertebrate speciesGenBank Accession Number: Homo sapiens, NM_021803; Mus musculus, AY428162; Gallus galluNM_001024835; Danio rerio, NM_001128574; Xenopus tropicalis, NM_0011270592.1.2 中华鳖 il21 基因结构分析与共线性关系分析通过搜索 Ensembl 数据库中中华鳖等脊椎动物的基因组序列及注释,并结合隆得到的中华鳖 il21 基因的 cDNA 序列,我们获得了中华鳖和其他部分脊椎物种 il基因的结构图(图 2.4)。中华鳖 il21 cDNA 对应的基因组序列全长为 5917 bp,含 5 个外显子、4 个内含子,与其他物种一样(斑马鱼除外,有 6 个外显子,5 个含子)。
【参考文献】:
期刊论文
[1]中华鳖fut2基因的克隆及其组织表达模式分析[J]. 邢潇,宋如昕. 山西农业科学. 2018(06)
[2]Interleukin-22 contributes to liver regeneration in mice with concanavalin A-induced hepatitis after hepatectomy[J]. Ya-Min Zhang,Zi-Rong Liu,Zi-Lin Cui,Chao Yang,Long Yang,Yang Li,Zhong-Yang Shen. World Journal of Gastroenterology. 2016(06)
[3]趋化因子及受体在结直肠癌中的研究进展[J]. 王粹,胡冬至,柳建中. 中国肿瘤临床. 2013(12)
[4]为什么近年有些教材将鸟类归入“爬行纲”[J]. 郑光美. 生物学通报. 2010(11)
[5]Interleukin-21 triggers effector cell responses in the gut[J]. Daniela De Nitto,Massimiliano Sarra,Francesco Pallone,Giovanni Monteleone. World Journal of Gastroenterology. 2010(29)
[6]中华鳖种质资源的研究现状及保护、利用对策[J]. 黄丽英,何中央,丁诗华,张海琪. 宁波大学学报(理工版). 2005(02)
[7]中华鳖粘液性肠炎病与出血性肠炎病的流行病学[J]. 向静,江为民,蔡建军,赵志坚. 内陆水产. 2003(10)
[8]聚肌胞(polyI:C)抗肿瘤作用和免疫调节作用[J]. 张秀国,吴德政. 癌症. 1991(03)
硕士论文
[1]中华鳖il6的cDNA克隆及其在急性低温胁迫和细菌免疫应答中的表达变化情况[D]. 宋如昕.山西大学 2017
本文编号:3563328
【文章来源】:山西大学山西省
【文章页数】:82 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
中华鳖il21ORF的PCR扩增验证100
中华鳖 il21 和 il22 cDNA 的克隆及急性冷胁迫对部分细胞因子表达的影响线示起始密码子或终止密码子,实线框示信号肽,删除线示核心结构域 IL15,双下不稳定信号Fig 2.2 Protein and cDNA sequences of Chinese soft-shelled turtle il21 underlined line indicates the starting codon or stopping codon. The solid frame shows the ide. The deleted line shows the core domain IL15. The double underlined line shows the unsignal
图 2.3 几种脊椎动物 il21 基因的共线性关系图Fig 2.3 Schematic diagram of the il21 homologs in several selected vertebrate speciesGenBank Accession Number: Homo sapiens, NM_021803; Mus musculus, AY428162; Gallus galluNM_001024835; Danio rerio, NM_001128574; Xenopus tropicalis, NM_0011270592.1.2 中华鳖 il21 基因结构分析与共线性关系分析通过搜索 Ensembl 数据库中中华鳖等脊椎动物的基因组序列及注释,并结合隆得到的中华鳖 il21 基因的 cDNA 序列,我们获得了中华鳖和其他部分脊椎物种 il基因的结构图(图 2.4)。中华鳖 il21 cDNA 对应的基因组序列全长为 5917 bp,含 5 个外显子、4 个内含子,与其他物种一样(斑马鱼除外,有 6 个外显子,5 个含子)。
【参考文献】:
期刊论文
[1]中华鳖fut2基因的克隆及其组织表达模式分析[J]. 邢潇,宋如昕. 山西农业科学. 2018(06)
[2]Interleukin-22 contributes to liver regeneration in mice with concanavalin A-induced hepatitis after hepatectomy[J]. Ya-Min Zhang,Zi-Rong Liu,Zi-Lin Cui,Chao Yang,Long Yang,Yang Li,Zhong-Yang Shen. World Journal of Gastroenterology. 2016(06)
[3]趋化因子及受体在结直肠癌中的研究进展[J]. 王粹,胡冬至,柳建中. 中国肿瘤临床. 2013(12)
[4]为什么近年有些教材将鸟类归入“爬行纲”[J]. 郑光美. 生物学通报. 2010(11)
[5]Interleukin-21 triggers effector cell responses in the gut[J]. Daniela De Nitto,Massimiliano Sarra,Francesco Pallone,Giovanni Monteleone. World Journal of Gastroenterology. 2010(29)
[6]中华鳖种质资源的研究现状及保护、利用对策[J]. 黄丽英,何中央,丁诗华,张海琪. 宁波大学学报(理工版). 2005(02)
[7]中华鳖粘液性肠炎病与出血性肠炎病的流行病学[J]. 向静,江为民,蔡建军,赵志坚. 内陆水产. 2003(10)
[8]聚肌胞(polyI:C)抗肿瘤作用和免疫调节作用[J]. 张秀国,吴德政. 癌症. 1991(03)
硕士论文
[1]中华鳖il6的cDNA克隆及其在急性低温胁迫和细菌免疫应答中的表达变化情况[D]. 宋如昕.山西大学 2017
本文编号:3563328
本文链接:https://www.wllwen.com/projectlw/swxlw/3563328.html
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