霍山石斛内生真菌的多样性、差异性及抑菌活性
发布时间：2022-01-06 16:37
目的:霍山石斛为兰科石斛属植物。基于Illumina MiSeqTM高通量测序技术,（1）比较五种不同生长模式的霍山石斛内生真菌的多样性和差异性;（2）比较设施栽培模式下,不同生长年限的霍山石斛茎段内生真菌的多样性和差异性;（3）通过分离、纯化霍山石斛内生真菌,筛选出霍山石斛中具有抑菌活性的内生真菌,并进行分子水平鉴定。探明不同生长模式和不同生长年限的霍山石斛内生真菌的多样性和差异,同时考察内生真菌潜在的提升植株的抗病害能力,为生态栽培提供发酵菌肥研制提供基础数据。方法:（1）采用E.Z.N.ATMM Mag-Bind Soil DNA Kit的试剂盒提取DNA,通用引物ITS1和ITS2对基因组DNA进行两轮PCR扩增,MiSeq测序平台进行测序,得到的原始图像数据经过CASAVA碱基识别转化为原始测序序列,再进行数据预处理去除引物接头,去除嵌合体及非特异性扩增序列,根据序列之间的相似性（97%）将序列分成不同的操作分类单元即OTU,最后进行Alpha、Beta多样性分析、物种分类分析、多维度分析、菌群差异分析等统计分析。（2）选用组织切片和组织研磨两种方法对霍...
【文章来源】：安徽中医药大学安徽省
【文章页数】：78 页
【学位级别】：硕士
【图文】：
霍山石斛内生真菌群落的α多样性估计
Cladosporium、Aspergillus 、Lophiostoma、Articulospora、Diaporthe 在五种生长方式的霍山石斛内生菌中没有明显差异（P > 0.05），但是Alternaria在五种生长方式的霍山石斛内生菌中存在极显著差异（P < 0.01）(图1-3c)。图 1-3 菌群分布组成柱状图a) 在门水平，b) 在属水平，c) 高分类群的分类群定义内生真菌群落的构建块五组霍山石斛内生菌群相对丰度的统计比较，Fusarium P = 0.243、Cladosporium P = 0.906、Aspergillus P = 0.619、Lophiostoma P = 0.215、Alternaria P = 0.003、Articulospora P = 0.366、Diaporthe P = 0.278.Fig. 1-3 Frequence in microbial communities from samplesa) community distribution of phylum，b) community distribution of genus，c) Taxa at high
abundance of endophytic microbiota among the five groups D. huoshanenseladosporium P = 0.906、Aspergillus P = 0.619、Lophiostoma P = 0.215、A0.003、Articulospora P = 0.366、Diaporthe P = 0.278.多样性比较究五组霍山石斛内生真菌菌群的相似性和差异性，选择主法将所研究的数据可视化，即通过一系列的特征值和特征向量主要排在前几位的特征值；分为加权主坐标分析（Weighted UniF主坐标分析（Unweighted UniFrac PCoA）。通过 PCoA 可以观差异，在 PCoA 图（图 1-4）中，每个符号代表一个样本，类似中树栽、设施栽培与林下栽培、野生霍山石斛在第一坐标轴上分差的 18.0%；在第二坐标轴上，野生霍山石斛与林下栽培霍山石方式的霍山石斛分开，PCo2 解释总变差的 11.0%。
【参考文献】：
期刊论文
[1]不同树龄银杏叶内生真菌的多样性及群落结构分析[J]. 杨琴,邹凯,陈爱佳,郭雪,刘学端,梁伊丽. 湖南农业大学学报(自然科学版). 2019(01)
[2]不同产地甘草内生真菌多样性及分离条件研究[J]. 陈静,许贞,张雪,李妍芃,刘春生. 药学学报. 2019(02)
[3]刺五加内生真菌分离鉴定及抗菌活性研究[J]. 刘悦,张爽,李佳宾,沈宏伟,崔红花,王振月. 天然产物研究与开发. 2019(01)
[4]霍山石斛多糖对小鼠的双向免疫调节作用[J]. 徐海军,方予,汪俊涛,王成苗,冯瑶瑶,梁丽萍. 免疫学杂志. 2018(08)
[5]霍山石斛对小鼠肝脏细胞色素P450酶表达和活性的影响[J]. 王长锁,王凯,孟欣,欧阳臻,戴军,陈乃富,韩邦兴,魏渊. 中国中药杂志. 2018(21)
[6]Root microbiota shift in rice correlates with resident time in the field and developmental stage[J]. Jingying Zhang,Na Zhang,Yong-Xin Liu,Xiaoning Zhang,Bin Hu,Yuan Qin,Haoran Xu,Hui Wang,Xiaoxuan Guo,Jingmei Qian,Wei Wang,Pengfan Zhang,Tao Jin,Chengcai Chu,Yang Bai. Science China（Life Sciences）. 2018(06)
[7]丹参多酚酸盐对阳离子化牛血清白蛋白致膜性肾病大鼠的影响[J]. 陈素枝,陈文军,张卓,宋瑞婧,檀金川. 中草药. 2018(08)
[8]霍山石斛内生真菌的分离及其及活性菌株的鉴定[J]. 闵长莉,闵运江,徐慧欣,汪学军. 天然产物研究与开发. 2018(06)
[9]不同生长年限霍山石斛高效液相指纹图谱研究[J]. 刘刚,俞年军,韩荣春,谢冬梅,刘路路,彭代银,何祥林,张淇军. 中草药. 2018(06)
[10]道地药材品质形成机制的组学研究思路[J]. 王程成,赵慧,严颖,石婧婧,陈舒妤,谈梦霞,陈佳丽,刘子修,陈翠花,邹立思,刘训红. 中国中药杂志. 2018(11)
博士论文
[1]石斛属药用植物内生真菌多样性研究[D]. 胡克兴.中国协和医科大学 2008
[2]石斛属植物菌根生物学研究[D]. 侯晓强.中国协和医科大学 2007
硕士论文
[1]宁夏枸杞根际微生物群落多样性及丛枝菌根真菌对其耐盐性的影响[D]. 肖龙敏.西北农林科技大学 2018
[2]石斛种子内生真菌及对石斛苗生长和耐高温的影响[D]. 卢敏.西南大学 2018
[3]大别山产四种石斛的分子生物学鉴定[D]. 刘枫.安徽中医药大学 2017
[4]不同栽培环境下霍山石斛内生真菌生物多样性的研究[D]. 郁阳.安徽中医药大学 2017
[5]铁皮石斛内生菌根真菌的筛选及其作用机理研究[D]. 杨鹤同.南京农业大学 2015
[6]兰花内生菌对铁皮石斛抗逆性的研究[D]. 张霞.南京林业大学 2011
本文编号：3572802
【文章来源】：安徽中医药大学安徽省
【文章页数】：78 页
【学位级别】：硕士
【图文】：
霍山石斛内生真菌群落的α多样性估计
Cladosporium、Aspergillus 、Lophiostoma、Articulospora、Diaporthe 在五种生长方式的霍山石斛内生菌中没有明显差异（P > 0.05），但是Alternaria在五种生长方式的霍山石斛内生菌中存在极显著差异（P < 0.01）(图1-3c)。图 1-3 菌群分布组成柱状图a) 在门水平，b) 在属水平，c) 高分类群的分类群定义内生真菌群落的构建块五组霍山石斛内生菌群相对丰度的统计比较，Fusarium P = 0.243、Cladosporium P = 0.906、Aspergillus P = 0.619、Lophiostoma P = 0.215、Alternaria P = 0.003、Articulospora P = 0.366、Diaporthe P = 0.278.Fig. 1-3 Frequence in microbial communities from samplesa) community distribution of phylum，b) community distribution of genus，c) Taxa at high
abundance of endophytic microbiota among the five groups D. huoshanenseladosporium P = 0.906、Aspergillus P = 0.619、Lophiostoma P = 0.215、A0.003、Articulospora P = 0.366、Diaporthe P = 0.278.多样性比较究五组霍山石斛内生真菌菌群的相似性和差异性，选择主法将所研究的数据可视化，即通过一系列的特征值和特征向量主要排在前几位的特征值；分为加权主坐标分析（Weighted UniF主坐标分析（Unweighted UniFrac PCoA）。通过 PCoA 可以观差异，在 PCoA 图（图 1-4）中，每个符号代表一个样本，类似中树栽、设施栽培与林下栽培、野生霍山石斛在第一坐标轴上分差的 18.0%；在第二坐标轴上，野生霍山石斛与林下栽培霍山石方式的霍山石斛分开，PCo2 解释总变差的 11.0%。
【参考文献】：
期刊论文
[1]不同树龄银杏叶内生真菌的多样性及群落结构分析[J]. 杨琴,邹凯,陈爱佳,郭雪,刘学端,梁伊丽. 湖南农业大学学报(自然科学版). 2019(01)
[2]不同产地甘草内生真菌多样性及分离条件研究[J]. 陈静,许贞,张雪,李妍芃,刘春生. 药学学报. 2019(02)
[3]刺五加内生真菌分离鉴定及抗菌活性研究[J]. 刘悦,张爽,李佳宾,沈宏伟,崔红花,王振月. 天然产物研究与开发. 2019(01)
[4]霍山石斛多糖对小鼠的双向免疫调节作用[J]. 徐海军,方予,汪俊涛,王成苗,冯瑶瑶,梁丽萍. 免疫学杂志. 2018(08)
[5]霍山石斛对小鼠肝脏细胞色素P450酶表达和活性的影响[J]. 王长锁,王凯,孟欣,欧阳臻,戴军,陈乃富,韩邦兴,魏渊. 中国中药杂志. 2018(21)
[6]Root microbiota shift in rice correlates with resident time in the field and developmental stage[J]. Jingying Zhang,Na Zhang,Yong-Xin Liu,Xiaoning Zhang,Bin Hu,Yuan Qin,Haoran Xu,Hui Wang,Xiaoxuan Guo,Jingmei Qian,Wei Wang,Pengfan Zhang,Tao Jin,Chengcai Chu,Yang Bai. Science China（Life Sciences）. 2018(06)
[7]丹参多酚酸盐对阳离子化牛血清白蛋白致膜性肾病大鼠的影响[J]. 陈素枝,陈文军,张卓,宋瑞婧,檀金川. 中草药. 2018(08)
[8]霍山石斛内生真菌的分离及其及活性菌株的鉴定[J]. 闵长莉,闵运江,徐慧欣,汪学军. 天然产物研究与开发. 2018(06)
[9]不同生长年限霍山石斛高效液相指纹图谱研究[J]. 刘刚,俞年军,韩荣春,谢冬梅,刘路路,彭代银,何祥林,张淇军. 中草药. 2018(06)
[10]道地药材品质形成机制的组学研究思路[J]. 王程成,赵慧,严颖,石婧婧,陈舒妤,谈梦霞,陈佳丽,刘子修,陈翠花,邹立思,刘训红. 中国中药杂志. 2018(11)
博士论文
[1]石斛属药用植物内生真菌多样性研究[D]. 胡克兴.中国协和医科大学 2008
[2]石斛属植物菌根生物学研究[D]. 侯晓强.中国协和医科大学 2007
硕士论文
[1]宁夏枸杞根际微生物群落多样性及丛枝菌根真菌对其耐盐性的影响[D]. 肖龙敏.西北农林科技大学 2018
[2]石斛种子内生真菌及对石斛苗生长和耐高温的影响[D]. 卢敏.西南大学 2018
[3]大别山产四种石斛的分子生物学鉴定[D]. 刘枫.安徽中医药大学 2017
[4]不同栽培环境下霍山石斛内生真菌生物多样性的研究[D]. 郁阳.安徽中医药大学 2017
[5]铁皮石斛内生菌根真菌的筛选及其作用机理研究[D]. 杨鹤同.南京农业大学 2015
[6]兰花内生菌对铁皮石斛抗逆性的研究[D]. 张霞.南京林业大学 2011
本文编号：3572802
本文链接：https://www.wllwen.com/projectlw/swxlw/3572802.html
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