马铃薯StZnT11的电子克

发布时间：2022-02-19 12:11

　　马铃薯锌转运蛋白（Solanum tuberosum zinc transporter 11,StZnT11）对于维持细胞中锌稳态至关重要。通过研究StZnT11在非生物胁迫和生物胁迫下的表达情况,为验证马铃薯StZnT11在青枯菌生物胁迫过程中的作用奠定了基础。从前期工作获得的表达文库中得到EST序列,利用NCBI中的Blast工具,对原始序列进行同源性分析,选择与原始序列的相似度、覆盖度、e期望值最高的一条同源对象序列。通过电子克隆,得到StZnT11基因。采用生物信息学方法对StZnT11基因的基因序列及编码的氨基酸组成、理化性质、分子进化、磷酸化位点、高级结构等多角度进行分析。结果表明,该基因cDNA全长1300bp,编码348个氨基酸,编码蛋白含23个磷酸化位点,有1个信号肽,有9个跨膜区域,是定位在质膜上的疏水性蛋白。通过氨基酸序列比对,StZnT11蛋白与烟草、番茄和辣椒等植物中的锌转运蛋白同源性较高。实时荧光定量聚合酶链反应检测结果表明,StZnT11在不同浓度的外源植物激素脱落酸（ABA）的作用下上调。组织定位检测提示StZnT11主要表达于特定组织（茎维管系统的韧皮... 

【文章来源】：生物工程学报. 2020,36(02)北大核心CSCD

【文章页数】：10 页

【文章目录】：
1材料与方法
    1.1植物与菌株
    1.2生物信息学分析
        1.2.1基因克隆
        1.2.2基因序列分析
        1.2.3基因的系统进化树构建
        1.2.4基因的启动子分析
    1.3激素处理
    1.4青枯菌处理
    1.5用RT-q PCR测定St Zn T11基因表达
        1.5.1 RNA制备
        1.5.2 cDNA全长的获得
        1.5.3 Real-time PCR
    1.6荧光原位杂交
2结果与分析
    2.1生物信息学分析
    2.2 StZnT11蛋白的结构预测和分析
    2.3氨基酸同源性分析及进化树的构建
    2.4 St Zn T11启动子预测和分析
    2.5植物激素诱导的StZnT11表达模式
    2.6青枯菌诱导的StZnT11表达模式
    2.7 StZnT11表达的组织定位
3讨论


【参考文献】：
博士论文
[1]青枯菌诱导的马铃薯防卫相关基因克隆与表达[D]. 郜刚.中国农业科学院 2008



本文编号：3632873