文冠果WRKY转录因子家族的鉴定及非生物胁迫响应模式分析
发布时间:2022-06-03 22:18
文冠果是中国特有的一种优良的木本粮油植物,虽然文冠果作为一种比较重要的经济林木,但以往对文冠果的研究较少,而且主要集中在植物育种研究方面。WRKY转录因子家族在植物生长发育、环境适应等生物学方面发挥着重要作用。最近公布的文冠果基因组序列为鉴定和描述整个文冠果WRKY转录因子家族提供了机会。鉴定成员,探索文冠果WRKY转录因子家族的组成和进化,研究XsWRKY在盐胁迫、ABA、寒冷胁迫下的表达模式,分析差异表达的基因的功能,有利于进一步了解木本植物中XsWRKY转录因子家族的演化以及文冠果抗逆及其调控机制,为文冠果的抗逆品种改良方面提供基因资源和理论基础。本研究得出以下结论:(1)在文冠果中鉴定了 65个XsWRKY转录因子家族成员。(2)文冠果XsWRKY转录因子家族主要分成7个亚家族,其中Ⅱa亚家族成员数量最少,Ⅲ亚家族成员WRKY结构域保守性最弱,Ⅱ亚家族成员最为广泛。(3)各亚家族XsWRKY转录因子家族成员的保守基序和基因结构组成与家族分类具有较高一致性,但不同亚家族间也存在各自特异性的保守基序和基因结构。(4)XsWRKY基因家族可能对ABA、IAA、GA、MeJA、SA激素...
【文章页数】:81 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
1 绪论
1.1 文冠果概述
1.1.1 文冠果简介
1.1.2 文冠果价值
1.2 WRKY转录因子家族在植物中的功能
1.2.1 WRKY转录因子家族概述
1.2.2 WRKY转录因子家族的生物学功能
1.2.3 林木物种WRKY研究
1.3 研究的目的和意义
2 文冠果WRKY转录因子家族的鉴定和分析
2.1 引言
2.2 实验材料
2.3 实验方法
2.3.1 文冠果中WRKY转录因子家族成员鉴定
2.3.2 WRKY家族的分类
2.3.3 WRKY家族成员的基因结构和保守Motif
2.3.4 WRKY基因家族启动子区域顺式作用元件分析
2.3.5 WRKY基因家族共线性分析
2.4 结果与分析
2.4.1 XsWRKY转录因子家族成员
2.4.2 XsWRKY家族组成及系统发育树
2.4.3 XsWRKY家族的保守结构
2.4.4 XsWRKY基因家族启动子区域的顺式作用元件组成
2.4.5 WRKY基因家族共线性
2.5 本章小结
3 文冠果WRKY基因家族的表达分析
3.1 引言
3.2 实验材料
3.2.1 植物材料
3.3 实验方法
3.3.1 植物材料的处理
3.3.2 RNA-seq数据分析
3.3.3 文冠果幼苗叶片总RNA提取
3.3.4 XsWRKY基因cDNA合成
3.3.5 XsWRKY基因实时荧光定量PCR (qRT-PCR)检测
3.4 结果与分析
3.4.1 XsWRKY基因在NaCl胁迫下的表达模式
3.4.2 XsWRKY基因在冷胁迫下的表达模式
3.4.3 XsWRKY基因在ABA胁迫下的表达模式
3.5 本章小结
讨论
结论
参考文献
附录
攻读学位期间发表的学术论文
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]盐碱胁迫对文冠果幼苗水力学特征和碳素分配的影响[J]. 张芸香,王林,田吉,樊兴路,郭晋平. 水土保持学报. 2019(06)
[2]张掖市文冠果产业发展探讨[J]. 王艺林,赵玉红,李小燕,刘建海,张虎. 现代农业科技. 2019(18)
[3]文冠果茶营养价值与功效浅析[J]. 潘晓梅,丁福斌. 食品安全导刊. 2019(21)
[4]文冠果油成分及加工工艺的研究进展[J]. 刘金凤,张倩茹,尹蓉,韩彦龙,高忠东,殷龙龙,孙慧英,王贤萍. 农产品加工. 2018(16)
[5]ThERF1 from Tamarix hispida confers decreased tolerance to oxidative and drought stresses and is regulated by a WRKY protein[J]. Liuqiang Wang,Chao Wang,Liping Qin,Ping Hu,Yucheng Wang. Journal of Forestry Research. 2016(04)
[6]文冠果研究进展[J]. 敖妍,段劼,于海燕,姜常玉,马履一. 中国农业大学学报. 2012(06)
[7]文冠果营养成分分析及食用价值研究[J]. 吴丽清,郑战伟,付凤奇,邓红,曹立强,刘伟. 农产品加工(学刊). 2010(11)
[8]文冠果地理分布和生物生态学特性[J]. 万群芳,何景峰,张文辉. 西北农业学报. 2010(09)
[9]拟南芥AtWRKY25、AtWRKY26和AtWRKY33在非生物胁迫条件下的表达分析[J]. 付乾堂,余迪求. 遗传. 2010(08)
[10]文冠果开花座果研究进展[J]. 丁明秀,敖妍. 中国农学通报. 2008(10)
硕士论文
[1]文冠果油的提取及其生物柴油制备工艺研究[D]. 孙俊.陕西师范大学 2008
本文编号:3653578
【文章页数】:81 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
1 绪论
1.1 文冠果概述
1.1.1 文冠果简介
1.1.2 文冠果价值
1.2 WRKY转录因子家族在植物中的功能
1.2.1 WRKY转录因子家族概述
1.2.2 WRKY转录因子家族的生物学功能
1.2.3 林木物种WRKY研究
1.3 研究的目的和意义
2 文冠果WRKY转录因子家族的鉴定和分析
2.1 引言
2.2 实验材料
2.3 实验方法
2.3.1 文冠果中WRKY转录因子家族成员鉴定
2.3.2 WRKY家族的分类
2.3.3 WRKY家族成员的基因结构和保守Motif
2.3.4 WRKY基因家族启动子区域顺式作用元件分析
2.3.5 WRKY基因家族共线性分析
2.4 结果与分析
2.4.1 XsWRKY转录因子家族成员
2.4.2 XsWRKY家族组成及系统发育树
2.4.3 XsWRKY家族的保守结构
2.4.4 XsWRKY基因家族启动子区域的顺式作用元件组成
2.4.5 WRKY基因家族共线性
2.5 本章小结
3 文冠果WRKY基因家族的表达分析
3.1 引言
3.2 实验材料
3.2.1 植物材料
3.3 实验方法
3.3.1 植物材料的处理
3.3.2 RNA-seq数据分析
3.3.3 文冠果幼苗叶片总RNA提取
3.3.4 XsWRKY基因cDNA合成
3.3.5 XsWRKY基因实时荧光定量PCR (qRT-PCR)检测
3.4 结果与分析
3.4.1 XsWRKY基因在NaCl胁迫下的表达模式
3.4.2 XsWRKY基因在冷胁迫下的表达模式
3.4.3 XsWRKY基因在ABA胁迫下的表达模式
3.5 本章小结
讨论
结论
参考文献
附录
攻读学位期间发表的学术论文
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]盐碱胁迫对文冠果幼苗水力学特征和碳素分配的影响[J]. 张芸香,王林,田吉,樊兴路,郭晋平. 水土保持学报. 2019(06)
[2]张掖市文冠果产业发展探讨[J]. 王艺林,赵玉红,李小燕,刘建海,张虎. 现代农业科技. 2019(18)
[3]文冠果茶营养价值与功效浅析[J]. 潘晓梅,丁福斌. 食品安全导刊. 2019(21)
[4]文冠果油成分及加工工艺的研究进展[J]. 刘金凤,张倩茹,尹蓉,韩彦龙,高忠东,殷龙龙,孙慧英,王贤萍. 农产品加工. 2018(16)
[5]ThERF1 from Tamarix hispida confers decreased tolerance to oxidative and drought stresses and is regulated by a WRKY protein[J]. Liuqiang Wang,Chao Wang,Liping Qin,Ping Hu,Yucheng Wang. Journal of Forestry Research. 2016(04)
[6]文冠果研究进展[J]. 敖妍,段劼,于海燕,姜常玉,马履一. 中国农业大学学报. 2012(06)
[7]文冠果营养成分分析及食用价值研究[J]. 吴丽清,郑战伟,付凤奇,邓红,曹立强,刘伟. 农产品加工(学刊). 2010(11)
[8]文冠果地理分布和生物生态学特性[J]. 万群芳,何景峰,张文辉. 西北农业学报. 2010(09)
[9]拟南芥AtWRKY25、AtWRKY26和AtWRKY33在非生物胁迫条件下的表达分析[J]. 付乾堂,余迪求. 遗传. 2010(08)
[10]文冠果开花座果研究进展[J]. 丁明秀,敖妍. 中国农学通报. 2008(10)
硕士论文
[1]文冠果油的提取及其生物柴油制备工艺研究[D]. 孙俊.陕西师范大学 2008
本文编号:3653578
本文链接:https://www.wllwen.com/projectlw/swxlw/3653578.html
教材专著