三种植物线粒体基因低温差异表达比较分析
发布时间:2022-07-04 21:01
线粒体作为植物细胞的能量代谢中心,在植物响应逆境胁迫中有重要的作用。该研究基于雪莲(Saussurea involucrata)、番茄(Lycopersicon esculentum)和拟南芥(Arabidopsis thaliana)三种不同低温耐受性植物的低温转录组。通过blast比对和数据库检索筛选相关物种的线粒体基因,使用PlantCARE在线网站分析启动子,使用mega7软件对系统发育树构建分析。结果表明:通过差异表达基因筛选,分别在雪莲、拟南芥、番茄中筛选出2、24、15个显著差异表达基因,主要包括线粒体核糖体亚基和电子传递链各复合体亚基,其中部分基因的低温差异表达情况如NAD1和NAD5,可能与植物的低温适应性有关;通过表达模式的聚类分析,雪莲与拟南芥在基因的表达模式上相对于番茄更为相近,且不同类别的基因表达模式在不同物种间差异较大;雪莲与其他菊科植物的呼吸链相关基因的蛋白序列具有很大差异,与万年藓(Climacium dendroides)、牛舌藓(Anomodon minor)等高山植物的进化距离较近。在整体上拟南芥、番茄和雪莲三种植物线粒体基因在低温响应上具有很大差...
【文章页数】:11 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 雪莲、番茄、拟南芥线粒体低温差异表达基因的抽取
1.2 三种植物线粒体基因低温差异表达对比
1.3 三种植物线粒体低温差异表达基因的验证
1.4 三种植物的线粒体呼吸链基因的启动子分析
1.5 多种植物线粒体低温差异表达基因的进化关系分析
2 结果与分析
2.1 三种植物低温差异表达线粒体基因筛选
2.2 三种植物线粒体低温差异基因相对表达量分析通过三种植物低温差异表达热图,雪莲与拟
2.3 三种植物的线粒体基因低温差异表达情况的验证
2.4 三种植物的线粒体呼吸链基因的启动子分析
2.5 不同温度适应性植物线粒体基因序列分析与对比
3 讨论与结论
【参考文献】:
期刊论文
[1]新疆天山雪莲转录组注解知识库[J]. 李锦,严潘瑶,钱飞箭,邱宝义,夏雯雯,牟晓威,邱丽娟,林忠平,陈铭,祝建波,陈贤丰. 植物学报. 2017(04)
[2]植物线粒体呼吸状态的研究方法及其在植物生物学中的应用[J]. 刘美君,孙学娟,张子山,刘玉亭,高辉远. 植物生理学报. 2014(01)
[3]干旱胁迫对持绿性高粱叶片渗透调节及叶绿体超微结构的影响[J]. 周宇飞,王德权,陆樟镳,王娜,王艺陶,李丰先,许文娟,黄瑞冬. 应用生态学报. 2013(09)
[4]线粒体复合体及其对活性氧的调控研究进展[J]. 马晓蕾,周丽娟,孙孟超,任静,宋兴舜. 安徽农业科学. 2013(19)
博士论文
[1]高山离子芥线粒体交替途径介导的抗寒特征研究[D]. 常建锋.兰州大学 2007
本文编号:3655916
【文章页数】:11 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 雪莲、番茄、拟南芥线粒体低温差异表达基因的抽取
1.2 三种植物线粒体基因低温差异表达对比
1.3 三种植物线粒体低温差异表达基因的验证
1.4 三种植物的线粒体呼吸链基因的启动子分析
1.5 多种植物线粒体低温差异表达基因的进化关系分析
2 结果与分析
2.1 三种植物低温差异表达线粒体基因筛选
2.2 三种植物线粒体低温差异基因相对表达量分析通过三种植物低温差异表达热图,雪莲与拟
2.3 三种植物的线粒体基因低温差异表达情况的验证
2.4 三种植物的线粒体呼吸链基因的启动子分析
2.5 不同温度适应性植物线粒体基因序列分析与对比
3 讨论与结论
【参考文献】:
期刊论文
[1]新疆天山雪莲转录组注解知识库[J]. 李锦,严潘瑶,钱飞箭,邱宝义,夏雯雯,牟晓威,邱丽娟,林忠平,陈铭,祝建波,陈贤丰. 植物学报. 2017(04)
[2]植物线粒体呼吸状态的研究方法及其在植物生物学中的应用[J]. 刘美君,孙学娟,张子山,刘玉亭,高辉远. 植物生理学报. 2014(01)
[3]干旱胁迫对持绿性高粱叶片渗透调节及叶绿体超微结构的影响[J]. 周宇飞,王德权,陆樟镳,王娜,王艺陶,李丰先,许文娟,黄瑞冬. 应用生态学报. 2013(09)
[4]线粒体复合体及其对活性氧的调控研究进展[J]. 马晓蕾,周丽娟,孙孟超,任静,宋兴舜. 安徽农业科学. 2013(19)
博士论文
[1]高山离子芥线粒体交替途径介导的抗寒特征研究[D]. 常建锋.兰州大学 2007
本文编号:3655916
本文链接:https://www.wllwen.com/projectlw/swxlw/3655916.html