扬子鳃蛭线粒体基因组全序列测定及其系统学地位——基于Pacbio和Illumina技术

发布时间：2023-01-14 14:22

　　利用Illumina和Pacbio测序技术对扬子鳃蛭（Ozobranchus jantseanus）线粒体基因组全序列进行测序及注释,并与NCBI数据库中蛭纲（Hirudinea）其他物种的线粒体全序列的排列方式和系统进化关系进行了比较,以确定其系统学地位.结果显示:获得的线粒体基因组序列长度为14 868 bp,蛋白编码基因存在2种起始密码子,分别为ATG和ATT;终止密码子共有4种,分别为TAA,TAG,TA和T;蛭纲10个物种的线粒体基因组全序列基因排序可分为2种类型,其差异表现在tRNAs的互换和长非编码区的长度的不同;扬子鳃蛭所属的吻蛭目（Rhynchobdellida）均为b型,绝大部分无吻蛭目（Arhynchobdellida）的排列方式为a型.基于蛭纲物种的13个蛋白编码基因（PCGs）的Neighbor-Joining（NJ）树进化分析显示,扬子鳃蛭与其他吻蛭目物种聚类. 

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【部分图文】：

图１ＰａｃＢｉｏＳｕｂｒｅａｄｓ的长度分布Ｆｉｇ．１ＬｅｎｇｔｈＤｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎｏｆＰａｃＢｉｏＳｕｂｒｅａｄｓ

图３蛭纲线粒体基因组基因序列差异Ｆｉｇ．３ＤｉｆｆｅｒｅｎｃｅｓｉｎＧｅｎｅＯｒｄｅｒｉｎｔｈｅＭｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌＧｅｎｏｍｅｓｆｒｏｍｔｈｅＨｉｒｕｄｉｎｅａ

图４基于线粒体１３个蛋白编码基因ＤＮＡ序列构建的蛭纲物种的ＮＪ树Ｆｉｇ．４ＮＪＰｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃＴｒｅｅｏｆＨｉｒｕｄｉｎｅａＳｐｅｃｉｅｓＢａｓｅｄｏｎ１３ＰＣＧｓ

【参考文献】：
期刊论文
[1]线粒体基因组的遗传与进化研究进展[J]. 潘宝平,卜文俊.  生物学通报. 2005(08)
[2]动物线粒体假基因的识别及其在进化生物学中的应用[J]. 王继文.  动物学杂志. 2004(03)
[3]乌龟寄生性鳃蛭病的防治探讨[J]. 李良华,边书京,蔡军,陈定贵,王维龙,李冬泉.  动物科学与动物医学. 2002(05)

硕士论文
[1]无吻蛭目五种水蛭线粒体基因组注释分析[D]. 徐云玲.湖北中医药大学 2013



本文编号：3730646