茶树类防御素CsDEF2基因的克隆与序列及表达分析

发布时间：2023-04-18 23:25

　　防御素(Defensin)是一类广泛存在动植物中的阳离子短肽,具有多种防御功能。本研究利用转录组数据库,从茶树叶片中克隆了一个类防御素基因CsDEF2并对该基因进行了生物信息学分析,CsDEF2的开放阅读框(ORF)全长246 bp,编码81个氨基酸,蛋白分子量8.68 k D,等电点9.12。序列比对和系统发育分析表明,CsDEF2是防御素家族中的新成员。此外,本研究对病原真菌(茶树镰刀菌)侵染后的茶树叶片中该基因的表达水平进行半定量分析。结果表明,茶树镰刀菌侵染的叶片Cs DEF2基因的表达量相较未侵染叶片明显上调,说明CsDEF2基因可能在防御真菌侵染发挥作用。以上研究结果为提高茶树及其它作物的生物抗性提供了新的靶基因,同时也为探讨茶树生物抗性奠定了基础,具有重要的理论与应用价值。

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【文章目录】：
1 结果与分析
    1.1 茶树Cs DEF2基因克隆与序列分析
    1.2 茶树Cs DEF2生物信息学分析
        1.2.1 Cs DEF2基因蛋白序列同源分析
        1.2.2 蛋白理化性质预测分析
        1.2.3 Cs DEF2氨基酸亲/疏水性分析
        1.2.4 Cs DEF2蛋白信号肽预测与亚细胞定位
        1.2.5 Cs DEF2蛋白的跨膜区结构预测
        1.2.6 Cs DEF2磷酸化位点预测与分析
        1.2.7 茶树Cs DEF2蛋白的保守结构域分析
        1.2.8 Cs DEF2蛋白二级结构和三级结构的预测与分析
    1.3 病菌侵染后茶树Cs DEF2基因半定量表达分析
2 讨论
3 材料与方法
    3.1 植物材料与试剂
    3.2 茶叶总RNA提取与c DNA第一链的合成
    3.3 茶树Cs DEF2基因的克隆
    3.4 茶树Cs DEF2生物信息学分析
    3.5 病原菌的分离培养及菌液制备
    3.6 茶树叶片病原菌的侵染
    3.7 茶树Cs DEF2基因的RT-PCR
作者贡献



本文编号：3793244