季节性变化对漠河河流淤泥和水体环境微生物群落的影响

发布时间：2023-06-18 04:25

　　微生物广泛分布于我们生活的环境甚至是极端环境中,季节性变化形成的复杂自然条件会直接影响微生物群落的结构和功能特征。以黑龙江省漠河县北极村和黑龙江源头地洛古河村的地表水和淤泥为研究对象,利用宏基因组测序的分子生物学技术,通过多元统计分析,得到如下结果:两种环境下微生物的群落结构中,淤泥和水体环境中的微生物群落一共获得103门186纲347目645科2075属,且主要类群绝大多数隶属于细菌界,在门的水平上,总体来说隶属于变形菌门Proteobacteria和拟杆菌门Bacteroidetes等的微生物为主要类群,在纲的水平上,α-变形杆菌纲Alphaproteobacteria、β-变形菌纲 Betaproteobacteria等为主要类群,在目的水平上,伯克氏菌目Burkholderiales等为主要类群,在科的水平中,柄杆菌科Caulobacteraceae,丛毛单胞菌科Comamonadaceae,黄杆菌科Flavobacteriaceae,间孢囊菌科Intrasporangiaceae等为各个样本不同季节中较为丰富的主要类群,在属的水平上,短波单胞菌属Brevundimonas,柄...

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【学位级别】：硕士

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摘要
Abstract
1 绪论
    1.1 微生物多样性
    1.2 环境微生物的国内外相关研究进展
        1.2.1 极端环境微生物
        1.2.2 水生微生物和淤泥微生物
        1.2.3 季节变化对环境微生物的影响
    1.3 微生物传统培养法的不足
    1.4 宏基因组的国内外相关研究进展
    1.5 研究的目的与意义
    1.6 研究内容与技术路线
        1.6.1 研究内容
        1.6.2 技术路线
2 宏基因组测序及数据预处理
    2.1 试验材料
        2.1.1 样本微生物
        2.1.2 主要试剂与仪器
    2.2 研究方法
        2.2.1 样品采集及处理
        2.2.2 DNA文库构建及质量控制
        2.2.3 宏基因组测序的数据处理分析
    2.3 结果与分析
        2.3.1 数据评估及质控的结果及分析
        2.3.2 序列拼接组装的结果及分析
    2.4 本章小结
3 宏基因组分析微生物物种多样性
    3.1 试验材料
        3.1.1 样本微生物
        3.1.2 主要试剂与仪器
    3.2 研究方法
        3.2.1 基因预测与基因丰度
        3.2.2 环境样本α-多样性
        3.2.3 环境样本β-多样性
    3.3 结果与分析
        3.3.1 基因预测与基因丰度的结果分析
        3.3.2 环境样本α-多样性的结果分析
        3.3.3 环境样本β-多样性的结果分析
    3.4 本章小结
4 宏基因组分析微生物群落结构对季节性变化的响应
    4.1 试验材料
        4.1.1 样本微生物
        4.1.2 主要试剂与仪器
    4.2 研究方法
    4.3 结果与分析
        4.3.1 界水平上的样本微生物群落多样性分析
        4.3.2 门水平上的样本微生物群落多样性分析
        4.3.3 纲水平上的样本微生物群落多样性分析
        4.3.4 目水平上的样本微生物群落多样性分析
        4.3.5 科水平上的样本微生物群落多样性分析
        4.3.6 属水平上的样本微生物群落多样性分析
        4.3.7 小结
    4.4 本章小结
5 宏基因组分析微生物群落功能对季节性变化的响应
    5.1 试验材料
        5.1.1 样本微生物
        5.1.2 主要试剂与仪器
    5.2 研究方法
    5.3 结果与分析
        5.3.1 COG功能注释结果及分析
        5.3.2 KEGG功能注释结果及分析
        5.3.3 CAZy功能注释结果及分析
    5.4 本章小结
结论
参考文献
攻读学位期间发表的学术论文
致谢



本文编号：3834775