白菜S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶BrSAMDC基因的克

发布时间：2023-08-04 18:32

　　S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶(S-adenosylmethionine decarboxylase, SAMDC)是生物体内亚精胺合成过程中的限速酶,在植物生长发育及抗逆境胁迫方面起到重要的调节作用。本研究通过RT-PCR技术从大白菜栽培种Chiifu-401中克隆得到一个BrSAMDC基因,并对其进行表达特性及其蛋白的结构与功能进行生物信息学分析。结果表明,BrSAMDC的cDNA扩增序列为1 566 bp,CDS区为1 107 bp,编码368个氨基酸。定量PCR结果显示,BrSAMDC基因在白菜的各个组织均有较高表达,其中角果中的表达量最高,其次为花、茎和根,而在叶片中的表达量最低。BrSAMDC蛋白分子量为40.52 kD,属于亲水、稳定蛋白;预测其分布于细胞核内,不存在信号肽和跨膜结构域;二级结构中以无规则卷曲和α-螺旋为主,三级结构同源建模成功。14种植物SAMDC蛋白的序列对比分析显示,均含有LSESSLF结构域和PEST结构域,且十分保守;十字花科的SAMDC蛋白同源性较高,且其氨基酸的进化与植物分化具有一致性。本研究为白菜SAMDC基因的功能研究及应用提供数据基础。

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【文章目录】：
1 结果与分析
    1.1 白菜总RNA提取及c DNA第一链合成
    1.2 白菜BrSAMDC基因的克隆
    1.3 白菜BrSAMDC基因表达分析
    1.4 白菜BrSAMDC蛋白的生物信息学分析
        1.4.1 BrSAMDC蛋白质基本理化特征预测
        1.4.2 BrSAMDC蛋白功能预测
        1.4.3 白菜BrSAMDC蛋白的结构分析
        1.4.4 同源序列和进化树
2 讨论
3 材料与方法
    3.1 试验材料
    3.2 白菜总RNA提取及cDNA合成
    3.3 白菜BrSAMDC基因的克隆
    3.4 BrSAMDC基因表达分析
    3.5 生物信息学分析
作者贡献



本文编号：3838789