体细胞克隆牛染色质开放区域异常及其表观遗传学研究

发布时间：2024-05-21 02:44

　　每个细胞的染色质DNA只有一部分表现出生物学活性,其染色质结构疏松,基因组DNA呈松散状态,该区域能够与转录元件结合,是染色质中基因表达活跃的部分,人们称之为染色质开放区域或者易接近染色质区域,剩下不活跃的部分则被紧密包装成高度凝聚的染色质而沉默下来。染色质的开放和关闭状态直接影响了包括基因表达、DNA复制和DNA修复在内的多种基本细胞过程。与此同时,染色质开放区域也是多种表观遗传修饰的共同结果,特别是与促进基因表达相关的表观遗传修饰的共同作用结果。克隆动物存活率低、发育异常,通常认为是表观修饰异常造成的。目前,克隆动物染色质开放区域差异性分析还没有任何相关研究,异常的表观修饰如何调控和影响克隆动物染色质状态也并不清楚。为了理解体细胞克隆牛染色质开放区域差异,我们选取外表健康存活的6头克隆牛耳组织样为研究对象,将其分成两组,其中3头(huiwa(HW),xingwa(XW),longwa(LW))克隆牛的供体核来源于胎儿成纤维细胞,另3头克隆牛(S1231,S1232,S1253)的供体核来源输卵管上皮细胞的体细胞,我们将这6种细胞的供体核进行ATAC-seq和RNA-seq分析。在A...

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【部分图文】：

图1-1DNA甲基化示意图

体细胞克隆牛染色质开放区域异常及其表观遗传学研究4者它对半甲基化DNA的偏好性较强，这从酶和生物化学性质上也可以得到验证。Dnmt1是首个被发现并成功获得克隆表达的DNA甲基化转移酶，它是一段有一千多个氨基酸组成。另外，还有一种酶Dnmt3L，该种酶是在体内缺乏其他Dnmt酶时存....

图1-2DNA去甲基化机制（LisaDM,etal,2013）

体细胞克隆牛染色质开放区域异常及其表观遗传学研究6式[30]，它不管是在化学结构和遗传传递上都能保持相对的稳定。在化学结构中它能够形成起到去甲基化屏障的碳-碳键，这里的碳-碳键就是由甲基和胞嘧啶碱基的5号位连接，它能够起到保护甲基化的作用；在遗传上因为Dnmt甲基转移酶家族的存在....

图1-3染色质不同形态

9作用并抑制转录活性[32]。根据它们与酵母和亚细胞定位中的HDAC的同源性，十八种目前已知的HDAC被分为四类。I类（HDAC1-3和8），II（HDAC4-7,9和10）和IV（HDAC11）的酶活性需要锌，而III类HDAC（sirtuins1-7）是尼古丁腺嘌呤二核苷酸（....

图3-1支原体鉴定示意图

273结果与分析3.1体细胞克隆牛细胞样的ATAC-seq实验将6株不同的体细胞克隆牛细胞从液氮罐中取出复苏，然后铺于适当的培养平皿中培养。培养两天后进行细胞支原体污染鉴定（如3-1），确定无支原体污染。图3-1支原体鉴定示意图孔道1为huiwa；孔道2为longwa、孔道3为x....

本文编号：3979494