DNA甲基化酶家族生物信息学分析及其在尼罗罗非鱼中的表达和功能初探

发布时间：2024-06-11 23:24

　　表观遗传学研究在不改变DNA序列下的可遗传改变,DNA甲基化是表观遗传学研究的重要内容之一。以往的研究表明DNA甲基化在鱼类的性别决定和分化过程中具有重要作用,DNA甲基化酶在此过程中发挥的作用仍不清楚,本研究分析了DNA甲基化酶在脊椎动物中的系统进化及其成员扩增与动物全基因组复制的关系,并研究了DNA甲基化酶家族成员在尼罗罗非鱼不同组织、不同发育时期雌鱼(卵巢)和雄鱼(精巢)性腺以及由雌转雄次发性逆转过程中的表达。此外,在离体条件下,采用DNA甲基化酶抑制剂5-氮杂-2-脱氧胞苷(5-aza-dC)体外孵育罗非鱼性腺组织,研究了抑制剂处理对DNA甲基化酶以及雌、雄通路关键基因表达的影响;在在体条件下,采用不同浓度梯度5-aza-dC浸浴或腹腔注射仔稚鱼,研究了抑制剂处理对罗非鱼幼鱼骨骼发育和性腺分化的影响,初步评估了DNA甲基化酶在尼罗罗非鱼发育过程中的功能。主要研究结果如下:1)本研究在尼罗罗非鱼基因组中鉴定了7个DNA甲基化酶家族成员,包括dnmt1、dnmt2、dnmt3aa、dnmt3ab、dnmt3ba、dnmt3bb.1和dnmt3bb.2,此外还从海鞘、象鲨、腔棘鱼、爪...

【文章页数】：73 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
第1章 文献综述
    1 鱼类性别决定与性腺分化
        1.1 鱼类的性别
        1.2 鱼类的性别决定方式
        1.3 鱼类的性别分化
    2 DNA甲基化
        2.1 DNA甲基化机制
        2.2 DNA甲基化与基因表达调控
        2.3 DNA甲基化酶分类及成员
        2.4 DNA甲基化酶结构与功能
        2.5 DNA甲基化酶在脊椎动物的表达模式
        2.6 DNA甲基化和DNA甲基化酶与性腺发育
    3 科学问题的提出和本研究的目的意义
第2章 DNA甲基化酶家族生物信息学分析及表达研究
    1 引言
    2 材料和方法
        2.1 实验鱼
        2.2 DNA甲基化酶家族成员鉴定
        2.3 DNA甲基化酶家族系统发育分析及基因定位
        2.4 DNA甲基化酶家族共线性分析
        2.5 DNA甲基化酶家族成员在罗非鱼中的时空表达模式分析
        2.6 DNA甲基化酶家族成员表达模式验证
    3 结果
        3.1 尼罗罗非鱼DNA甲基化酶鉴定
        3.2 DNA甲基化酶系统进化分析
        3.3 DNA甲基化酶家族成员共线性分析
        3.4 DNA甲基化酶在罗非鱼中的时空表达模式
        3.5 DNA甲基化酶表达模式验证结果分析
    4 讨论
        4.1 DNA甲基化酶家族成员的分离、系统发生及共线性
        4.2 从头甲基化酶在罗非鱼性腺中的表达具有性差
        4.3 DNA甲基化酶复制基因在罗非鱼中的表达模式发生分歧
第3章 DNA甲基化酶在罗非鱼性腺发育中的功能
    1 引言
    2 材料和方法
        2.1 实验动物
        2.2 主要试剂和仪器
        2.3 实验方法
    3 结果
        3.1 抑制剂体外孵育对甲基化酶基因和性腺分化关键基因表达的影响
        3.2 抑制剂浸浴后罗非鱼畸形率和死亡率统计
        3.3 抑制剂腹腔注射后罗非鱼性腺组织学检测
    4 讨论
        4.1 DNA甲基化酶抑制剂体外孵育上调性腺分化关键基因的表达
        4.2 DNA甲基化酶抑制剂浸浴导致罗非鱼畸形率和死亡率增加
        4.3 DNA甲基化酶抑制剂腹腔注射使雌性罗非鱼性逆转
第4章 结论
本研究的不足与展望
参考文献
致谢
在读期间发表论文
在读期间参加科研情况



本文编号：3992869