鳄蜥不同地理种群间免疫基因MHC与TLR4多态性差异的初步研究

发布时间：2025-03-30 06:04

　　国家I级保护野生动物、珍稀濒危物种——鳄蜥(Shinisaurus crocodilurus Ahl,1930)正面临严峻的生存问题,包括种群数量快速下降、生境地遭受破坏导致片段化、疾病起源与治疗方案未知等多重问题。物种长期生存,依赖于内在基因的遗传多样性,特别是免疫基因的遗传多样性对物种抵御环境变化、病原体侵袭至关重要,了解鳄蜥免疫基因多样性有助于评估其长期生存能力、对野外自然环境病原体的抗性,对人工繁育管理、野外放归策略的制定具有重大的指导意义。在免疫基因中,先天性TLR4(Toll-like receptor 4)基因已经被证明对爬行类物种的免疫具有重要功能,MHC(Major histocompatibility complex)基因则在大多数脊椎动物中均有分布且研究广泛,在爬行动物的免疫系统中与其他哺乳类具有同等重要的功能。有研究资料表明,TLR受体对MHC受体的表达具有调控作用,这两个基因可以为研究鳄蜥复杂的免疫系统提供基础资料。因此,为了解鳄蜥免疫基因遗传多样性程度,本文选取MHC基因与TLR4基因,利用PCR扩增与测序及生物信息学分析方法,对国内广西大桂山、广西大瑶山、广...

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【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图1-1 鳄蜥MHCI氨基酸序列与其他物种比对

如图1-2所示,MHCI的893D1基因编码的α1结构域与其他物种同源性在48.2%-61.4%之间,α2在44.9%到77.5之间,α3在28.9%到67.5%之间。MHCI的636D7α1结构域与其他物种同源性在24.1%到51.2%之间,α2在34.8%到61.8%之间,α....

图1-2 鳄蜥MHCI氨基酸与其他物种同源性比对

图1-1鳄蜥MHCI氨基酸序列与其他物种比对2.3.2最佳引物筛选结果

图2 MHCII基因898D1的PCR条带图

本实验中所有MHC基因扩增位点的产物长度大致相同,长度在230bp²58bp之间,因此条带的位置差异不具明显性,不将所有扩增位点的条带图展示,仅将898D1基因扩增的外显子3条带图在本文展示,如图2所示,该图条带长250bp。2.3.4序列多态性分析

图3-1 MHCI基因序列比对

MHCI-898D1基因大部分个体都表现出序列的高度一致性,如图3-3所示,该基因的外显子2仅有一个碱基位点的变异。但值得注意的是,一只来自广西大桂山种群的鳄蜥个体a2具有24个碱基变异位点,具有相当高的多态性,与其他物种的MHC多态性相当。经过对这只个体的两次独立扩增和测序,并....

本文编号：4038306