南海及北极海域四株细菌的多相分类研究

发布时间：2018-10-12 17:40

【摘要】：本论文以分离自南海和北极海域表层海水样品的四株细菌作为研究对象,利用多相分类方法,详细研究了这四株细菌的表型,细胞化学组成及分子遗传学等方面的分类特征,最终基于分类特征分析分别确定了它们的分类地位。1.菌株SM1501~T的多相分类研究菌株SM1501~T分离自南海表层海水样品。菌株SM1501~T的革兰氏染色反应为阴性,其细胞为短杆状,无鞭毛,好氧。该菌株生长的温度范围为7-42℃,生长的NaCl浓度范围是0-11%(w/v)。菌株SM1501~T的主要脂肪酸是C17:1ω6c,C15:0 2-OH,C17:1ω8c和C18:1ω7c。该菌的极性脂包括磷脂酰乙醇胺(phosphatidylethanolamine,PE),磷脂酰甘油(phosphatidylglycerol,PG),鞘糖脂(sphingoglycolipid,SGL),双磷脂酰甘油(diphosphatidylglycerol,DPG)及磷脂酰胆碱(phosphatidylcholine,PC)。该菌的主要细胞呼吸醌是泛醌10(ubiquinone-10,Q-10)。菌株 SM1501~T 的细胞基因组 DNA G+C 含量为 66.8 mol%。菌株SM1501~T与Erythrobacter属成员的16S rRNA基因序列相似性最高(94.2-97.4%),基于16S rRNA基因序列的系统进化树显示菌株SM1501~T与Erythrobacter luteus,Erythrobacter atlanticus,Erythrobacter gangjinensis 及Erythrobacter marinus成簇,但形成一个独立的进化分支。基于以上多相分类学数据,菌株SM1501~T代表Erythrobacter属的一个新种,命名为Erythrobacternanhaiensis sp.nov.,菌株 SM1501~T(= KCTC 42669T=CCTCCAB2015396T)为该新种的模式菌株。2.菌株SM1502~T的多相分类研究菌株SM1502~T来源于北极海域表层海水样品。菌株SM1502~T革兰氏阴性菌,细胞为杆状,无鞭毛。菌株SM1502~T生长的温度范围为10-40℃,生长的NaCl浓度范围为0-8.0%(w/v)。菌株 SM1502~T 的主要脂肪酸为 iso-C15:0,iso-C17:1ω9c,iso-C17:0 3-OH,iso-C15:1 G,C15:0及unknown ECL 13.565;其主要极性脂为磷脂酰乙醇胺(PE),一种未鉴定结构的氨基磷脂及一种未鉴定结构的极性脂类。菌株SM1502~T的主要呼吸醌类为甲基萘醌6(menaquinone 6,MK-6)。菌株SM1502~T基因组DNA的G+C含量为37.0 mol%。菌株 SM1502~T 与Flavobacterium suzhouense的16S rRNA 基因序列相似性最高(96.0%);在基于16S rRNA基因序列的系统进化树中,菌株SM1502~T和Flavobacterium属内包括Flavobacterium suzhouense在内的六个已知种成簇,同时形成单独的簇内分支。以上多相分类数据表明,菌株SM1502~T代表Flavobacterium属内的一个新种,命名为 Flavobacterium arcticum sp.nov.,菌株 SM1502~T(=KCTC 42668T=CCTCC AB 2015346T)为该种的模式菌株。3.菌株SM1503~T的多相分类研究菌株SM1503~T分离自南海表层海水样品,为革兰氏阴性菌,其触酶及氧化酶为阳性。菌株SM1503~T生长温度范围在8-45℃之间,生长的NaCl浓度范围是0-7.5%(w/v)。菌株SM1503~T可以还原硝酸盐为亚硝酸盐,可水解Tween 20、40及60。菌株 SM1503~T 的主要脂肪酸包含 C17:1ω6c,C17:0,C15:0,C18:1ω7c,C17:1ω8c以及C16:o;主要极性脂为磷脂酰乙醇胺(phosphatidylethanolamine,PE),磷脂酰甘油(phosphatidylglycerol,PG),双磷脂酰甘油(diphosphatidylglycerol,DPG),鞘糖脂(sphingoglycolipid,SGL)和磷脂酰胆碱(phosphatidylcholine,PC)。该菌主要呼吸醌为泛醌10(ubiquinone-10,Q-10),其基因组DNA的G+C 含量为 61.6 mol%。16S rRNA基因序列比对分析表明菌株SM1503~T与Sphingomonadaceae科内Blastomonas及Parablastomonas属已知种有最高的序列相似性(95.2-95.8%),根据16S rRNA基因序列构建的系统进化树显示菌株SM1503~T在Blastomona及Parablastomonas进化分支的根部形成一个独立的进化分枝。上述多相分类数据表明,菌株SM1503~T应属于Sphingomonadaceae科内的一个新属,命名为Pseudoblastomonasgen.nov.,而菌株SM1503~T表该属内的一个新种,命名为Pseudoblastomonas maris gen.nov.,sp.nov.,菌株 SM1503~T(=KCTC 42715T = CCTCC AB 2015347T)是该新种的模式菌株。4.菌株SM1504~T的多相分类研究菌株SM1504~T来源于北极海域表层海水样品。菌株SM1504~T革兰氏阴性菌,严格好氧,无运动性。菌株SM1504~T生长的温度范围为4-30℃,生长的NaCl浓度范围为0-4.0%(w/v)。菌株SM1504~T可水解七叶苷和明胶,但不能还原硝酸盐为亚硝酸盐。菌株 SM1504~T 的主要脂肪酸为 summed feature 3(包含 C16:1ω7c 和/或 iso-C15:02-OH)和iso-C15:0;菌株SM1504~T的极性脂为磷脂酰乙醇胺(PE)和一种未鉴定的极性脂类。菌株SM1504~T的主要呼吸醌类为甲基萘醌7(menaquinone 7,MK-7)。菌株SM1504~T基因组DNAG+C含量为40.8mol%。基于16S rRNA基因序列的系统进化树显示菌株S]M1504T在Cytophagaceae科内与 Lacihabitans,Emticicia,Fluviimonas 及 Leadbetterella 属成员紧密成簇,但形成独立的簇内分枝,而该菌株与这些属成员的16SrRNA基因序列相似性非常低(88.9-91.6%)。基于上述多相分类数据分析,菌株SM1504~T应隶属于Cytophagaceae科内的一个新属,命名为Arcticibacteriumgen.nov.,而菌株SM1504~T代表该新属内的一个新种,命名为Arcticibacterium lutifluviistationis gen.nov.,sp.nov.,菌株SM1504r(=KCTC42716~T=CCTCCAB2015348~T)为该种的模式菌株。
[Abstract]:......
【学位授予单位】：山东大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2017
【分类号】：Q93

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