倍蚜寄主盐肤木属叶绿体全基因组及进化意义

发布时间：2020-12-09 07:54

　　倍蚜属半翅目Hemiptera蚜科Aphididae绵蚜亚科Eriosomatinae五节根蚜族Fordini,是典型的转主寄生性昆虫,对第一寄主植物有较强的专化,仅寄生在漆树科Anacardiaceae盐肤木属Rhus的五种植物即分布在东亚的盐肤木、红麸杨和青麸杨及北美的Rhus typhina和Rhus glabra,二者之间已经形成稳定的进化关系。倍蚜在第一植物上寄生形成的虫瘿特称为五倍子,富含单宁,广泛用于医药、食品和轻工等领域,具有极高的经济价值。本文采用二代高通量测序技术对倍蚜第一寄主植物及其姊妹种黄连木的叶绿体基因组（cpDNA）进行测序、拼接组装和基因注释,分析基因组特征;从GenBank下载漆树科物种cpDNA序列,用生物信息学分析手段进行基因组比较,探讨cpDNA在不同物种之间的变异和进化规律,构建系统发育关系,分析漆树科不同物种的近缘关系;与寄生倍蚜的系统发育关系进行相关性检验,分析二者之间的协同进化关系。主要研究结果如下:1.获得倍蚜寄主盐肤木属5个种和姊妹属种黄连木cpDNA全序列,盐肤木属cpDNA长度介于159,187-159,984 bp之间,其中光滑漆... 

【文章来源】：山西大学山西省

【文章页数】：68 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

盐肤木属序列共线性分析

第三章倍蚜寄主盐肤木属叶绿体基因组特征21图3.2盐肤木属叶绿体基因组边界区域信息Fig3.2ThechloroplastgenomeofIRregioninformationfromRhus3.5盐肤木属序列共线性分析为明确倍蚜寄主盐肤木属各物种基因排列顺序是否一致，判断其中是否存在基因重排与倒位现象，利用Geneious中Mauve将盐肤木属叶绿体基因组全序列进行共线性分析，结果如图3.3。通过对倍蚜第一寄主盐肤木属进行共线性分析，与本研究中姊妹种黄连木叶绿体基因组全序列进行Mauvealighment，得到基因排列顺序及共线性结果如图3.3。盐肤木属叶绿体基因组基因排列顺序一致，未发生大面积基因重排与基因缺失现象，呈现共线性结构。图3.3盐肤木属序列共线性分析Fig3.3SyntenyanalysesofchloroplastgenomesfromRhus

倍蚜寄主盐肤木属叶绿体全基因组及进化意义26基因位于LSC区域，无明显的扩张与收缩。槟郎青属IR区长度与漆树科其他属种IR区长度差异较大，根据其边界分析主要由IR区扩张引起，其IR区长度较长。在LSC-IRa边界上漆树科各物种边界均位于trn-H基因与rpl2基因之间，除盐肤木属R.chinensis和黄连木属P.chinensis、P.vera、P.weinmaniifolia的trn-H基因与边界间隔极小分别为2bp、7bp、7bp、1bp外，其余物种trn-H基因与边界间隔均在25-60bp之间。在IRa-SSC边界上，所有物种均位于ycf1基因上，并无明显的扩张与收缩出现。图4.1盐肤木属与漆树科其他植物IR区边界比较Fig4.1ComparisonoftheBordersofRhusandotherspeciesofAnacardiaceaeintheIRArea


本文编号：2906549