酸性矿山废水中嗜酸菌生理性质及比较基因组学研究

发布时间:2021-01-11 21:37
  酸性矿山废水(acid mine drainage,AMD)是由硫化物矿物长期暴露于地表,在水、大气和微生物共同作用下产生的,具有酸性强(pH 3.0左右)、金属含量高等特点。在酸性矿山废水的形成过程中,嗜酸菌发挥着重要的催化作用。因此,要理解酸性矿山废水的形成机制,就必须了解嗜酸菌的代谢机制和适应性能。本研究从安徽某铁矿酸性废水中分离纯化出了4株嗜酸菌,并分别对其进行了生理生化性质及重金属耐受性质测定,进而利用比较基因组学的方法解析了其代谢机制和抗逆性能。具体研究结果如下:(1)对分离纯化出的4株嗜酸菌进行16S rRNA基因测序和系统发育分析,初步命名为Acidocella sp.SW、Acidocella sp.BW2、Ralstonia sp.BP、Ralstonia sp.BW。(2)4株细菌都是常见的中温嗜酸菌,但生理生化性质有所不同。Acidocella sp.SW的最适生长pH为3.0,最适生长温度是35℃,可在03%的NaCl浓度下生长;Acidocella sp.BW2最适生长pH为3.0,最适生长温度是35℃,可在02%... 

【文章来源】:中国地质大学(北京)北京市 211工程院校 教育部直属院校

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酸性矿山废水中嗜酸菌生理性质及比较基因组学研究


技术路线

采样点,美国,仪器设备


中国地质大学(北京)硕士学位论文9图2-1采样点2.2.2仪器设备实验中使用的仪器设备见表2-1。表2-1实验过程中使用的仪器设备设备名称生产厂家Centrifuge5417R离心机Eppendorf(德国)C1000TMThermalCyclerPCR仪BIO-RAD(美国)GelDocTMXR+gel凝胶成像仪BIO-RAD(美国)90-2恒温磁力搅拌器BIO-RAD(美国)BS2202S电子天平赛多利斯(德国)DYY-6C电泳仪北京市六一仪器厂YX-2800蒸汽灭菌锅合肥华泰医疗设备SW-CJ-1FD超净工作台苏州安泰空气8157BNUMDpH计ThermoFisherScientific(美国)NanoDrop2000ThermoFisherScientific(美国)Thermo-831979-134超低温冰箱ThermoFisherScientific(美国)2.2.3实验试剂实验中使用到的试剂见表2-2。

序列,基因组,原核生物,引物


第2章嗜酸菌的分离、鉴定与理化性质14相比于白小菌落较大,表面有光泽,轮廓明显,有凸起。粉红颜色为淡粉色,菌落边缘光滑,有凸起。白大2菌落与白大较为相似。图2-2菌落特征图(a)SW;(b)BW;(c)BP;(d)BW22.3.2DNA和系统发育树分析从4株菌中提取基因组DNA,用原核生物16SrRNA引物对基因组DNA模板进行扩增,扩增产物经1%琼脂糖凝胶电泳后在紫外(UV)照射下显示约1500bp的产物。在NCBI官网上使用NCBI进行16SrRNA基因序列的同源性比对。SW、BW2与最相似细菌Acidocellafacilis.PW216SrRNA的部分序列相似性分别为

【参考文献】:
期刊论文
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[3]酸性矿山废水的成因及源头控制技术[J]. 郑先坤,冯秀娟,王佳琪,龙焙,连军锋,朱易春.  有色金属科学与工程. 2017(04)
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[10]番茄品种抗性与青枯菌和土壤微生物的关系[J]. 刘琼光,杨艳.  仲恺农业技术学院学报. 2006(03)

硕士论文
[1]嗜酸异养细菌的分离、鉴定以及应用[D]. 张晓雪.兰州大学 2009



本文编号:2971515

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