Paenibacillus polymyxa SC2中yogA基因功能的研究
发布时间：2021-04-14 20:29
多粘类芽孢杆菌（Paenibacillus polymyxa）SC2为实验室从辣椒根际土壤筛选出的一株植物根际促生细菌（plant-growth-promoting rhizobacteria,PGPR）。该菌生理特性多样,既能够产生细胞生长素、细胞分裂素等多种促生代谢物,又能分泌杀镰孢菌素（fusaricidins）和多粘菌素（polymyxin）等多种应用价值较高的抗生素,是一株抗菌谱广、促生效果明显、作物抗病性好的根际促生菌。但实验室条件下P.polymyxa SC2菌株不稳定,极易突变,本实验以性状较稳定的突变株P.polymyxa SC2-M1为实验菌株。通过对P.polymyxa SC2全基因组及蛋白质组学分析预测YogA（醇脱氢酶）蛋白与FusE（醛脱氢酶）蛋白存在相互作用关系,预测YogA可能与FusE共同参与相关代谢途径。为进一步明确YogA功能,本研究对yogA基因进行比对分析,构建了yogA基因敲除菌株并结合组学数据进行分析,探讨yogA基因的功能。实验通过同源重组方法对P.polymyxa SC2-M1中yogA基因进行敲除,以强启动子质粒对yogA基因进行超表...
【文章来源】：山东农业大学山东省
【文章页数】：86 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
多粘菌素的结构图
山东农业大学硕士学位论文7图1-2杀镰孢菌素结构图Fig.1-2StructuresoffusaricidinsP.polymyxaSC2在培养过程中菌株发生形态分化，分离出突变株SC2-M1、SC2-M2。与野生型SC2相比，突变菌株在部分方面都发生了很大的变化，包括：与运动性相关的鞭毛，细菌的休眠体芽孢的形成，菌落形态，多聚半乳糖和多聚果糖等多糖物质合成，真菌病原菌和细菌病原菌的拮抗能力，生物膜形成，细菌本身对营养体的利用能力等（侯晓阳，2015）。突变株P.polymyxaSC2-M1在传代培养中性状稳定且比较容易转化。1.4醇脱氢酶概述实验室前期通过对多粘类芽孢杆菌SC2蛋白质组学分析发现，YogA与FusE存在作用关系，如图1-3：图1-3SC2蛋白质组学分析预测蛋白作用调控关系图Fig.1-3ProteomicsanalysispredictsproteinregulationofSC2
山东农业大学硕士学位论文7图1-2杀镰孢菌素结构图Fig.1-2StructuresoffusaricidinsP.polymyxaSC2在培养过程中菌株发生形态分化，分离出突变株SC2-M1、SC2-M2。与野生型SC2相比，突变菌株在部分方面都发生了很大的变化，包括：与运动性相关的鞭毛，细菌的休眠体芽孢的形成，菌落形态，多聚半乳糖和多聚果糖等多糖物质合成，真菌病原菌和细菌病原菌的拮抗能力，生物膜形成，细菌本身对营养体的利用能力等（侯晓阳，2015）。突变株P.polymyxaSC2-M1在传代培养中性状稳定且比较容易转化。1.4醇脱氢酶概述实验室前期通过对多粘类芽孢杆菌SC2蛋白质组学分析发现，YogA与FusE存在作用关系，如图1-3：图1-3SC2蛋白质组学分析预测蛋白作用调控关系图Fig.1-3ProteomicsanalysispredictsproteinregulationofSC2
【参考文献】：
期刊论文
[1]乳酸菌的代谢组学研究进展[J]. 吕铭守,林美君,陈凤莲,张光,石彦国. 中国调味品. 2019(11)
[2]双功能乙醛/乙醇脱氢酶AdhE参与细菌与宿主互作的机制研究进展[J]. 蔡瑶,龚双燕,陈瑛琪,李幽幽,李小璟,徐志文,朱玲. 微生物学通报. 2019(06)
[3]转录组测序的发展和应用[J]. 王楚彪,卢万鸿,林彦,罗建中. 桉树科技. 2018(04)
[4]一株多粘类芽孢杆菌Paenibacillus polymyxa对甘薯黑斑病的生物防治效果及作用机理初探[J]. 王波,周涧楠,黄忠勤,丁震乾,常勇,苏在兴,周兴根. 江西农业学报. 2017(10)
[5]洛阳地区烟草根际土壤中多粘类芽孢杆菌的分离与鉴定[J]. 宋喜乐,赵世民,赵云波,江凯,康业斌. 烟草科技. 2016(12)
[6]一株多粘类芽孢杆菌的鉴定及其生防促生效果初步测定[J]. 郭芳芳,谢镇,卢鹏,郭岩彬,张立钦,王勇军. 中国生物防治学报. 2014(04)
[7]多粘类芽孢杆菌HY96-2产脂肽类抗真菌物质的研究[J]. 范磊,张道敬,刘振华,陶黎明,罗远婵,魏鸿刚,李淑兰,李元广. 天然产物研究与开发. 2012(06)
[8]代谢组学、药物代谢组学与中医药现代化[J]. 林景超,李后开,周明眉,贾伟. 中国医学科学院学报. 2007(06)
[9]多粘类芽孢杆菌极端嗜热多肽的纯化及性质研究[J]. 周华强,谭芙蓉,周颖,郑爱萍,李平. 现代农药. 2007(03)
[10]ALG-SiO2杂化凝胶固定化多酶体系催化CO2转化甲醇研究[J]. 许松伟,陆杨,苑伟康,吴洪,姜忠义. 生物加工过程. 2005(03)
博士论文
[1]多粘类芽孢杆菌SC2形态分化的分子机制研究[D]. 侯晓阳.山东农业大学 2015
[2]多粘类芽孢杆菌SQR-21中fus基因簇特性研究及基因组分析[D]. 李舒清.南京农业大学 2013
硕士论文
[1]结核分枝杆菌醇脱氢酶adhA通过调节代谢影响持留菌形成[D]. 张媛.西南大学 2019
[2]基于转录组学与代谢组学的Streptococcus thermophilus TF96氨基酸代谢机制研究[D]. 黄珊.东北农业大学 2017
[3]多粘类芽孢杆菌（Paenibacillus polymyxa）SC2对辣椒根系分泌物的响应机制研究[D]. 吴棣.山东农业大学 2017
[4]多粘类芽孢杆菌（Paenibacillus polymyxa）SC2与辣椒互作机理研究[D]. 李玉菲.山东农业大学 2017
[5]多粘类芽孢杆菌抗真菌活性及对水果采后病害的控制效果研究[D]. 陈大欢.河北科技大学 2015
[6]结核分枝杆菌生物膜形成相关基因的筛选与鉴定[D]. 刘霞.宁夏医科大学 2013
[7]多粘类芽孢杆菌SC2的全基因组测序[D]. 王翠翠.山东农业大学 2011
[8]多粘类芽孢杆菌（Paenibacillus polymyxa）SC2 fus基因簇的克隆与分析[D]. 赵丽明.山东农业大学 2010
[9]辣椒根际拮抗菌筛选、鉴定及多粘类芽孢杆菌SC2拮抗相关基因克隆[D]. 朱辉.山东农业大学 2008
本文编号：3137967
【文章来源】：山东农业大学山东省
【文章页数】：86 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
多粘菌素的结构图
山东农业大学硕士学位论文7图1-2杀镰孢菌素结构图Fig.1-2StructuresoffusaricidinsP.polymyxaSC2在培养过程中菌株发生形态分化，分离出突变株SC2-M1、SC2-M2。与野生型SC2相比，突变菌株在部分方面都发生了很大的变化，包括：与运动性相关的鞭毛，细菌的休眠体芽孢的形成，菌落形态，多聚半乳糖和多聚果糖等多糖物质合成，真菌病原菌和细菌病原菌的拮抗能力，生物膜形成，细菌本身对营养体的利用能力等（侯晓阳，2015）。突变株P.polymyxaSC2-M1在传代培养中性状稳定且比较容易转化。1.4醇脱氢酶概述实验室前期通过对多粘类芽孢杆菌SC2蛋白质组学分析发现，YogA与FusE存在作用关系，如图1-3：图1-3SC2蛋白质组学分析预测蛋白作用调控关系图Fig.1-3ProteomicsanalysispredictsproteinregulationofSC2
山东农业大学硕士学位论文7图1-2杀镰孢菌素结构图Fig.1-2StructuresoffusaricidinsP.polymyxaSC2在培养过程中菌株发生形态分化，分离出突变株SC2-M1、SC2-M2。与野生型SC2相比，突变菌株在部分方面都发生了很大的变化，包括：与运动性相关的鞭毛，细菌的休眠体芽孢的形成，菌落形态，多聚半乳糖和多聚果糖等多糖物质合成，真菌病原菌和细菌病原菌的拮抗能力，生物膜形成，细菌本身对营养体的利用能力等（侯晓阳，2015）。突变株P.polymyxaSC2-M1在传代培养中性状稳定且比较容易转化。1.4醇脱氢酶概述实验室前期通过对多粘类芽孢杆菌SC2蛋白质组学分析发现，YogA与FusE存在作用关系，如图1-3：图1-3SC2蛋白质组学分析预测蛋白作用调控关系图Fig.1-3ProteomicsanalysispredictsproteinregulationofSC2
【参考文献】：
期刊论文
[1]乳酸菌的代谢组学研究进展[J]. 吕铭守,林美君,陈凤莲,张光,石彦国. 中国调味品. 2019(11)
[2]双功能乙醛/乙醇脱氢酶AdhE参与细菌与宿主互作的机制研究进展[J]. 蔡瑶,龚双燕,陈瑛琪,李幽幽,李小璟,徐志文,朱玲. 微生物学通报. 2019(06)
[3]转录组测序的发展和应用[J]. 王楚彪,卢万鸿,林彦,罗建中. 桉树科技. 2018(04)
[4]一株多粘类芽孢杆菌Paenibacillus polymyxa对甘薯黑斑病的生物防治效果及作用机理初探[J]. 王波,周涧楠,黄忠勤,丁震乾,常勇,苏在兴,周兴根. 江西农业学报. 2017(10)
[5]洛阳地区烟草根际土壤中多粘类芽孢杆菌的分离与鉴定[J]. 宋喜乐,赵世民,赵云波,江凯,康业斌. 烟草科技. 2016(12)
[6]一株多粘类芽孢杆菌的鉴定及其生防促生效果初步测定[J]. 郭芳芳,谢镇,卢鹏,郭岩彬,张立钦,王勇军. 中国生物防治学报. 2014(04)
[7]多粘类芽孢杆菌HY96-2产脂肽类抗真菌物质的研究[J]. 范磊,张道敬,刘振华,陶黎明,罗远婵,魏鸿刚,李淑兰,李元广. 天然产物研究与开发. 2012(06)
[8]代谢组学、药物代谢组学与中医药现代化[J]. 林景超,李后开,周明眉,贾伟. 中国医学科学院学报. 2007(06)
[9]多粘类芽孢杆菌极端嗜热多肽的纯化及性质研究[J]. 周华强,谭芙蓉,周颖,郑爱萍,李平. 现代农药. 2007(03)
[10]ALG-SiO2杂化凝胶固定化多酶体系催化CO2转化甲醇研究[J]. 许松伟,陆杨,苑伟康,吴洪,姜忠义. 生物加工过程. 2005(03)
博士论文
[1]多粘类芽孢杆菌SC2形态分化的分子机制研究[D]. 侯晓阳.山东农业大学 2015
[2]多粘类芽孢杆菌SQR-21中fus基因簇特性研究及基因组分析[D]. 李舒清.南京农业大学 2013
硕士论文
[1]结核分枝杆菌醇脱氢酶adhA通过调节代谢影响持留菌形成[D]. 张媛.西南大学 2019
[2]基于转录组学与代谢组学的Streptococcus thermophilus TF96氨基酸代谢机制研究[D]. 黄珊.东北农业大学 2017
[3]多粘类芽孢杆菌（Paenibacillus polymyxa）SC2对辣椒根系分泌物的响应机制研究[D]. 吴棣.山东农业大学 2017
[4]多粘类芽孢杆菌（Paenibacillus polymyxa）SC2与辣椒互作机理研究[D]. 李玉菲.山东农业大学 2017
[5]多粘类芽孢杆菌抗真菌活性及对水果采后病害的控制效果研究[D]. 陈大欢.河北科技大学 2015
[6]结核分枝杆菌生物膜形成相关基因的筛选与鉴定[D]. 刘霞.宁夏医科大学 2013
[7]多粘类芽孢杆菌SC2的全基因组测序[D]. 王翠翠.山东农业大学 2011
[8]多粘类芽孢杆菌（Paenibacillus polymyxa）SC2 fus基因簇的克隆与分析[D]. 赵丽明.山东农业大学 2010
[9]辣椒根际拮抗菌筛选、鉴定及多粘类芽孢杆菌SC2拮抗相关基因克隆[D]. 朱辉.山东农业大学 2008
本文编号：3137967
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