利用分析Fto功能及运用单碱基编辑技术研究m 6 A去甲基化的作用
发布时间:2021-07-30 02:52
N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)是真核生物mRNA中最丰富的一种甲基化修饰。甲基转移酶和去甲基化酶的存在,使得m6A修饰在细胞中成为一个动态可逆的过程,最终决定m6A修饰的靶mRNA转录本的命运。m6A在基因表达调节、蛋白质翻译、细胞行为等方面起着至关重要的作用。肥胖相关蛋白(Fat mass and obesity associated protein,Fto)是一种m6A去甲基化酶,其在脑发育中的m6A去甲基化的生物学功能仍未知。因此本研究构建了Fto基因敲除鼠(Fto-KO),基于分析m6A去甲基化酶Fto的功能来探索m6A去甲基化在小鼠脑发育中的生物学作用。结果显示,在小鼠出生后第14天(P14),与野生型小鼠相比,Fto-KO鼠的体重、体长和脑组织重量均显著性下调。其次,P14时期Fto-KO小鼠的全脑组织明显变小,特别是小脑发生严重畸形。此外,小鼠脑组织冷冻切片尼氏染色结...
【文章来源】:华侨大学福建省
【文章页数】:86 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
CRISPR/Ca9系统的作用机制CRISPR/Ca9系统切割DNA链,产生双链DNA缺口后
22图2.1Fto基因敲除策略首先设计合适的sgRNA靶向Fto基因的3号外显子,然后将Cas9mRNA和sgRNA显微注射到C57BL/6J小鼠的受精卵中,通过非同源重组修复方式(NHEJ)造成Fto基因蛋白读码框移码,功能缺失。2、小鼠交配策略本研究是基于分析m6A去甲基化酶Fto的功能来研究m6A去甲基化对小鼠脑发育的影响,所以需要获得一定数量的Fto纯合子基因敲除鼠(基因型标记为-/-)供后续试验研究。小鼠交配策略如图2.2所示。首先,将获得的F0代Fto杂合子基因敲除鼠(基因型标记为+/-)和野生型C57BL/6J小鼠(基因型标记为+/+)交配,繁殖获得一定数量的Fto杂合子基因敲除鼠。然后将获得的Fto杂合子基因敲除鼠雌雄同笼进行繁殖,获得目的Fto纯合子基因敲除鼠进行后续实验。同时,也获得了更多的Fto杂合子基因敲除鼠,这一部分小鼠继续雌雄同笼进行繁殖以获得更多的Fto纯合子基因敲除鼠。
23图2.2Fto基因敲除鼠初步交配策略图中白色背景的为野生型小鼠(+/+),绿色背景的为Fto杂合子基因敲除鼠(+/-),红色背景的为Fto纯合子基因敲除鼠(-/-)。2.1.2.2小鼠基因组DNA的抽提1、用酒精棉擦拭剪刀,然后剪取约3mm小鼠的尾尖放置于无菌的2mL离心管中。2、向上述离心管中加入600μL细胞裂解缓冲液(BufferSalting-out)和6μL蛋白酶K(10mg/mL),上下颠倒混匀后放置于55℃恒温箱内过夜消化。3、加入600μL的DNA提取液(苯酚:氯仿:异戊醇=25:24:1),充分颠倒混匀后12000rpm,离心10min。4、用200μL的移液枪缓慢地吸取适量的上清液并转移至无菌的离心管中,加入2倍体积的无水乙醇。充分颠倒混匀后,放置于离心机中,12000rpm离心15min。5、离心完毕后,弃去上清液,并将离心管放置在通风橱内使沉淀充分干燥。然后根据沉淀的大小加入50μL至200μL无菌水,充分溶解即可得到DNA溶液,然后将其放置于-20℃保存。
本文编号:3310539
【文章来源】:华侨大学福建省
【文章页数】:86 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
CRISPR/Ca9系统的作用机制CRISPR/Ca9系统切割DNA链,产生双链DNA缺口后
22图2.1Fto基因敲除策略首先设计合适的sgRNA靶向Fto基因的3号外显子,然后将Cas9mRNA和sgRNA显微注射到C57BL/6J小鼠的受精卵中,通过非同源重组修复方式(NHEJ)造成Fto基因蛋白读码框移码,功能缺失。2、小鼠交配策略本研究是基于分析m6A去甲基化酶Fto的功能来研究m6A去甲基化对小鼠脑发育的影响,所以需要获得一定数量的Fto纯合子基因敲除鼠(基因型标记为-/-)供后续试验研究。小鼠交配策略如图2.2所示。首先,将获得的F0代Fto杂合子基因敲除鼠(基因型标记为+/-)和野生型C57BL/6J小鼠(基因型标记为+/+)交配,繁殖获得一定数量的Fto杂合子基因敲除鼠。然后将获得的Fto杂合子基因敲除鼠雌雄同笼进行繁殖,获得目的Fto纯合子基因敲除鼠进行后续实验。同时,也获得了更多的Fto杂合子基因敲除鼠,这一部分小鼠继续雌雄同笼进行繁殖以获得更多的Fto纯合子基因敲除鼠。
23图2.2Fto基因敲除鼠初步交配策略图中白色背景的为野生型小鼠(+/+),绿色背景的为Fto杂合子基因敲除鼠(+/-),红色背景的为Fto纯合子基因敲除鼠(-/-)。2.1.2.2小鼠基因组DNA的抽提1、用酒精棉擦拭剪刀,然后剪取约3mm小鼠的尾尖放置于无菌的2mL离心管中。2、向上述离心管中加入600μL细胞裂解缓冲液(BufferSalting-out)和6μL蛋白酶K(10mg/mL),上下颠倒混匀后放置于55℃恒温箱内过夜消化。3、加入600μL的DNA提取液(苯酚:氯仿:异戊醇=25:24:1),充分颠倒混匀后12000rpm,离心10min。4、用200μL的移液枪缓慢地吸取适量的上清液并转移至无菌的离心管中,加入2倍体积的无水乙醇。充分颠倒混匀后,放置于离心机中,12000rpm离心15min。5、离心完毕后,弃去上清液,并将离心管放置在通风橱内使沉淀充分干燥。然后根据沉淀的大小加入50μL至200μL无菌水,充分溶解即可得到DNA溶液,然后将其放置于-20℃保存。
本文编号:3310539
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