海洋放线菌分离及Streptomycessp. S42中天然产物的挖掘
发布时间：2022-01-15 16:43
天然产物数量庞大,结构、活性及作用机制复杂多样,是新药开发的重要源泉。放线菌是天然产物的最主要来源,众多放线菌来源的天然产物及其衍生物为癌症、阿尔兹海默症和疟疾等疾病的治疗做出了很大贡献。但近年来天然产物的重复发现率越来越高,多重耐药菌株不断出现,对抗生素的研发速度及质量提出了更高的要求。海洋为巨大的生物资源宝库,很多海洋放线菌为了适应低温低氧高盐高压的极端环境,衍生出多种抗逆机制,使其次级代谢途径更加特殊,产物结构更加新颖,海洋放线菌天然产物是药物先导化合物的重要来源。本研究聚焦于海洋放线菌中新型活性天然产物的挖掘。首先从海洋沉积物中分离到多株具有抗菌活性的放线菌,并对Streptomyces sp.S42进行活性为指导的天然产物挖掘,但仅鉴定出已知化合物司帕霉素。然后通过16S rDNA序列比对发现Streptomyces sp.S42的分类地位较新,通过基因组测序发现其基因组编码25个天然产物生物合成基因簇,大多与已知基因簇相似度较低,因此有必要对其进行基因组挖掘。本研究选择Streptomyces sp.S42中五个新颖的孤儿基因簇（最大77kb）利用Red/ET重组工程技术进...
【文章来源】：山东大学山东省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：113 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１－２?Ｉ丨型ＰＫＳ?Ｔｅｔｒａｃｅｎｏｍｙｃｉｎ?Ｃ的生物合成机制［３０］??Ｆｉｕｒｅ?１－２?Ｂｉｏｓｎｔｈｅｓｉｓ?ｍｅｃｈａｎｉｓｍ?ｏｆ?ｔｅ?ＩＩ?ＰＫＳ?Ｔｅｔｒａｃｅｎｏｍｙｃｉｎ?Ｃ??
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?山东大学硕士学位论文???利用Ｒｅｄ／ＥＴ重组工程技术选择新颖的孤儿基因族进行直接克隆，确定异源表达??宿主，通过组合生物学重构进行理性激活。然后通过分离纯化技术鉴定相应代谢??产物，测定生物活性，从中筛选低毒性高活性的药物先导化合物。同时研宄化合??物构效关系，阐明活性作用机制，并解析其生物合成途径。最后利用组合生物合??成得到杂合基因簇，获得更多结构衍生物。??ＯＰ?ＢＧＣｓ挖掘??基因组测序?ｒ??活性追踪?－?＾ＡｉｊＡＧＣ?丨朴??活性测定ｆ分离纯化??★?－?－??—－阐明生物合成途径?ｇ．??｜遗传修饰??＾?｜?（大肠杆菌）??＼?＿?ｐｒｏｍｏｌｔｒ??％Ｎ＾＿?Ｉ?議?ＬＣ－ＭＳ?接合转移?＾?＇?＇ｉ＞??、一?＾￣?Ｌ？一?？?丁??图１－７本研究技术路线（以“★”为出发点）??Ｆｉｇｕｒｅ?１－７?Ｔｅｃｈｎｉｃａｌ?ｒｏｕｔｅ?ｏｆ?ｔｈｅ?ｒｅｓｅａｒｃｈ?（Ｔａｋｅ?ａｓ?ｔｈｅ?ｓｔａｒｔｉｎｇ?ｐｏｉｎｔ）??１４??
【参考文献】：
期刊论文
[1]海洋药物研究开发进展[J]. 王成,张国建,刘文典,杨新雨,朱妮,申静敏,王志成,刘杨,程珊,于广利,管华诗. 中国海洋药物. 2019(06)
[2]黄河三角洲滨海湿地非培养放线菌多样性[J]. 冯鸽,许姗姗,王超,严立恩,张璇,李静. 微生物学通报. 2013(09)
[3]黄嘌呤氧化酶抑制剂的研究进展[J]. 王春辉,李松. 国外医学.药学分册. 2006(05)
[4]糖尿病和肥胖症治疗新靶点PTP1B抑制剂的研究进展[J]. 张薇,李静雅,李佳. 生命科学. 2006(05)
[5]黄河三角洲海洋资源开发及海洋经济发展刍议[J]. 刘兆德,李玉增,高士友. 资源开发与市场. 1999(04)
本文编号：3590967
【文章来源】：山东大学山东省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：113 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１－２?Ｉ丨型ＰＫＳ?Ｔｅｔｒａｃｅｎｏｍｙｃｉｎ?Ｃ的生物合成机制［３０］??Ｆｉｕｒｅ?１－２?Ｂｉｏｓｎｔｈｅｓｉｓ?ｍｅｃｈａｎｉｓｍ?ｏｆ?ｔｅ?ＩＩ?ＰＫＳ?Ｔｅｔｒａｃｅｎｏｍｙｃｉｎ?Ｃ??
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?山东大学硕士学位论文???利用Ｒｅｄ／ＥＴ重组工程技术选择新颖的孤儿基因族进行直接克隆，确定异源表达??宿主，通过组合生物学重构进行理性激活。然后通过分离纯化技术鉴定相应代谢??产物，测定生物活性，从中筛选低毒性高活性的药物先导化合物。同时研宄化合??物构效关系，阐明活性作用机制，并解析其生物合成途径。最后利用组合生物合??成得到杂合基因簇，获得更多结构衍生物。??ＯＰ?ＢＧＣｓ挖掘??基因组测序?ｒ??活性追踪?－?＾ＡｉｊＡＧＣ?丨朴??活性测定ｆ分离纯化??★?－?－??—－阐明生物合成途径?ｇ．??｜遗传修饰??＾?｜?（大肠杆菌）??＼?＿?ｐｒｏｍｏｌｔｒ??％Ｎ＾＿?Ｉ?議?ＬＣ－ＭＳ?接合转移?＾?＇?＇ｉ＞??、一?＾￣?Ｌ？一?？?丁??图１－７本研究技术路线（以“★”为出发点）??Ｆｉｇｕｒｅ?１－７?Ｔｅｃｈｎｉｃａｌ?ｒｏｕｔｅ?ｏｆ?ｔｈｅ?ｒｅｓｅａｒｃｈ?（Ｔａｋｅ?ａｓ?ｔｈｅ?ｓｔａｒｔｉｎｇ?ｐｏｉｎｔ）??１４??
【参考文献】：
期刊论文
[1]海洋药物研究开发进展[J]. 王成,张国建,刘文典,杨新雨,朱妮,申静敏,王志成,刘杨,程珊,于广利,管华诗. 中国海洋药物. 2019(06)
[2]黄河三角洲滨海湿地非培养放线菌多样性[J]. 冯鸽,许姗姗,王超,严立恩,张璇,李静. 微生物学通报. 2013(09)
[3]黄嘌呤氧化酶抑制剂的研究进展[J]. 王春辉,李松. 国外医学.药学分册. 2006(05)
[4]糖尿病和肥胖症治疗新靶点PTP1B抑制剂的研究进展[J]. 张薇,李静雅,李佳. 生命科学. 2006(05)
[5]黄河三角洲海洋资源开发及海洋经济发展刍议[J]. 刘兆德,李玉增,高士友. 资源开发与市场. 1999(04)
本文编号：3590967
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