基于数据场与3-D图形表示的DNA序列分析

发布时间：2022-02-09 10:21

　　该文提出了DNA序列的一种3-D图形表示,并且针对此图形表示的非退化性给出了数学证明。然后计算所提3维图形表示的L/L矩阵的ALE指标,并给出了所提3维图形的图半径,从而对DNA序列进行数值刻画。结合物理学中重力场势函数的思想,构造了向量形式的数据对象间的势函数,进而以K-近邻算法为分类器,对208个RIG-I基因进行了分类识别。实验结果证明了该文所提的分类办法是有效的。 

【文章来源】：科技资讯. 2020,18(21)

【文章页数】：3 页

【部分图文】：

4种碱基A、C、G、T的赋向图

【参考文献】：
期刊论文
[1]基于综合DNA序列特征的支持向量机方法识别核小体定位[J]. 崔颖,徐泽龙,李建中.  生物医学工程学杂志. 2020(03)
[2]一种基于数据场的K-均值算法[J]. 简艳,贾洪勇.  计算机应用研究. 2010(12)
[3]基于数据场的大规模本体映射[J]. 仲茜,李涓子,唐杰,周立柱.  计算机学报. 2010(06)

博士论文
[1]基于多核和众核平台的并行DNA序列比对算法[D]. 产院东.山东大学 2019
[2]基于新型表达模式的序列特征获取方法及应用研究[D]. 向其林.湖南大学 2017
[3]鸡MDA5-STING-IFN-β抗病毒天然免疫通路的发现及其信号转导机制[D]. 程玉强.上海交通大学 2016

硕士论文
[1]DNA序列的图形表示及其应用[D]. 费文超.渤海大学 2016
[2]基于图形表示的DNA序列相似性分析[D]. 王科.河北科技大学 2016



本文编号：3616835