EDAG/THAP11相互作用调控HSC功能的分子机制研究
发布时间:2022-02-21 16:48
造血干细胞(HSC,Hematopoietic stem cell)是血液系统各种成熟细胞的最初来源,其通过自我更新来维持HSC群体的稳定,通过定向分化产生各种造血祖细胞进而分化成各种成熟血细胞。自我更新与分化的平衡是长期维持造血功能所必须的,其调控是个复杂的过程。转录因子是调控造血干细胞功能的驱动力,转录因子往往通过蛋白质相互作用的方式发挥精确的转录调控作用。EDAG(Erythroid differentiation-associated gene)是一种造血组织特异表达并可调节造血干细胞增殖与分化的重要转录辅助因子,具有双重转录调节活性。对EDAG结构分析发现该蛋白虽然可调节多种基因的表达,但并不具备任何已知的DNA结合结构域,我们推测很可能是通过与其他转录因子相互作用,发挥转录调控作用。THAP11(Thanatos-associated protein11)是THAP家族中的一员,其是一种含有C2-CH锌指DNA结合结构域,能够识别一段15bp(ACTACNNT CCCAG)左右双链DNA序列的转录因子。已知THAP11在胚胎干细胞的存活及多能性维持中发挥重要作用,但在造血干...
【文章来源】:安徽医科大学安徽省
【文章页数】:118 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
前言
1.转录因子调控网络对HSC的影响
2.线粒体与HSC命运
3.ChIP/ChIP-Seq技术
4.EDAG(Erythroid differentiation-associated gene)基因
5.THAP11(Thanatos-associated protein 11)基因
第一部分 利用表达谱芯片筛选EDAG与THAP11敲低后表达变化基因
1.引言
2.材料与方法
2.1 实验材料
2.2 实验方法
3.结果
3.1 敲低THAP11 K562细胞株的建立
3.2 敲低EDAG K562细胞株的建立
3.3 基因表达谱芯片确定表达差异基因
3.4 表达差异基因验证及整合分析
4.讨论
第二部分 利用ChIP-Seq技术筛选EDAG与THAP1在染色体上的结合谱
1.引言
2.材料与方法
2.1 实验材料
2.2 实验方法
3.结果
3.1 ChIP条件的确定
3.2 ChIP-seq确定靶基因
3.3 EDAG/THAP11靶基因整合分析
4.讨论
第三部分 数据的整合、分析与验证
1.引言
2.材料与方法
2.1 实验材料
2.2 实验方法
3.结果
3.1 数据的整合分析
3.2 报告基因验证EDAG/THAP11的调控作用
3.3 EDAG/THAP11对线粒体的影响
4.讨论
第四部分THAP11条敲小鼠的制备与初步表型分析
1.引言
2 材料与方法
2.1 实验材料
2.2 实验方法
3.结果
3.1 Ronin条件性敲除小鼠鉴定
3.2 Ronin~(loxp/+)Vav-Cre~(Tg)小鼠表型初步鉴定
4.讨论
结论
参考文献
附录
个人简历
致谢
综述
参考文献
【参考文献】:
期刊论文
[1]EDAG-1在白血病和淋巴瘤细胞株中的表达[J]. 周颖,许望翔,詹轶群,李长燕,徐诚望,郑红,李菲菲,杨晓明,汪思应. 癌症. 2004(11)
[2]在NIH3T3细胞中高表达EDAG-1基因导致细胞恶性转化[J]. 闾军,许望翔,汪思应,江岩,李长燕,蔡卫民,杨晓明. 生物化学与生物物理学报. 2002(01)
[3]EDAG-1,一种与造血调控密切相关新基因的分离和确认[J]. 闾军,许望翔,汪思应,詹轶群,江岩,蔡卫民,杨晓明. 生物化学与生物物理学报. 2001(06)
本文编号:3637662
【文章来源】:安徽医科大学安徽省
【文章页数】:118 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
前言
1.转录因子调控网络对HSC的影响
2.线粒体与HSC命运
3.ChIP/ChIP-Seq技术
4.EDAG(Erythroid differentiation-associated gene)基因
5.THAP11(Thanatos-associated protein 11)基因
第一部分 利用表达谱芯片筛选EDAG与THAP11敲低后表达变化基因
1.引言
2.材料与方法
2.1 实验材料
2.2 实验方法
3.结果
3.1 敲低THAP11 K562细胞株的建立
3.2 敲低EDAG K562细胞株的建立
3.3 基因表达谱芯片确定表达差异基因
3.4 表达差异基因验证及整合分析
4.讨论
第二部分 利用ChIP-Seq技术筛选EDAG与THAP1在染色体上的结合谱
1.引言
2.材料与方法
2.1 实验材料
2.2 实验方法
3.结果
3.1 ChIP条件的确定
3.2 ChIP-seq确定靶基因
3.3 EDAG/THAP11靶基因整合分析
4.讨论
第三部分 数据的整合、分析与验证
1.引言
2.材料与方法
2.1 实验材料
2.2 实验方法
3.结果
3.1 数据的整合分析
3.2 报告基因验证EDAG/THAP11的调控作用
3.3 EDAG/THAP11对线粒体的影响
4.讨论
第四部分THAP11条敲小鼠的制备与初步表型分析
1.引言
2 材料与方法
2.1 实验材料
2.2 实验方法
3.结果
3.1 Ronin条件性敲除小鼠鉴定
3.2 Ronin~(loxp/+)Vav-Cre~(Tg)小鼠表型初步鉴定
4.讨论
结论
参考文献
附录
个人简历
致谢
综述
参考文献
【参考文献】:
期刊论文
[1]EDAG-1在白血病和淋巴瘤细胞株中的表达[J]. 周颖,许望翔,詹轶群,李长燕,徐诚望,郑红,李菲菲,杨晓明,汪思应. 癌症. 2004(11)
[2]在NIH3T3细胞中高表达EDAG-1基因导致细胞恶性转化[J]. 闾军,许望翔,汪思应,江岩,李长燕,蔡卫民,杨晓明. 生物化学与生物物理学报. 2002(01)
[3]EDAG-1,一种与造血调控密切相关新基因的分离和确认[J]. 闾军,许望翔,汪思应,詹轶群,江岩,蔡卫民,杨晓明. 生物化学与生物物理学报. 2001(06)
本文编号:3637662
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