染色质重塑复合体ATP酶CHR16在拟南芥响应干旱胁迫中的作用

发布时间：2023-12-09 17:07

　　染色质重塑通过形成一系列重塑复合体对染色质修饰进行精确调控,影响各类转录调节因子与染色质结合的难易程度,进而使细胞感受各种信号和环境剌激,并在调控基因时空特异性表达和沉默方面发挥重要作用,形成了一系列分子开关。SNF2类染色质重塑复合体ATP酶在调控植物生长发育和对逆境的响应中扮演极其重要的角色。CHR16是SNF2家族中的成员,目前关于CHR16的生物学功能鲜有报道。本课题组在前期工作中发现拟南芥CHR16基因通过调控CLV3,WUS,STM,PLT2,SCR,CYCB,QC46和QC184等基因的表达,在SAM和RAM的形成及干细胞身份维持方面发挥重要的作用。为了探究CHR16的其它生物学功能,我们以拟南芥野生型Col-0、CHR16 T-DNA插入突变体chr16-1、chr16-2、chr16-3和chr16-4突变体为实验材料,通过表型分析、组织化学染色、酵母双杂交、qPCR、生理以及转录组等方法,对CHR16的生物学功能做了进一步研究,主要研究结果如下:1、通过表型分析、三引物法纯杂合鉴定以及RT-PCR,我们发现chr16-1、chr16-2、chr16-3和chr16-...

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Abstract
缩略词表
第一章 前言
    1.1 染色质重塑复合体
        1.1.1 染色质的结构与功能
        1.1.2 染色质重塑复合体的结构
        1.1.3 ATP依赖的染色质重塑方式
        1.1.4 染色质重塑复合物的分类
        1.1.5 SNF2染色质重塑复合体
        1.1.6 Mot1染色质重塑复合体
    1.2 染色质重塑参与非生物胁迫的类型
        1.2.1 ABA和干旱胁迫
        1.2.2 盐胁迫
        1.2.3 高温胁迫
        1.2.4 DNA损伤胁迫
    1.3 植物对干旱胁迫的响应机制
    1.4 本研究的背景及意义
第二章 实验材料方法
    2.1 实验材料
    2.2 实验所用的仪器
    2.3 实验所用的药品和试剂
    2.4 实验方法
        2.4.1 种子春化与消毒
        2.4.2 植物DNA的提取
        2.4.3 GUS染色的方法
        2.4.4 大肠杆菌感受态的制备(SSCS法)
        2.4.5 质粒转化大肠杆菌的方法
        2.4.6 大肠杆菌质粒DNA的提取
        2.4.7 胶回收的方法
        2.4.8 转化农杆菌的方法
        2.4.9 酵母感受态的制备
        2.4.10 质粒载体转化酵母感受态的方法
        2.4.11 酵母质粒的提取
        2.4.12 酵母蛋白的提取(Takara)
        2.4.13 Western Blot
        2.4.14 酵母双杂交文库筛选
        2.4.15 植物总RNA的提取
        2.4.16 反转录(东洋纺)
        2.4.17 转化烟草的方法
        2.4.18 数据统计与分析软件
    2.5 实验所用到的引物
        2.5.1 纯杂合鉴定、克隆及测序引物
        2.5.2 RT-PCR及 qPCR引物
第三章 实验结果
    3.1 拟南芥chr16突变体表型分析
    3.2 CHR16的组织定位
    3.3 酵母双杂交筛选CHR16互作蛋白
    3.4 CHR16N蛋白相互作用的验证
    3.5 chr16-2 突变体对ABA更敏感
    3.6 chr16-2突变体耐旱性增强
    3.7 转录组分析
        3.7.1 取材方案
        3.7.2 RNA抽提、建库及分析流程
        3.7.3 转录组数据中差异表达基因的分组比较
        3.7.4 干旱胁迫条件下差异表达基因的表达模式
        3.7.5 干旱胁迫差异表达基因对关键通路的影响
第四章 讨论
    4.1 CHR16在拟南芥生长发育中的生物学作用
    4.2 CHR16蛋白的功能
    4.3 CHR16参与拟南芥干旱胁迫的响应
    4.4 CHR16参与拟南芥干旱胁迫响应可能的分子机制
    4.5 本课题的展望
参考文献
在学期间的研究成果
致谢



本文编号：3871871