小菜蛾气味结合蛋白基因的鉴定及其表达模式分析
发布时间:2025-03-20 05:51
灵敏的嗅觉系统在昆虫感知环境、定位寄主植物、躲避天敌和维持种群数量中起着重要的作用,对其生存繁衍具有重要的意义。气味结合蛋白(odorant binding proteins, OBPs)作为转运脂溶性气味化合物至嗅觉神经树突末端的载体,在昆虫与外界环境信息交流过程中起到了重要作用。小菜蛾是十字花科作物上极难防治的重要害虫,研究其气味结合蛋白可为阐明小菜蛾的嗅觉机制,从而制定科学的管理和有效的防治措施奠定基础。基于小菜蛾基因组与表达谱数据,本研究采用生物信息学方法与实时荧光定量PCR技术,对预测的小菜蛾气味结合蛋白基因进行了鉴定,并分析了该基因家族的基因结构和基因表达模式,具体研究及结果如下:1.基于小菜蛾基因组数据共预测出39个OBPs基因,分布在20条不同的Scaffold上。其中11个OBPs基因位于Scaffold174,4个OBPs基因位于Scaffold44;5条Scaffold分别含有2个OBPs基因;13条Scaffold分别只有1个OBPs基因。2.对小菜蛾OBPs基因序列进行分析,发现OBPs主要由120-180个氨基酸组成...
【文章页数】:58 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
1 前言
1.1 昆虫的嗅觉感受机制
1.2 昆虫气味结合蛋白
1.2.1 气味结合蛋白的种类
1.2.1.1 性信息素结合蛋白
1.2.1.2 普通气味结合蛋白
1.2.1.3 触角结合蛋白
1.2.2 气味结合蛋白的结构及其特性
1.2.3 气味结合蛋白的组织表达及其功能
1.3 小菜蛾气味结合蛋白的研究进展
1.3.1 小菜蛾概述
1.3.2 小菜蛾气味结合蛋白
1.4 本研究的意义
2 材料与方法
2.1 主要数据
2.1.1 小菜蛾基因组数据与表达谱数据
2.1.2 已知的气味结合蛋白基因
2.1.3 分析软件及工具
2.2 小菜蛾气味结合蛋白基因的预测
2.2.1 本地比对
2.2.2 OBPs基因全长的获得
2.3 小菜蛾气味结合蛋白的进化分析及基因结构
2.4 小菜蛾气味结合蛋白的表达模式分析
2.5 验证小菜蛾气味结合蛋白的表达模式
2.5.1 供试昆虫
2.5.2 试剂和仪器
2.5.3 小菜蛾组织的解剖
2.5.4 RNA的提取
2.5.5 RNA质量检测
2.5.6 cDNA的合成
2.5.7 实时荧光定量PCR
2.5.8 数据处理
3 结果与分析
3.1 小菜蛾气味结合蛋白基因的预测
3.2 小菜蛾气味结合蛋白的进化分析
3.2.1 小菜蛾气味结合蛋白的进化分析
3.2.2 比较小菜蛾与其他物种气味结合蛋白的进化
3.3 小菜蛾气味结合蛋白的表达模式分析
3.4 实时荧光定量PCR验证小菜蛾气味结合蛋白的表达模式
3.4.1 RNA提取质量
3.4.2 小菜蛾气味结合蛋白在不同发育阶段的表达情况
3.4.3 小菜蛾气味结合蛋白在不同组织的表达情况
3.5 寄主植物气味对小菜蛾气味结合蛋白基因表达的影响
4 结论与讨论
参考文献
致谢
本文编号:4037481
【文章页数】:58 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
1 前言
1.1 昆虫的嗅觉感受机制
1.2 昆虫气味结合蛋白
1.2.1 气味结合蛋白的种类
1.2.1.1 性信息素结合蛋白
1.2.1.2 普通气味结合蛋白
1.2.1.3 触角结合蛋白
1.2.2 气味结合蛋白的结构及其特性
1.2.3 气味结合蛋白的组织表达及其功能
1.3 小菜蛾气味结合蛋白的研究进展
1.3.1 小菜蛾概述
1.3.2 小菜蛾气味结合蛋白
1.4 本研究的意义
2 材料与方法
2.1 主要数据
2.1.1 小菜蛾基因组数据与表达谱数据
2.1.2 已知的气味结合蛋白基因
2.1.3 分析软件及工具
2.2 小菜蛾气味结合蛋白基因的预测
2.2.1 本地比对
2.2.2 OBPs基因全长的获得
2.3 小菜蛾气味结合蛋白的进化分析及基因结构
2.4 小菜蛾气味结合蛋白的表达模式分析
2.5 验证小菜蛾气味结合蛋白的表达模式
2.5.1 供试昆虫
2.5.2 试剂和仪器
2.5.3 小菜蛾组织的解剖
2.5.4 RNA的提取
2.5.5 RNA质量检测
2.5.6 cDNA的合成
2.5.7 实时荧光定量PCR
2.5.8 数据处理
3 结果与分析
3.1 小菜蛾气味结合蛋白基因的预测
3.2 小菜蛾气味结合蛋白的进化分析
3.2.1 小菜蛾气味结合蛋白的进化分析
3.2.2 比较小菜蛾与其他物种气味结合蛋白的进化
3.3 小菜蛾气味结合蛋白的表达模式分析
3.4 实时荧光定量PCR验证小菜蛾气味结合蛋白的表达模式
3.4.1 RNA提取质量
3.4.2 小菜蛾气味结合蛋白在不同发育阶段的表达情况
3.4.3 小菜蛾气味结合蛋白在不同组织的表达情况
3.5 寄主植物气味对小菜蛾气味结合蛋白基因表达的影响
4 结论与讨论
参考文献
致谢
本文编号:4037481
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