青藏高原棘球属绦虫基因多态性研究

发布时间：2017-12-19 13:14

  本文关键词：青藏高原棘球属绦虫基因多态性研究　出处：《青海大学》2017年硕士论文　论文类型：学位论文

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【摘要】：【目的】本研究拟以青藏高原棘球蚴病和棘球属绦虫为研究对象,运用线粒体细胞色素C氧化酶亚单位Ⅰ基因(COX1)和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(脱氢酶亚单位Ⅰ基因(NAD1))对收集的青藏高原包虫病患者感染的棘球属绦虫进行基因多态性研究,明确检测到棘球属绦虫的基因型及其株内遗传变异,构建系统发育树,掌握青藏高原流行的棘球属绦虫种类数目及基因序列多态性,指导临床诊断和治疗,为棘球蚴病的预防控制提供理论上的指导。【方法】对收集的172例棘球蚴病患者的包囊,分离纯化包囊,提取DNA,选择线粒体DNA的COX1基因、NAD1基因,设计特异性引物,PCR扩增,PCR产物测序,通过生物信息学软件,分析青藏高原棘球属绦虫的流行株基因型及基因的多态性,利用各个基因构建系统进化树,研究棘球属绦虫的基因序列多样性和遗传进化特征。【结果】本论文得到的研究结果如下:通过分子生物学方法鉴定所分离出的包囊,均为G1型,表明青藏高原棘球属绦虫流行株为细粒棘球绦虫(G1型)。所测定的G1型棘球蚴绦虫COX1基因序列和NAD1基因序列长度分别为1674bp和894bp。通过对分离株标本提取DNA并扩增NAD1和COX1基因序列分析,发现青藏高原主要棘球属绦虫的优势株为G1型,NAD1基因存在14个各不同的序列,20个突变位点,占分析位点数的2.2%,COX1基因存在18个各不同的序列,45个突变位点,占分析位点数的2.8%。碱基的变化为转换和颠换,且转换明显多于颠换。在对172例分离株成功扩增的基因序列分析中发现基因序列没有明显差异。通过对扩增出的136条基因序列进行同源性分析,均与Genbank中检索到的普通羊株(AF297617)NAD1基因序列同源性达98.88%以上,COX1基因序列同源性达99.82%以上。对青藏高原各个G1型棘球属绦虫分离株NAD1和COX1基因单倍型分析,核苷酸序列差异较小。136株G1型细粒棘球蚴共有14个不同的基因型单倍型。NAD1基因的核苷酸序列在117位点发生了T与C置换,COX1基因的核苷酸序列在426、429、456位点发生了T与C置换,是流行于青藏高原最主要的G1型细粒棘球绦虫单倍体。【结论】青藏高原主要棘球属绦虫的优势株为细粒棘球绦虫G1型,且COX1基因相对于NAD1基因有较为丰富的单倍型多态性。COX1基因和NAD1基因证实青藏高原G1型棘球属绦虫核苷酸序列相互间差异较小。上述研究结果为进一步开展棘球属绦虫分子流行病学调查积累了数据,也为青藏高原包虫病的防治提供了参考。
【学位授予单位】：青海大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2017
【分类号】：R532.32

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本文编号：1308090