miR-155-5p及其靶基因IGF2对肾母细胞瘤细胞生物学行为的影响

发布时间：2020-12-08 01:47

　　目的:探讨miR-155-5p在肾母细胞瘤中的表达及其靶向调控IGF2通过PI3K信号通路对肾母细胞瘤细胞生物学行为的影响及作用机制。方法:1.临床样本分析:（1）分别利用miRNA芯片技术及转录组测序技术检测4例肾母细胞瘤患者血液样本中miRNA的表达以及8例患儿肿瘤和对应瘤旁组织中mRNA的表达;（2）收集87例肾母细胞瘤患儿肿瘤组织及其对应的瘤旁组织,采用RT-qPCR验证miR-155-5p及IGF2表达差异,利用WB和免疫组化实验检测IGF2、PI3K、AKT和mTOR蛋白的表达水平;（3）结合临床资料分析miR-155-5p和IGF2表达量与患者临床病理特征的相关性。2.生物信息学分析:（1）下载GEO和TARGET数据库中肾母细胞瘤组织mRNA及miRNA芯片数据,利用R语言筛选差异mRNA和miRNA;（2）利用TargetScan、miRWalk、mirBridge、miRDB、miRNAMap、PicTar等在线预测网站预测差异miRNAs的靶向mRNA基因;（3）KEGG富集差异miRNAs靶基因相关的信号通路及疾病类型,GO注释和KEGG富集差异mRNAs的功能... 

【文章来源】：重庆医科大学重庆市

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GEO数据库中肾母细胞瘤的差异miRNAA：GSE57370热图；B：GSE61741热图

重庆医科大学硕士研究生学位论文28图1.1GEO数据库中肾母细胞瘤的差异miRNAA：GSE57370热图；B：GSE61741热图Fig.1.1DE-miRNAsinWTbyGEOdatabaseHeatmapsofthetop50DEmiRNAsintheWTgeneexpressiondatasetsA.GSE57370andB.GSE617412.1.2肾母细胞瘤患儿血液中差异miRNAs的检测采用miRNA芯片技术检测肾母细胞瘤患儿血液中miRNA表达情况，结果发现24个miRNA表达上调，81个miRNA表达下调（图1.2）。图1.2肾母细胞瘤患儿血液中的差异miRNA

重庆医科大学硕士研究生学位论文29A：芯片热图；B：芯片圈图Fig.1.2DE-miRNAsinWTbymiRNAmicroarraymiRNAmicroarrayofdifferentialmiRNAlevelsinWTbloodsamplesrepresentedbyA.heatmapandB.circosplot2.1.3差异miRNAs靶基因富集的通路与疾病利用生物信息学技术分析差异miRNA的靶基因发现，靶基因主要富集在PI3KAKT信号通路、Hippo通路、mTOR通路以及胰岛素信号通路等，而富集的疾病主要包括神经系统疾并肌肉骨骼系统疾并先天性疾病及肿瘤等（图1.3）。图1.3差异miRNA靶基因富集的通路与疾病A：信号通路富集；B：疾病富集Fig.1.3TargetsofDE-miRNAsparticipateinthesignalingpathwayanddiseasetypesaccordingtotheKEGGenrichmentanalysisA.KEGGenrichmentpathwayandB.disease


本文编号：2904239