尿路致病性大肠埃希菌多聚磷酸盐激酶1抑制剂的筛选及其生物学效果检测
发布时间:2021-02-21 15:00
研究背景与目的:尿路感染(Urinary tract infections,UTIs)是临床上最常见的感染性疾病之一,多见于妇女、老年人和儿童。随着耐药菌株在全球的传播,UTIs的治疗成为临床一项严峻的挑战。虽然革兰阳性和革兰阴性细菌均可引起UTIs,但95%的社区获得性UTIs是由尿路致病性大肠埃希菌(Uropathogenic Escherichia coli,UPEC)引起的。药敏试验表明,UPEC对常规抗生素的耐药率非常高,甚至已突破最后一道防线(如多粘菌素)。因此,迫切需要开发新型抗生素或方法来对抗UPEC。大多数常规抗生素影响细菌的生命结构合成。例如,甲氧西林和万古霉素靶向细菌细胞壁合成,多粘菌素靶向细胞膜,喹诺酮类抑制细菌生长过程中的关键酶。也有学者认为,抑制细菌毒力而不是杀死病原体可能是治疗细菌感染的另一种策略。多磷酸盐激酶1(Polyphosphate kinase 1,PPK1)是多种细菌病原体中的一种重要激酶,负责多聚磷酸盐(Polyphosphate,Poly P)合成并参与ATP代谢。研究表明,PPK1与细菌的运动性、生物膜形成、群体感应和毒力因子的表达密切相...
【文章来源】:广州医科大学广东省
【文章页数】:57 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
大肠埃希菌注:A:大肠埃希菌PPK1结构示意图
PPK1蛋白与化合物8/17结合的Biacore传感图
实验结果233.分子对接研究为了更好地了解化合物8和17与PPK1的相互作用,使用DiscoveryStudio进行了分子对接研究。如图4A所示,化合物8的最高得分姿势显示在分子的硝基和PPK1的氨基酸残基Asn459/Asn461之间存在两个氢键。预测到化合物8的硝基和PPK1的Asp407之间会产生有吸引力的电荷相互作用。另外,化合物8的苯并咪唑和苯环与PPK1侧链的Arg375,Arg405,Tyr468和His592之间建立了疏水相互作用。而化合物17与PPK1的Trp14,Glu48,Arg53和Arg375建立了五个常规氢键。发现PPK1的Arg53通过两个卤素键与化合物17的三氟甲基相互作用。此外,在化合物17与PPK1侧链的Trp14,Phe17,Arg375和Tyr468之间可以发现许多疏水相互作用(图4B)。图4PPK1蛋白与化合物8/17的分子对接图注:A:化合物8与PPK1蛋白的分子对接图;B:化合物17与PPK1蛋白的分子对接图。4.化合物8和17对PPK1酶活性的影响为了研究化合物8和17是否可以影响PPK1的酶活性,在酶反应体系中加入不同浓度的化合物8或17孵育,将不加化合物的酶反应体系作为对照组,将加了DMSO的酶反应体系作为溶剂对照组。结果如图5所示,DMSO溶剂对照组的酶活性是对照组的(0.94±0.02)%,差异无统计学意义(P>0.05),说明DMSO对PPK1酶活性没有明显影响。与对照组相比,当化合物8浓度为5μM、20μM、80μM、320μM时,酶活性分别是对照组的(0.71±0.04)%、(0.65±0.04)%、(0.64±0.04)%、(0.60±0.06)%,差异有统计学意义(P<0.01,
【参考文献】:
期刊论文
[1]脑膜炎大肠杆菌K1株ppk1基因致病机制初探[J]. 彭亮,赵铁,罗文英,付美芹,曹虹,黄胜和. 微生物学通报. 2012(02)
[2]血管紧张素转化酶抑制剂体外活性检测方法的改进及应用[J]. 蒋菁莉,任发政,诸晓强. 中国乳品工业. 2006(07)
[3]尿路致病性大肠杆菌ppk1基因缺失株的构建及其生物学特性研究[J]. 罗苏,彭亮,潘嘉韵,吴晓蔓. 中华微生物学和免疫学杂志. 2013 (07)
本文编号:3044516
【文章来源】:广州医科大学广东省
【文章页数】:57 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
大肠埃希菌注:A:大肠埃希菌PPK1结构示意图
PPK1蛋白与化合物8/17结合的Biacore传感图
实验结果233.分子对接研究为了更好地了解化合物8和17与PPK1的相互作用,使用DiscoveryStudio进行了分子对接研究。如图4A所示,化合物8的最高得分姿势显示在分子的硝基和PPK1的氨基酸残基Asn459/Asn461之间存在两个氢键。预测到化合物8的硝基和PPK1的Asp407之间会产生有吸引力的电荷相互作用。另外,化合物8的苯并咪唑和苯环与PPK1侧链的Arg375,Arg405,Tyr468和His592之间建立了疏水相互作用。而化合物17与PPK1的Trp14,Glu48,Arg53和Arg375建立了五个常规氢键。发现PPK1的Arg53通过两个卤素键与化合物17的三氟甲基相互作用。此外,在化合物17与PPK1侧链的Trp14,Phe17,Arg375和Tyr468之间可以发现许多疏水相互作用(图4B)。图4PPK1蛋白与化合物8/17的分子对接图注:A:化合物8与PPK1蛋白的分子对接图;B:化合物17与PPK1蛋白的分子对接图。4.化合物8和17对PPK1酶活性的影响为了研究化合物8和17是否可以影响PPK1的酶活性,在酶反应体系中加入不同浓度的化合物8或17孵育,将不加化合物的酶反应体系作为对照组,将加了DMSO的酶反应体系作为溶剂对照组。结果如图5所示,DMSO溶剂对照组的酶活性是对照组的(0.94±0.02)%,差异无统计学意义(P>0.05),说明DMSO对PPK1酶活性没有明显影响。与对照组相比,当化合物8浓度为5μM、20μM、80μM、320μM时,酶活性分别是对照组的(0.71±0.04)%、(0.65±0.04)%、(0.64±0.04)%、(0.60±0.06)%,差异有统计学意义(P<0.01,
【参考文献】:
期刊论文
[1]脑膜炎大肠杆菌K1株ppk1基因致病机制初探[J]. 彭亮,赵铁,罗文英,付美芹,曹虹,黄胜和. 微生物学通报. 2012(02)
[2]血管紧张素转化酶抑制剂体外活性检测方法的改进及应用[J]. 蒋菁莉,任发政,诸晓强. 中国乳品工业. 2006(07)
[3]尿路致病性大肠杆菌ppk1基因缺失株的构建及其生物学特性研究[J]. 罗苏,彭亮,潘嘉韵,吴晓蔓. 中华微生物学和免疫学杂志. 2013 (07)
本文编号:3044516
本文链接:https://www.wllwen.com/shoufeilunwen/mpalunwen/3044516.html
最近更新
教材专著