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膀胱癌关键基因筛选以及与临床特征的相关分析

发布时间:2021-07-14 14:07
  目的:在泌尿外科疾病中,膀胱癌十分常见。近年来,我国膀胱癌的发病率有所上升,尽管采取了许多积极的治疗措施,但晚期或转移性膀胱癌患者的生存状况仍然很差,同时膀胱癌患者的预后监测也是疾病管理中的一大难题,所以寻找可靠的分子标志物进行早期诊断和预后监测成为一个研究的热点问题。本研究通过比较GEO数据库中膀胱癌和正常组织的基因表达,筛选出与膀胱癌发生、发展高度相关的基因,进一步分析基因表达水平与各种临床资料参数和预后之间的关系,并探讨这些基因的分子机制。为寻找膀胱癌潜在的分子诊断标志物和精准的靶向治疗提供一定的科学依据。方法:GEO数据库中检索关键词“bladder cancer”,下载膀胱癌基因芯片数据,采用GEO数据库的在线分析工具GEO2R筛选差异表达基因,对筛选出的差异基因进行GO和KEEG富集分析,研究其分子功能及信号通路。应用String在线工具构建蛋白—蛋白相互作用网络,下载Cytoscape软件,应用软件中的MCODE插件分析蛋白相互作用网络中的关键基因。在GEPIA网站中分析关键基因与预后的关系,应用SPSS25.0软件的卡方检验分析关键(Hub)基因的表达水平与病理级别、年... 

【文章来源】:山西医科大学山西省

【文章页数】:39 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

膀胱癌关键基因筛选以及与临床特征的相关分析


共表达基因

基因,膀胱癌,蓝色,红色


山西医科大学(博)硕士学位论文8图2膀胱癌关键基因的蛋白互作网络红色:表达上调基因蓝色:表达下调基因2.4关键基因的预后生存分析通过GEPIA网站分析22个核心基因与膀胱癌患者预后的关系,结果显示STON1、SDPR、APOD、DCN基因高表达组的中位生存时间明显低于低表达组(p<0.05),TK1、COL16A1、MS4A6、CCNB2、KIF2等基因高表达组与低表达组之间中位生存时间相比无统计学意义(P>0.05)。以上结果表明STON1、SDPR、APOD、DCN基因的表达水平与患者总生存期明显相关(P<0.05),基因的高表达不利于患者的预后生存(图3-6)。

【参考文献】:
期刊论文
[1]不同侵袭性膀胱癌患者预后与基因差异表达研究[J]. 韩耕宇,李华福,许宸,谢群.  转化医学电子杂志. 2018(11)



本文编号:3284292

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