Nek2B和β-catenin在三阴性乳腺癌中的表达及意义
发布时间:2021-09-18 12:07
目的:三阴性乳腺癌(Triple negative breast cancer,TNBC)为乳腺癌中分子机制最复杂的分子亚型,其不表达其他三种乳腺癌分子分型中的任何靶向基因,因此备受关注。TNBC在乳腺癌中占10-20%,其中多为年轻女性,转移率高、组织学分级高、易复发。TNBC的疾病机制仍未明确,临床诊治困难,本课题旨在:1、通过生物信息学方法筛选TNBC与正常乳腺组织差异表达的基因,分析其集中发挥的生物学功能,定位富集的细胞成分以及主要参与的信号通路,预测可能与TNBC预后相关基因,并分析有意义的差异表达基因在乳腺癌组织与细胞系中的表达,从而确定可能在TNBC中影响其发生发展的核心基因。2、通过观察关键基因Nek2和β-catenin在TNBC肿瘤组织与细胞系中的表达,并分析其与TNBC患者临床特征之间的关系,由此为TNBC临床诊断挖掘新的理论依据及提供可靠的生物标记物。方法:1、生物信息学分析TNBC发生发展相关的基因(1)筛选TNBC与非TNBC的肿瘤组织、正常乳腺基因芯片中的差异表达基因(1)从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中挑选GSE3895...
【文章来源】:山西医科大学山西省
【文章页数】:65 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
GSE38959(A)与GSE27447(B)差异表达基因
DEG的基因本体GO分析
7山西医科大学硕士学位论文2.2.2KEGG/生物途径分析信号通路分析显示,细胞周期/有丝分裂、DNA复制、有丝分裂M--M/G1期和M期是上调的DEG参与的信号通路(图1-3A)。脑实质到上皮的转化是所有下调的DEG参与的信号通路(图1-3B)。图1-3:DEG的KEGG/生物途径分析2.3共同差异表达基因为了筛选两个基因芯片中共同差异表达基因,对2个数据集的差异表达基因制作维恩图,蓝色代表GSE2447数据集中所有差异基因,黄代表GSE38959数据集中所有差异基因,灰黄色代表二者相交集的基因数。得到Nek2、THSD4、ESR1、TFF1、AGR3、RNF128、FOXA1、WIF1、PRR15、AZGP1、PMCHL1、LAMP3、ANKRD30A共13个共同差异表达基因(图1-4)。图1-4:共同差异表达基因维恩图AB
本文编号:3400110
【文章来源】:山西医科大学山西省
【文章页数】:65 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
GSE38959(A)与GSE27447(B)差异表达基因
DEG的基因本体GO分析
7山西医科大学硕士学位论文2.2.2KEGG/生物途径分析信号通路分析显示,细胞周期/有丝分裂、DNA复制、有丝分裂M--M/G1期和M期是上调的DEG参与的信号通路(图1-3A)。脑实质到上皮的转化是所有下调的DEG参与的信号通路(图1-3B)。图1-3:DEG的KEGG/生物途径分析2.3共同差异表达基因为了筛选两个基因芯片中共同差异表达基因,对2个数据集的差异表达基因制作维恩图,蓝色代表GSE2447数据集中所有差异基因,黄代表GSE38959数据集中所有差异基因,灰黄色代表二者相交集的基因数。得到Nek2、THSD4、ESR1、TFF1、AGR3、RNF128、FOXA1、WIF1、PRR15、AZGP1、PMCHL1、LAMP3、ANKRD30A共13个共同差异表达基因(图1-4)。图1-4:共同差异表达基因维恩图AB
本文编号:3400110
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