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基因表达分析揭示TGFB1I1诱导的EMT途径促进星形细胞瘤恶性进展

发布时间:2017-05-27 06:12

  本文关键词:基因表达分析揭示TGFB1I1诱导的EMT途径促进星形细胞瘤恶性进展,由笔耕文化传播整理发布。


【摘要】:星形细胞瘤恶性转化包括肿瘤级别的进展和亚型的转化。目前已明确的星形细胞瘤分子标记物与星形细胞瘤的恶性进展并没有明显的相关性(如IDH1、TP53突变等)。为了寻找新的星形细胞瘤分子标记物,我们收集了252例样本:包括34例正常脑组织(NBT),136例II级星形细胞瘤(AII)和82例III级星形细胞瘤(AIII),每例样本都检测了mRNA的表达谱。生物信息学分析结果显示,17个随着肿瘤级别进展而表达升高的基因主要富集于EMT相关的信号通路。我们进一步用128例胶质瘤样本的RNA测序数据进行了验证。通过生存分析显示,这些基因的高表达患者具有较差的预后。我们进一步研究了TGFB1I1(转化生长因子β1诱导转录因子1),这一基因的表达与WHO胶质瘤分级密切相关,进一步通过实时荧光定量PCR对六个不同级别的胶质瘤细胞系及49个独立样本进行了验证,结果发现高表达TGFB1I1与胶质瘤亚型及EMT过程的激活密切相关。通过免疫组化进一步证实了这一结论。体内和体外实验使用TGF-β1和TGFB1I1 shRNA进一步证实,TGFB1I1是TGF-β激活EMT过程所必须的分子,这一过程可以促进星形细胞瘤的恶性进展。
【关键词】:胶质瘤 星形细胞瘤 TGFB1I1 恶性进展
【学位授予单位】:大连医科大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2015
【分类号】:R739.4
【目录】:
  • 中文摘要7
  • 英文摘要7-8
  • (一)前言8-9
  • (二)材料和方法9-18
  • 1. 材料9-11
  • 1.1 临床样本9-10
  • 1.2 细胞系和试剂10
  • 1.3 主要仪器10-11
  • 2. 方法11-18
  • 2.1 细胞培养11
  • 2.2 细胞转染11-12
  • 2.3 总RNA提取及实时荧光定量PCR检测基因表达水平变化12-14
  • 2.4 细胞划痕实验14
  • 2.5 Transwell细胞侵袭实验14-15
  • 2.6 蛋白质提取与检测15-17
  • 2.7 体内实验17-18
  • 2.8 统计学处理18
  • (三)结果18-26
  • 1. 现有分子标记物与级别进展无相关性18-19
  • 2. 在星形胶质细胞瘤级别进展过程中有统计学意义改变的基因19-21
  • 3. 恶性进展过程中的驱动基因与患者预后具有相关性21
  • 4. RNA测序及qPCR验证差异基因21-22
  • 5. 蛋白水平及转录水平验证TGFB1I1与级别进展有相关性22-24
  • 6. TFGB1I1参与TGF-β相关EMT发生过程24-26
  • (四)讨论26-28
  • (五)结论28
  • (六)参考文献28-33
  • 综述33-40
  • 参考文献36-40
  • 致谢40-41

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本文编号:399063

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