普通小麦灌浆期转录因子GPC-1与GPC-2的表达模式及旗叶的转录组分析
发布时间：2023-05-10 03:21
Gpc-1(Grain protein content)(NAM-A1、NAM-B1、NAM-D1)及Gpc-2(NAM-B2、NAM-D2)是植物所特有的NAM(No apical meristem)转录因子家族的成员。前人对NAM-B1及其同源基因(NAM-A1、NAM-B2、NAM-D1、NAM-D2)的研究表明这些基因的大量表达能促进小麦(Triticum aestivum L.)及其近缘属中营养组织的衰老及其中矿物元素向籽粒的转运,因此对小麦营养品质的改良具有重要的潜力。目前对Gpc-1及Gpc-2已开展了大量的研究工作。不仅研究了部分Gpc-1及Gpc-2基因的功能,同时还对其可能参与的调控路径进行了初步的探索。尽管如此,对Gpc-1与Gpc-2协调衰老及物质转运的方式及与其具有直接作用的基因还知之甚少。对这些基因的挖掘无疑将有助于对Gpc-1及Gpc-2调控方式的抽丝剥茧,使它们能在小麦营养品质的育种中得到有效地利用。本文通过同源克隆及序列分析确定了中国春中Gpc-1与Gpc-2的组成及核酸序列特征,并利用酵母单杂交技术分析了各基因的转录活性;运用ge Norm Plus...
【文章页数】：155 页
【学位级别】：博士
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文献综述
1.1 矿物元素的简介
1.1.1 人体中矿物元素的重要作用
1.1.2 全球矿物元素缺乏的现状
1.2 矿物元素缺乏的原因
1.2.1 影响矿物元素在作物中积累的因素
1.2.2 土壤中矿物元素的可利用性
1.2.3 作物吸收矿物元素的途径及限制因素
1.3 衰老及衰老的调控
1.3.1 转录水平的调控
1.3.2 染色质结构重塑介导的调控
1.3.3 转录后调控
1.3.4 翻译水平的调控
1.3.5 翻译后调控
1.4 NAC转录因子
1.4.1 NAC转录因子的结构及功能
1.4.2 NAM转录因子
1.5 研究设想
第二章 GPC-1 与GPC-2 的克隆及转录活性的研究
2.1 材料和方法
2.1.1 材料
2.1.2 实验方法
2.2 结果与分析
2.2.1 中国春Gpc-1 及Gpc-2 的序列特征
2.2.2 Gpc-1 及Gpc-2 转录活性的分析
2.3 小结与讨论
2.3.1 小结
2.3.2 讨论
第三章 灌浆期最适内参基因的筛选
3.1 材料与方法
3.1.1 材料
3.1.2 实验方法
3.2 结果与分析
3.2.1 灌浆期内参基因的筛选
3.2.2 最佳内参基因的评估
3.3 小结与讨论
3.3.1 小结
3.3.2 讨论
第四章 灌浆期Gpc-1 及Gpc-2 的时空表达特征
4.1 材料与方法
4.1.1 材料
4.1.2 实验方法
4.2 结果与分析
4.2.1 灌浆期Gpc-1 及Gpc-2 的时间表达动态
4.2.2 灌浆期Gpc-1 及Gpc-2 的组织表达特异性
4.3 小结与讨论
4.3.1 小结
4.3.2 讨论
第五章 灌浆期旗叶的转录组及Gpc-1、Gpc-2 作用基因的分析
5.1 材料与方法
5.1.1 材料
5.1.2 实验方法
5.2 结果与分析
5.2.1 测序及比对数据的统计
5.2.2 差异表达基因的统计
5.2.3 差异表达基因的GO注释及富集分析
5.2.4 差异表达基因的KEGG通路及富集分析
5.2.5 差异表达基因的表达模式分析
5.2.6 衰老相关基因的鉴定
5.2.7 铁、锌转运蛋白及其辅助因子的表达分析
5.2.8 转录因子的表达分析
5.2.9 激素相关基因的表达分析
5.2.10 Gpc-1 及Gpc-2 作用基因的分析
5.3 讨论
5.3.1 花后30天旗叶的生理活动
5.3.2 籽粒的发育与旗叶的代谢
5.3.3 转录因子与旗叶的衰老
5.3.4 激素与旗叶的衰老
5.3.5 Gpc-1 及Gpc-2 作用的基因
参考文献
附录
致谢
作者简介
本文编号：3812927
【文章页数】：155 页
【学位级别】：博士
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文献综述
1.1 矿物元素的简介
1.1.1 人体中矿物元素的重要作用
1.1.2 全球矿物元素缺乏的现状
1.2 矿物元素缺乏的原因
1.2.1 影响矿物元素在作物中积累的因素
1.2.2 土壤中矿物元素的可利用性
1.2.3 作物吸收矿物元素的途径及限制因素
1.3 衰老及衰老的调控
1.3.1 转录水平的调控
1.3.2 染色质结构重塑介导的调控
1.3.3 转录后调控
1.3.4 翻译水平的调控
1.3.5 翻译后调控
1.4 NAC转录因子
1.4.1 NAC转录因子的结构及功能
1.4.2 NAM转录因子
1.5 研究设想
第二章 GPC-1 与GPC-2 的克隆及转录活性的研究
2.1 材料和方法
2.1.1 材料
2.1.2 实验方法
2.2 结果与分析
2.2.1 中国春Gpc-1 及Gpc-2 的序列特征
2.2.2 Gpc-1 及Gpc-2 转录活性的分析
2.3 小结与讨论
2.3.1 小结
2.3.2 讨论
第三章 灌浆期最适内参基因的筛选
3.1 材料与方法
3.1.1 材料
3.1.2 实验方法
3.2 结果与分析
3.2.1 灌浆期内参基因的筛选
3.2.2 最佳内参基因的评估
3.3 小结与讨论
3.3.1 小结
3.3.2 讨论
第四章 灌浆期Gpc-1 及Gpc-2 的时空表达特征
4.1 材料与方法
4.1.1 材料
4.1.2 实验方法
4.2 结果与分析
4.2.1 灌浆期Gpc-1 及Gpc-2 的时间表达动态
4.2.2 灌浆期Gpc-1 及Gpc-2 的组织表达特异性
4.3 小结与讨论
4.3.1 小结
4.3.2 讨论
第五章 灌浆期旗叶的转录组及Gpc-1、Gpc-2 作用基因的分析
5.1 材料与方法
5.1.1 材料
5.1.2 实验方法
5.2 结果与分析
5.2.1 测序及比对数据的统计
5.2.2 差异表达基因的统计
5.2.3 差异表达基因的GO注释及富集分析
5.2.4 差异表达基因的KEGG通路及富集分析
5.2.5 差异表达基因的表达模式分析
5.2.6 衰老相关基因的鉴定
5.2.7 铁、锌转运蛋白及其辅助因子的表达分析
5.2.8 转录因子的表达分析
5.2.9 激素相关基因的表达分析
5.2.10 Gpc-1 及Gpc-2 作用基因的分析
5.3 讨论
5.3.1 花后30天旗叶的生理活动
5.3.2 籽粒的发育与旗叶的代谢
5.3.3 转录因子与旗叶的衰老
5.3.4 激素与旗叶的衰老
5.3.5 Gpc-1 及Gpc-2 作用的基因
参考文献
附录
致谢
作者简介
本文编号：3812927
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