基于生物信息学和分子对接技术所筛选出的ENMD-2076药物对胶质母细胞瘤的治疗效果及其机制的研究

发布时间：2020-12-13 17:44

　　脑胶质瘤（glioma）是成人中枢神经系统最常见的原发恶性颅内肿瘤之一,占到了脑部肿瘤的30%⁴0%,具有极高的侵袭浸润性,因此世界卫生组织将大部分胶质瘤级别定位为III^IV级恶性肿瘤,其凶险程度极高。尽管其治疗已经从单一的手术治疗发展为手术、放疗及化疗的综合治疗,但是其患者的预后依然不令人满意。近年来生物信息学技术的发展使我们能够在分子以及基因水平上认识胶质母细胞瘤的发生、发展及转移,生物信息学研究帮助研究者以系统、准确、有效的方式揭示了胶质母细胞瘤的治疗性分子靶点,阐明了肿瘤发生发展及转移的理论基础,这使得研究胶质母细胞瘤的遗传改变和分子机制成为了可能。在生物信息学分析的辅助下,研究人员可以探索核心驱动基因诱发胶质母细胞瘤的分子机制,并从疾病相关基因簇中发掘新型的诊断性生物标记或治疗靶点。基因本体论（GO）分析是一种研究基因的生物过程、分子功能和细胞成分的方法,通过GO富集分析可以明确胶质母细胞瘤中异常表达和调节的生物学功能、细胞信号通路以及细胞定位。另外,京都基因与基因组百科全书（KEGG）为生物学细胞信号通路提供分析,能够帮助我们找到... 

【文章来源】：吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：107 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

PI3K、AURKA信号通路图解

GSE42656数据集检测出总共1744个差异表达基因,其中699个基因上调,1045个基因下调;GSE50161数据集中共检测418个差异表达基因,其中103个基因上调,315个基因下调;GSE86574数据集共检测出1088个差异表达基因,其中307个基因上调,781个基因下调。我们通过韦恩图分析,共鉴别出162个相互作用的差异表达基因,由48个上调基因和115个下调基因组成。韦恩图分析见(图2.1)。2.3.2 差异表达基因的功能和通路富集分析

分别将三个微阵列芯片数据中相互作用的共同上调或下调的基因导入DAVID数据库以获得GO,KEGG和GSEA分析的结果。在胶质瘤中有多种细胞功能和信号通路受到了影响,GO分析结果(表2.1、图2.2)表明,共同上调的差异表达基因主要富集于神经元细胞有丝分裂的核分裂、细胞分裂以及有丝分裂细胞周期的过渡等生物过程;参与蛋白质结合、三磷酸腺苷结合和微管运动等分子功能;在主轴、微管和染色体着丝粒区域发挥作用。对共同下调的差异表达基因,GO分析结果主要富集在细胞功能的改变上,比如化学突触传递、神经递质分泌以及神经递质传递的改变等。此外,根据KEGG分析结果,上调基因主要促进卵母细胞减数分裂、细胞周期、p53信号通路、黄体酮介导卵母细胞成熟、病毒致癌作用等信号通路的功能。同时,GSEA的分析结果(图2.3)表明,细胞周期和卵母细胞减数分裂两个信号通路发生了显著上调,这两个显著改变的细胞信号通路对胶质瘤的发生发展产生重要影响。

【参考文献】：
期刊论文
[1]Effect of NDC80 in human hepatocellular carcinoma[J]. Lin-Ling Ju,Lin Chen,Jun-Hong Li,Yi-Fan Wang,Ru-Jian Lu,Zhao-Lian Bian,Jian-Guo Shao.  World Journal of Gastroenterology. 2017(20)



本文编号：2914926