Sp1通过miRNA-130a-3p调控胶质瘤细胞增殖、迁移及TMZ耐药的研究
发布时间：2021-01-21 21:41
背景及目的:神经胶质瘤（glioma）是中枢神经系统的第一大肿瘤,是最具侵袭性的原发性颅内肿瘤,发病率高且致死率位于颅内肿瘤榜首,且放化疗预后效果不明显。近几年伴随着分子靶向治疗的不断发展,在细胞分子水平治疗恶性肿瘤已成为研究的热点和难点。转录因子特化蛋白1（Specificity protein 1）是Sp家族成员之一,调控多种基因转录过程。Sp1基因在许多癌症中高表达,参与肿瘤的发生发展并与不良预后有关,是极具潜力的肿瘤早期诊断标志物及治疗靶点。然而Sp1在胶质瘤中的表达及调控方式尚不清楚。因此,本研究旨在通过一系列分子生物学及细胞功能实验检测Sp1在胶质瘤中的表达方式。通过生物信息学、基因沉默、过表达、双荧光素酶报告系统等技术寻找调控Sp1表达的miRNA。探索Sp1参与胶质瘤成瘤的分子机制,为Sp1成为胶质瘤的早期诊断分子标志物提供证据。方法:首先,通过分析TCGA、CGGA等公共数据集中胶质瘤基因表达谱,探索Sp1在不同级别脑胶质瘤中的表达情况以及Sp1与胶质瘤患者预后的关系。通过荧光定量PCR及Western blot技术比较Sp1在胶质瘤细胞及HA1800正常胶质细胞中表...
【文章来源】：吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：93 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
技术路线图
为了检测Sp1基因在脑胶质瘤的表达情况,我们借助GEPIA平台对TCGA(The Cancer Genome Atlas)数据集的胶质瘤基因表达谱进行分析。如图2.1 A所示,低级别胶质瘤组织LGG(Low-grade glioma,518例)和胶质母细胞瘤组织GBM(glioblastoma multiforme,153例)中Sp1表达均高于正常脑组织(207例)。然而,Sp1表达水平在LGG与HGG之间差异不明显。为了进一步分析Sp1表达与胶质瘤病理级别的关系,我们对CGGA(The Chinese Glioma Genome Atlas,中国脑胶质瘤基因组图谱)公共数据集CGGA1及CGGA2进行分析。将CGGA1数据集301例样本去除无意义数据后按照WHO标准分为病理II期(包括A,O,OA)病理III期(包括AA,AO,AOA,)及病理IV期(GBM)。如图2.1 B所示,Sp1在三个级别的胶质瘤组织中表达没有显著性差异。虽然CGGA1数据集中Sp1的表达量在WHO IV中表达量高于WHO II和WHO III级,但WHO II和WHO III之间差别不明显。以上结果表明,Sp1在胶质瘤组织中高表达,但与胶质瘤的病理级别无明显相关性。2.2.2 Sp1 的表达与胶质瘤患者预后的相关性分析
我们以Sp1表达水平中位数(Median)为标准,首先将低级别胶质瘤患者分为Sp1高表达组和低表达组。GEPIA平台分析Sp1表达水平与LGG患者生存期的关系。如图2.2 A所示,Sp1低表达的LGG患者总生存期(Overall Survival,OS)及无疾病生存期(disease-free survival,DFS)较长。接下来,以Sp1表达水平中位数(Median)为标准将胶质母细胞瘤患者也分为Sp1高表达组和低表达组,但Sp1表达量与GBM患者的生存期无明显相关性(图2.2B)。另外,我们还通过R2基因组分析可视化平台(http://r2.amc.nl),依据IDH R132突变情况将French胶质瘤数据集中的患者分为IDH R132野生型(IDH R132 wildtype)及IDH R132基因突变型(IDH R132 mutant)(图2.2 C)。结果显示,两类胶质瘤患者中Sp1高表达的患者的预后较差。以上结果暗示,Sp1基因表达与胶质瘤患者的预后息息相关,Sp1低表达患者预后较好,特别是在低级别胶质瘤患者中更为显著。2.2.3 Sp1 在胶质瘤细胞及正常胶质细胞中表达差异分析
【参考文献】：
期刊论文
[1]MicroRNA在脑胶质瘤临床应用中的研究进展[J]. 朱如哲. 中国处方药. 2018(08)
[2]神经胶质瘤中microRNA的研究进展[J]. 沙力江·艾尔肯,蔡玲. 系统医学. 2018(08)
[3]胶质瘤相关分子标记物的研究进展[J]. 杨孝燕,王春红,胡昌辰,成睿,吉宏明. 中国药物与临床. 2018(03)
[4]Sp1和miR-92b在口腔癌组织中的表达及其意义[J]. 侯振伟,游珺,张风华. 解放军预防医学杂志. 2018(02)
[5]PI3K/Akt信号通路及SP1在VEGF上调胃癌细胞MRP1中的作用[J]. 李娟,许文林,冷加燕. 世界华人消化杂志. 2014(36)
[6]Sp3对β-catenin基因转录调控作用初探[J]. 黄兰姗,黄子凌,冯振博,陈罡,危丹明. 中国病理生理杂志. 2014(11)
[7]ERK1/2-Sp1信号通路对肺癌细胞VEGF的调控作用[J]. 梁璇,丁新民,霍艳英,潘兴斌,隋建丽,白贝,徐勤枝,周平坤. 癌变.畸变.突变. 2007(04)
博士论文
[1]长链非编码RNA-LINC01116在脑胶质瘤中的表达及其肿瘤生物学功能与机制的研究[D]. 叶晶亮.第二军医大学 2017
本文编号：2991941
【文章来源】：吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：93 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
技术路线图
为了检测Sp1基因在脑胶质瘤的表达情况,我们借助GEPIA平台对TCGA(The Cancer Genome Atlas)数据集的胶质瘤基因表达谱进行分析。如图2.1 A所示,低级别胶质瘤组织LGG(Low-grade glioma,518例)和胶质母细胞瘤组织GBM(glioblastoma multiforme,153例)中Sp1表达均高于正常脑组织(207例)。然而,Sp1表达水平在LGG与HGG之间差异不明显。为了进一步分析Sp1表达与胶质瘤病理级别的关系,我们对CGGA(The Chinese Glioma Genome Atlas,中国脑胶质瘤基因组图谱)公共数据集CGGA1及CGGA2进行分析。将CGGA1数据集301例样本去除无意义数据后按照WHO标准分为病理II期(包括A,O,OA)病理III期(包括AA,AO,AOA,)及病理IV期(GBM)。如图2.1 B所示,Sp1在三个级别的胶质瘤组织中表达没有显著性差异。虽然CGGA1数据集中Sp1的表达量在WHO IV中表达量高于WHO II和WHO III级,但WHO II和WHO III之间差别不明显。以上结果表明,Sp1在胶质瘤组织中高表达,但与胶质瘤的病理级别无明显相关性。2.2.2 Sp1 的表达与胶质瘤患者预后的相关性分析
我们以Sp1表达水平中位数(Median)为标准,首先将低级别胶质瘤患者分为Sp1高表达组和低表达组。GEPIA平台分析Sp1表达水平与LGG患者生存期的关系。如图2.2 A所示,Sp1低表达的LGG患者总生存期(Overall Survival,OS)及无疾病生存期(disease-free survival,DFS)较长。接下来,以Sp1表达水平中位数(Median)为标准将胶质母细胞瘤患者也分为Sp1高表达组和低表达组,但Sp1表达量与GBM患者的生存期无明显相关性(图2.2B)。另外,我们还通过R2基因组分析可视化平台(http://r2.amc.nl),依据IDH R132突变情况将French胶质瘤数据集中的患者分为IDH R132野生型(IDH R132 wildtype)及IDH R132基因突变型(IDH R132 mutant)(图2.2 C)。结果显示,两类胶质瘤患者中Sp1高表达的患者的预后较差。以上结果暗示,Sp1基因表达与胶质瘤患者的预后息息相关,Sp1低表达患者预后较好,特别是在低级别胶质瘤患者中更为显著。2.2.3 Sp1 在胶质瘤细胞及正常胶质细胞中表达差异分析
【参考文献】：
期刊论文
[1]MicroRNA在脑胶质瘤临床应用中的研究进展[J]. 朱如哲. 中国处方药. 2018(08)
[2]神经胶质瘤中microRNA的研究进展[J]. 沙力江·艾尔肯,蔡玲. 系统医学. 2018(08)
[3]胶质瘤相关分子标记物的研究进展[J]. 杨孝燕,王春红,胡昌辰,成睿,吉宏明. 中国药物与临床. 2018(03)
[4]Sp1和miR-92b在口腔癌组织中的表达及其意义[J]. 侯振伟,游珺,张风华. 解放军预防医学杂志. 2018(02)
[5]PI3K/Akt信号通路及SP1在VEGF上调胃癌细胞MRP1中的作用[J]. 李娟,许文林,冷加燕. 世界华人消化杂志. 2014(36)
[6]Sp3对β-catenin基因转录调控作用初探[J]. 黄兰姗,黄子凌,冯振博,陈罡,危丹明. 中国病理生理杂志. 2014(11)
[7]ERK1/2-Sp1信号通路对肺癌细胞VEGF的调控作用[J]. 梁璇,丁新民,霍艳英,潘兴斌,隋建丽,白贝,徐勤枝,周平坤. 癌变.畸变.突变. 2007(04)
博士论文
[1]长链非编码RNA-LINC01116在脑胶质瘤中的表达及其肿瘤生物学功能与机制的研究[D]. 叶晶亮.第二军医大学 2017
本文编号：2991941
本文链接：https://www.wllwen.com/shoufeilunwen/yxlbs/2991941.html
教材专著
