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下咽鳞状细胞癌CircRNA表达谱分析以及miR-548c-3p的功能研究

发布时间:2021-03-29 19:23
  [目的]下咽鳞状细胞癌(Hypopharyngeal squamuscell carcinoma,HSCC)是来源于下咽部组织的恶性肿瘤,具有发病隐匿、转移早和易复发的特点。从分子水平找出下咽癌差异性表达的基因及其可能调控的分子机制对于下咽癌的早期诊断以及生存率的提高具有重要意义。既往研究表明,miRNA在肿瘤发生、发展过程中发挥重要的调控作用,circRNA具有海绵吸附miRNA的功能。本课题利用二代高通量测序技术检测HSCC组织及癌旁组织中circRNA表达谱,筛选出差异性表达的circRNAs,通过生物信息学分析其海绵吸附miR-548c-3p。细胞水平上分析下咽癌细胞中miR-548c-3p及其靶基因TP53BP2对细胞増殖、克隆形成、迁移、侵袭、周期和凋亡等生物学功能的影响。本研究为探讨circRNA在下咽癌中表达情况以及海绵吸附的miR-548c-3p对下咽癌细胞(FaDu)生物学功能的影响,这些发现对于进一步阐明下咽癌的发生发展机制具有重要作用,对下咽癌早期诊断的靶点及下咽癌肿瘤标志物的发现提供参考。[方法]1.本文研究对象是初次接受手术治疗的63例HSCC患者,在手术中... 

【文章来源】:昆明医科大学云南省

【文章页数】:118 页

【学位级别】:博士

【部分图文】:

下咽鳞状细胞癌CircRNA表达谱分析以及miR-548c-3p的功能研究


图1-3?HSCC组织和癌旁非肿瘤正常组织之间circRNA的表达谱差异??

测序,肿瘤,标本,内参


circular?RNAs;?PC,principal?component;?N,?normal;?T,?tumor〇??2?qRT-PCR验证circRNAs测序结果??下咽癌中差异性表达(显著升高或下降)的19个circRNAs?(见表1-8)对送??检标本(1分正常组织、3份肿瘤组织)进行RT-qPCR检测,18?rRNA作为circRNAs??的内参,U6作为miRNA的内参,p<0.05具有统计学意义。结果差异性表达的12??个circRNAs与RT-qPCR检测结果一致(见图1-4)。所得图像信号均匀、清晰,??无边缘效应,阳性定位和阴性定位对照区域结果明显,证明测序结果准确、可靠。??in?1?产?r ̄]?t—??izucULl?\drnmm,??卜一?"J?|???一1?S^A?I?1?—1?。-??I?T?\?—?\?\??丁奏一.i?■■甲養z:?抑?養一?||??!二?r?H?p?b?i?!二?i??l:dm^m?i ̄'_iLJU??■*?、>*■、》■?士?>???*?^?、‘.?一7??J■士?■士?sT?彳?>??izi?^?rT?!::]?,丨彐?n?!:q?r??IzUIjL?izUwm^_?izUuL??I??-'!?I?一,?{-"l?1????I?T?I—?T?|??..■?JL^£???i??"????T?i?.一,?1?ii??idwn&i.....?i三In7??8?^?s*-?^?j-?,?-y?令?士?v-?^?>??in?。。〇、??卜.?J_^〇〇??h-??J(?氤?M.?I??i?〇

序列,内含子,染色体,前体


tissue?and?3?tumor?tissue).?Twelve?of?them?were?identical?with?the?results?of?cirRNAs??detection?and?sequencing.?P?<?0.05?has?statistical?significance.??3?CircRNAs环化连接的方式及其染色体中的分布情况??柱状图(图1-4?A)显示通过基因组RNA通过反向剪接的方式产生的circRNA??百分比的条形图。其中外显子环化占比排第一位,其次是内含子环化。差异性表??达circRNA中,(升高或者降低)circRNAs中外显子环化同样占第一位,内含子??及内含子-外显子环化主要见于高表达的circRNAs?(图1-5B)。染色体不同条带??上?circRNA?分别也不一样,chrl、chr2、chr7、chrl6、chr22?中?circRNA?分布较多??(图?1-5?C)。??A??|?■?|?|?■?|?■_??0?95?私—?E?r?P'?^?V?■?intcrgciuc_rcgion??lllllll??N_1?N_2?N_3?C_1?C_2?C_3??2S??B?180?i?c??i>i?■?r?I??g?100?■?■up-regulated?〇?15?I?I??〇?80?drcRNAs??§??'T?-?7?^?llli.llllllilllillliL??图1-5?CircRNAs连接的方式和染色体中的分布情况??(A)前体RNA?(pre-RNA)剪接去除基因内的非编码内含子序列后通过反??向剪接方式形成的circRNA其成分百分比

【参考文献】:
期刊论文
[1]人鼻咽癌组织环状RNA差异表达分析[J]. 黄静,李欣晓,吴伟豪,阮晓文,潘璀璇,江丹贤,余忠华.  医学研究生学报. 2018(08)
[2]c-FOS基因在下咽鳞状细胞癌对诱导化疗药物敏感性中的作用研究[J]. 翟杰,王茹,王海舟,刘术舟,杨一帆,廉猛,房居高.  中国耳鼻咽喉头颈外科. 2018(04)
[3]环状RNA与肿瘤的研究进展[J]. 闫宁宁,徐迎春,张凤春.  世界华人消化杂志. 2015(35)
[4]肿瘤标志物联合检测对消化系统肿瘤的诊断价值[J]. 王秀芹,马宏星,严惟力.  标记免疫分析与临床. 2010(02)

博士论文
[1]下咽癌FaDu细胞放疗抵抗细胞系的建立与IncRNA和mRNA表达谱的基因芯片分析[D]. 李文明.山东大学 2016



本文编号:3108060

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