LncRNA HOTAIR/miR-1277-5p/COL5A1轴在胃癌发生发展中的作用及其机制研究
发布时间:2021-04-20 14:59
目的多个研究已经证实lncRNA HOTAIR通过与miRNA相互作用调控靶基因的表达,进而参与胃癌的发生发展。而miR-1277-5p在胃癌发生发展中的作用尚不清楚,因此,本实验以miR-1277-5p为中心,研究miR-1277-5p在胃癌发生发展中的作用及其机制。方法1.通过生物信息学的方法筛选出胃癌组织中高表达的lncRNA和基因,并采用Gene Ontology(GO)、Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)pathway、String分析和Kaplan Meier plotter法分别筛选出一个lncRNA和靶基因。预测并筛选出的lncRNA和靶基因的靶向miRNA并筛选出其共同靶向miR-1277-5p,通过过表达和干扰上游lncRNA表达,采用实时定量PCR法检测miR-1277-5p表达水平的变化,进一步验证上游lncRNA和miR-1277-5p的调控关系。2.为了检测lncRNA/miR-1277-5p/靶基因调控轴对胃癌发生发展的影响,采用Western blot和实时定量PCR法探究靶基因在胃癌细胞和组织中的...
【文章来源】:安徽医科大学安徽省
【文章页数】:117 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
英文缩略词表
中文摘要
英文摘要
前言
第一部分 :胃癌差异性表达基因和LNCRNA筛选及其共同靶向IRNA的筛选
1.材料和方法
1.1 材料
1.2 方法
1.3 统计学处理
2.结果
2.1 胃癌中差异表达基因和lncRNA的筛选结果
2.2 GO分析和KEGG pathway分析结果
2.3 差异表达基因String分析结果
2.4 靶向miRNA的筛选及其与lncRNA HOTAIR和 COL5A1 之间靶向关系
2.5 lncRNA HOTAIR和 COL5A1 生存分析
2.6 LncRNA HOTAIR抑制miRNA表达
3.讨论
4.结论
第二部分 :COL5A1 在胃癌细胞中的表达及对胃癌细胞增殖的影响
1.材料与方法
1.1 材料
1.2 方法
1.3 统计学处理
2.结果
2.1 胃癌组织和五种胃癌细胞株中COL5A1 蛋白表达水平升高
2.2 体外实验验证COL5A1 对胃癌细胞增殖的影响
3.讨论
4.结论
第三部分 MIRNA-1277-5P对胃癌生物学行为调控
1.材料与方法
1.1 材料
1.2 方法
2.结果
2.1 miRNA-1277-5p抑制胃癌细胞的增殖
2.2 miRNA-1277-5p抑制胃癌细胞的迁移和侵袭
2.3 miRNA-1277-5p抑制胃癌细胞的划痕愈合
3.讨论
4.结论
第四部分 MIRNA-1277-5P对胃癌生物学行为调控的机制研究
1.材料与方法
1.1 材料
1.2 方法
2.结果
2.1 双荧光素酶报告基因实验结果证实miR-1277-5p与 lncRNA HOTAIR靶向结合
2.2 双荧光结果证实hsa-miR-1277-5p与 COL5A1 靶向结合
2.3 LncRNA HOTAIR正性调控COL5A1 的表达而miR-1277-5p负性调控其表达
2.4 LncRNA HOTAIR促进胃癌细胞的增殖
2.5 LncRNA HOTAIR促进胃癌细胞的迁移和侵袭
2.6 LncRNA HOTAIR促进胃癌细胞的划痕愈合
3.讨论
4.结论
参考文献
附录
致谢
综述
参考文献
【参考文献】:
期刊论文
[1]HOX transcript antisense intergenic RNA represses E-cadherin expression by binding to EZH2 in gastric cancer[J]. Wen-Ming Chen,Wei-Dong Chen,Xue-Mei Jiang,Xue-Feng Jia,Hong-Mei Wang,Qiu-Jie Zhang,Yong-Qian Shu,Hai-Bo Zhao. World Journal of Gastroenterology. 2017(33)
[2]CD97 promotes gastric cancer cell proliferation and invasion through exosome-mediated MAPK signaling pathway[J]. Chao Li,Da-Ren Liu,Guo-Gang Li,Hou-Hong Wang,Xiao-Wen Li,Wei Zhang,Yu-Lian Wu,Li Chen. World Journal of Gastroenterology. 2015(20)
[3]Inflammation-related factors predicting prognosis of gastric cancer[J]. Wen-Jun Chang,Yan Du,Xin Zhao,Li-Ye Ma,Guang-Wen Cao. World Journal of Gastroenterology. 2014(16)
[4]p16 promoter hypermethylation:A useful serum marker for early detection of gastric cancer[J]. Mohammad Reza Abbaszadegan,Omeed Moaven,Hamid Reza Sima,Kamran Ghafarzadegan,Azadeh A’rabi,Mohammad Naser Forghani,Hamid Reza Raziee,Ali Mashhadinejad,Mostafa Jafarzadeh,Ehsan Esmaili-Shandiz,Ezzat Dadkhah. World Journal of Gastroenterology. 2008(13)
本文编号:3149900
【文章来源】:安徽医科大学安徽省
【文章页数】:117 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
英文缩略词表
中文摘要
英文摘要
前言
第一部分 :胃癌差异性表达基因和LNCRNA筛选及其共同靶向IRNA的筛选
1.材料和方法
1.1 材料
1.2 方法
1.3 统计学处理
2.结果
2.1 胃癌中差异表达基因和lncRNA的筛选结果
2.2 GO分析和KEGG pathway分析结果
2.3 差异表达基因String分析结果
2.4 靶向miRNA的筛选及其与lncRNA HOTAIR和 COL5A1 之间靶向关系
2.5 lncRNA HOTAIR和 COL5A1 生存分析
2.6 LncRNA HOTAIR抑制miRNA表达
3.讨论
4.结论
第二部分 :COL5A1 在胃癌细胞中的表达及对胃癌细胞增殖的影响
1.材料与方法
1.1 材料
1.2 方法
1.3 统计学处理
2.结果
2.1 胃癌组织和五种胃癌细胞株中COL5A1 蛋白表达水平升高
2.2 体外实验验证COL5A1 对胃癌细胞增殖的影响
3.讨论
4.结论
第三部分 MIRNA-1277-5P对胃癌生物学行为调控
1.材料与方法
1.1 材料
1.2 方法
2.结果
2.1 miRNA-1277-5p抑制胃癌细胞的增殖
2.2 miRNA-1277-5p抑制胃癌细胞的迁移和侵袭
2.3 miRNA-1277-5p抑制胃癌细胞的划痕愈合
3.讨论
4.结论
第四部分 MIRNA-1277-5P对胃癌生物学行为调控的机制研究
1.材料与方法
1.1 材料
1.2 方法
2.结果
2.1 双荧光素酶报告基因实验结果证实miR-1277-5p与 lncRNA HOTAIR靶向结合
2.2 双荧光结果证实hsa-miR-1277-5p与 COL5A1 靶向结合
2.3 LncRNA HOTAIR正性调控COL5A1 的表达而miR-1277-5p负性调控其表达
2.4 LncRNA HOTAIR促进胃癌细胞的增殖
2.5 LncRNA HOTAIR促进胃癌细胞的迁移和侵袭
2.6 LncRNA HOTAIR促进胃癌细胞的划痕愈合
3.讨论
4.结论
参考文献
附录
致谢
综述
参考文献
【参考文献】:
期刊论文
[1]HOX transcript antisense intergenic RNA represses E-cadherin expression by binding to EZH2 in gastric cancer[J]. Wen-Ming Chen,Wei-Dong Chen,Xue-Mei Jiang,Xue-Feng Jia,Hong-Mei Wang,Qiu-Jie Zhang,Yong-Qian Shu,Hai-Bo Zhao. World Journal of Gastroenterology. 2017(33)
[2]CD97 promotes gastric cancer cell proliferation and invasion through exosome-mediated MAPK signaling pathway[J]. Chao Li,Da-Ren Liu,Guo-Gang Li,Hou-Hong Wang,Xiao-Wen Li,Wei Zhang,Yu-Lian Wu,Li Chen. World Journal of Gastroenterology. 2015(20)
[3]Inflammation-related factors predicting prognosis of gastric cancer[J]. Wen-Jun Chang,Yan Du,Xin Zhao,Li-Ye Ma,Guang-Wen Cao. World Journal of Gastroenterology. 2014(16)
[4]p16 promoter hypermethylation:A useful serum marker for early detection of gastric cancer[J]. Mohammad Reza Abbaszadegan,Omeed Moaven,Hamid Reza Sima,Kamran Ghafarzadegan,Azadeh A’rabi,Mohammad Naser Forghani,Hamid Reza Raziee,Ali Mashhadinejad,Mostafa Jafarzadeh,Ehsan Esmaili-Shandiz,Ezzat Dadkhah. World Journal of Gastroenterology. 2008(13)
本文编号:3149900
本文链接:https://www.wllwen.com/shoufeilunwen/yxlbs/3149900.html
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