基于网络和非线性方法的miRNA功能预测及HIV亲缘分析研究
发布时间：2021-07-15 11:11
MicroRNA（简称miRNA）是近年来新发现的一类非编码RNA（大约22个核苷酸）,它在许多重要生命过程中起着关键的调控作用,人们对其在疾病诊断和治疗等方面的前景寄予厚望,关于miRNA的研究是当前生命科学领域最前沿的方向之一。HIV-1病毒是最常见的HIV病毒致病株,致死率极高;能在短时间内进化成许多不同的但又密切相关的变体,显示出不同的传染性和进化动力学,因此,HIV-1亚型的准确定位是开发有效疫苗的保证。本文主要研究了pre-microRNA（简称pre-miRNA）的计算识别问题,疾病关联的miRNA预测问题,及HIV的亚型分类问题,并取得了一些研究成果。主要包括以下三个内容:（1）研究了pre-miRNA识别的高精度的计算方法。区分pre-miRNA和长度相似的伪pre-miRNA是生命科学领域中的一个重要问题,它能帮助我们理解RNA的调控机制。目前,机器学习是最流行的识别pre-miRNA的方法。然而,大多数方法主要关注于pre-miRNA的二级结构信息,而忽略了序列的顺序信息和序列的进化信息。在这项研究中,开发了一种新的pre-miRNA识别方法,它从PSI-BLAS...
【文章来源】：湘潭大学湖南省
【文章页数】：105 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１．１?ＨＩＶ－ｌ基因结构示意图（图片来自于维基百科）??ＨＩＶ－１感染的显著特征是其在单个个体感染过程中的异常多样性
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【参考文献】：
期刊论文
[1]CVTree3 Web Server for Whole-genome-based and Alignment-free Prokaryotic Phylogeny and Taxonomy[J]. Guanghong Zuo,Bailin Hao. Genomics,Proteomics & Bioinformatics. 2015(05)
博士论文
[1]三种遗传性癌症MicroRNA异常表达网络的研究[D]. 张波.吉林大学 2018
[2]人非小细胞肺癌与艾滋病（HIV-1感染）的靶向治疗手段的筛选、优化及其应用[D]. 王含璐.北京协和医学院 2018
[3]蛋白质结构类与功能预测及物种亲缘分析问题的非线性方法研究[D]. 韩国胜.湘潭大学 2013
[4]MicroRNA识别及其与疾病关联的预测算法研究[D]. 玄萍.哈尔滨工业大学 2012
本文编号：3285592
【文章来源】：湘潭大学湖南省
【文章页数】：105 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１．１?ＨＩＶ－ｌ基因结构示意图（图片来自于维基百科）??ＨＩＶ－１感染的显著特征是其在单个个体感染过程中的异常多样性
．２??１?１???０－２?｜?—?＿＿—?＜?＞???妄?〇??????—??????－－０．２??１?１???①?０．１??二■■■－．－－—■：?■?■—－ｉ?１???ｉ?＾???；????－－０．１??１?１???ａ，?－１．５２??１?１???５－１．５４－—?＿????０１?－１．５６??１??１????０?５０?１００?１５０??图２．１?ｈｓａ－ｍｉｒ－６８４３基于理化性质Ｓｌｉｄｅ的时间序列的ＥＭＤ过程．??§２．１．２?Ｈｉｌｂｅｒｔ?－?Ｈｕａｎｇ谱分析??经验模式分解后，应用Ｈｉｌｂｅｒｔ变换到每一个ＩＭＦ中，获得分析信号：??Ｈ＾ｔ））?＝?－Ｐ?［°°?＾－ｄｒ，?＇??７Ｔ?Ｊ—ｍｔ?—?Ｔ??Ａ（ｃｉ（ｔ））?＝?Ｃｉ（ｔ）?＋?ｊＨ（ｄ（ｔ））?＝?ａｉ｛ｔ）ｅＰ６ｉ｛ｔ）．??１０??
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【参考文献】：
期刊论文
[1]CVTree3 Web Server for Whole-genome-based and Alignment-free Prokaryotic Phylogeny and Taxonomy[J]. Guanghong Zuo,Bailin Hao. Genomics,Proteomics & Bioinformatics. 2015(05)
博士论文
[1]三种遗传性癌症MicroRNA异常表达网络的研究[D]. 张波.吉林大学 2018
[2]人非小细胞肺癌与艾滋病（HIV-1感染）的靶向治疗手段的筛选、优化及其应用[D]. 王含璐.北京协和医学院 2018
[3]蛋白质结构类与功能预测及物种亲缘分析问题的非线性方法研究[D]. 韩国胜.湘潭大学 2013
[4]MicroRNA识别及其与疾病关联的预测算法研究[D]. 玄萍.哈尔滨工业大学 2012
本文编号：3285592
本文链接：https://www.wllwen.com/shoufeilunwen/yxlbs/3285592.html
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