基于宏基因组学的肝硬化患者营养状况与肠道菌群关系的研究
发布时间：2021-07-17 08:17
肝硬化（Liver cirrhosis）是消化系统的一种常见疾病,以慢性肝脏炎症、肝纤维化和再生结节为特征,肝硬化患者常常伴发各种并发症,例如:自发性细菌性腹膜炎、上消化道出血、肝性脑病（hepatic encephalopathy,HE）、营养不良（Malnutrition）等。其中营养不良不仅是肝硬化的常见并发症,也是肝硬化患者预后不良的独立预测因素,并且随着肝脏疾病病情的加重,营养不良发生率和严重程度增加。研究表明在肝硬化患者中,肠道菌群结构破坏引起肠屏障完整性改变,进一步导致肠通透性升高、细菌DNA易位、高内毒素血症,最终促进肝硬化及各种并发症的进展。以往对肝硬化肠道菌群结构的研究多依赖于培养的方法,近年来随着第二代测序技术的发展,能够更全面的反应肠道菌群多样性特点,为阐明肠道菌群在肝硬化发生发展中所扮演的角色提供依据。目前关于肠道菌群与肥胖、糖尿病的关系研究较多,而关于肠道菌群与肝硬化患者营养状况的研究报道甚少,因此本研究通过宏基因组学（Metagenomics）的方法探索肠道菌群与肝硬化患者不同营养状况之间的关系。目的:通过宏基因组学测序,明确肝硬化患者肠道菌群结构改变;探...
【文章来源】：山西医科大学山西省
【文章页数】：97 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图２－１健康对照组和肝硬化患者组肠道菌群非冗余基因集（基因韦恩图）??
?山西医科大学博士学位论文???Ｓｈａｎｎｏｎ??ｃｏｎｔｒｏｌ?］ｊｙｅｒ?ｃｉｒｒｈｏｓｉｓ??图３－１健康对照组与肝硬化组菌种层面的多样性香农指数比较??如图３－１所示肝硬化组内物种分布不均匀，并且各个样本之间丰富度差异也较大；??而对照组物种分布相对较均一，Ｓｈａｎｎｏｎ?ｉｎｄｅｘ大多数集中在３水平，并且均一性也??较肝硬化组好，这最终导致了两组之间多样性香农指数无显著性差异，这说明在肝硬??化疾病状态下，物种的多样性并未发生明显改变。??３．３．２肝硬化患者和健康对照者肠道菌群结构分析??将肝硬化组获得的高质量：ｒｅａｄｓ与肠道微生物参考基因组数据库进行比对后，获??得肠道菌群各个细菌分级水平的分析表。为了获得两组的差异物种，我们进行了非参??数?ｗｉｌｃｏｘｏｎ?ｒａｎｋ?ｓａｍ?检验。??３．３．２．１．肝硬化患者与健康对照者在肠道菌群分级门（Ｐｈｙｌｕｍ）水平的分布比较??统计分析各个肠道细菌分级门水平在肝硬化组和对照组的相对丰度，如饼状图??３－２所示：??２２??
?山西医科大学博士学位论文???１７４％?１－３０％?０．２６％?０．５８％??＼??６．１８％?９．３４％?Ａｃｔｌｎｏｂｎｃｉｅｒｌａ??１４．８％?Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅ／ｅｓ??Ｆｌｒｍｉｃｕｔｅｓ??Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ??Ｖｅｒｒｕｃｏｍｌｃｒｏｂｉａ??Ｏｔｈｅｒ??５７．０６％?２５－〇５％?４９．３３％?３４．３１％??Ｃｏｎｔｒｏｌ?Ｌｉｖｅｒ?ｃｉｒｒｉｉｏｓｉｓ??图３－２健康对照组与肝硬化组肠道微生物菌群门水平的组成??如上图所示，在门水平上病例组和对照组的优势菌群为拟杆菌门流ｔｏ）和厚壁菌??门在病例组和对照组两个菌门之和分别为８２．３１％?（拟杆菌门２５．０５％＋厚壁菌门??５７．０６％）、８３．６４％?（拟杆菌门３４．３１％＋厚壁菌门４９．３３％），两组之间差异无统计学意义。以往??学者利用宏基因组学方法研究肝硬化患者肠道微生物发现，肝硬化患者和对照者中拟杆菌门??相对丰度分别为５５．５％和６１．１％，与对照组相比肝硬化组相对丰度略有下降，但无统计学差??异［６２］。??拟杆菌门ＣＢｆｌｃｔｅｒａ／ｃｆｅ／ａ）包括拟杆菌纲、鞘脂杆菌杆和黄杆菌纲三个纲，广泛存在于机体??的肠道和皮肤中。在本研究中，我们发现拟杆菌门在肝硬化组和对照组分别为３４．３１％和??２５．０５％，与对照组相比肝硬化组拟杆菌水平升高，但两组之间差异无显著性。ＢａｊａｊＪＳ及其??同事研宄也发现在肝硬化伴随肝性脑病的患者中拟杆菌门水平升高［６３］。除此之外，Ｔｕｏｍｉｓｔｏ?Ｓ??等人发现与对照组相比酒精性肝硬化患者中拟杆菌丰度水平也表现为增高［？１。综上，我们推??测肝硬化患者中拟杆
【参考文献】：
期刊论文
[1]终末期肝病临床营养指南[J]. 段钟平,杨云生. 实用肝脏病杂志. 2019(05)
[2]Distinct gut microbiota profiles in patients with primary sclerosing cholangitis and ulcerative colitis[J]. Lukas Bajer,Miloslav Kverka,Martin Kostovcik,Peter Macinga,Jiri Dvorak,Zuzana Stehlikova,Jan Brezina,Pavel Wohl,Julius Spicak,Pavel Drastich. World Journal of Gastroenterology. 2017(25)
[3]Gut microbiota and host metabolism in liver cirrhosis[J]. Makoto Usami,Makoto Miyoshi,Hayato Yamashita. World Journal of Gastroenterology. 2015(41)
[4]Ethanol and liver: Recent insights into the mechanisms of ethanol-induced fatty liver[J]. Jinyao Liu. World Journal of Gastroenterology. 2014(40)
博士论文
[1]代偿期和失代偿期肝硬化病人的肠道菌群研究[D]. 李昂.浙江大学 2017
本文编号：3287805
【文章来源】：山西医科大学山西省
【文章页数】：97 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图２－１健康对照组和肝硬化患者组肠道菌群非冗余基因集（基因韦恩图）??
?山西医科大学博士学位论文???Ｓｈａｎｎｏｎ??ｃｏｎｔｒｏｌ?］ｊｙｅｒ?ｃｉｒｒｈｏｓｉｓ??图３－１健康对照组与肝硬化组菌种层面的多样性香农指数比较??如图３－１所示肝硬化组内物种分布不均匀，并且各个样本之间丰富度差异也较大；??而对照组物种分布相对较均一，Ｓｈａｎｎｏｎ?ｉｎｄｅｘ大多数集中在３水平，并且均一性也??较肝硬化组好，这最终导致了两组之间多样性香农指数无显著性差异，这说明在肝硬??化疾病状态下，物种的多样性并未发生明显改变。??３．３．２肝硬化患者和健康对照者肠道菌群结构分析??将肝硬化组获得的高质量：ｒｅａｄｓ与肠道微生物参考基因组数据库进行比对后，获??得肠道菌群各个细菌分级水平的分析表。为了获得两组的差异物种，我们进行了非参??数?ｗｉｌｃｏｘｏｎ?ｒａｎｋ?ｓａｍ?检验。??３．３．２．１．肝硬化患者与健康对照者在肠道菌群分级门（Ｐｈｙｌｕｍ）水平的分布比较??统计分析各个肠道细菌分级门水平在肝硬化组和对照组的相对丰度，如饼状图??３－２所示：??２２??
?山西医科大学博士学位论文???１７４％?１－３０％?０．２６％?０．５８％??＼??６．１８％?９．３４％?Ａｃｔｌｎｏｂｎｃｉｅｒｌａ??１４．８％?Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅ／ｅｓ??Ｆｌｒｍｉｃｕｔｅｓ??Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ??Ｖｅｒｒｕｃｏｍｌｃｒｏｂｉａ??Ｏｔｈｅｒ??５７．０６％?２５－〇５％?４９．３３％?３４．３１％??Ｃｏｎｔｒｏｌ?Ｌｉｖｅｒ?ｃｉｒｒｉｉｏｓｉｓ??图３－２健康对照组与肝硬化组肠道微生物菌群门水平的组成??如上图所示，在门水平上病例组和对照组的优势菌群为拟杆菌门流ｔｏ）和厚壁菌??门在病例组和对照组两个菌门之和分别为８２．３１％?（拟杆菌门２５．０５％＋厚壁菌门??５７．０６％）、８３．６４％?（拟杆菌门３４．３１％＋厚壁菌门４９．３３％），两组之间差异无统计学意义。以往??学者利用宏基因组学方法研究肝硬化患者肠道微生物发现，肝硬化患者和对照者中拟杆菌门??相对丰度分别为５５．５％和６１．１％，与对照组相比肝硬化组相对丰度略有下降，但无统计学差??异［６２］。??拟杆菌门ＣＢｆｌｃｔｅｒａ／ｃｆｅ／ａ）包括拟杆菌纲、鞘脂杆菌杆和黄杆菌纲三个纲，广泛存在于机体??的肠道和皮肤中。在本研究中，我们发现拟杆菌门在肝硬化组和对照组分别为３４．３１％和??２５．０５％，与对照组相比肝硬化组拟杆菌水平升高，但两组之间差异无显著性。ＢａｊａｊＪＳ及其??同事研宄也发现在肝硬化伴随肝性脑病的患者中拟杆菌门水平升高［６３］。除此之外，Ｔｕｏｍｉｓｔｏ?Ｓ??等人发现与对照组相比酒精性肝硬化患者中拟杆菌丰度水平也表现为增高［？１。综上，我们推??测肝硬化患者中拟杆
【参考文献】：
期刊论文
[1]终末期肝病临床营养指南[J]. 段钟平,杨云生. 实用肝脏病杂志. 2019(05)
[2]Distinct gut microbiota profiles in patients with primary sclerosing cholangitis and ulcerative colitis[J]. Lukas Bajer,Miloslav Kverka,Martin Kostovcik,Peter Macinga,Jiri Dvorak,Zuzana Stehlikova,Jan Brezina,Pavel Wohl,Julius Spicak,Pavel Drastich. World Journal of Gastroenterology. 2017(25)
[3]Gut microbiota and host metabolism in liver cirrhosis[J]. Makoto Usami,Makoto Miyoshi,Hayato Yamashita. World Journal of Gastroenterology. 2015(41)
[4]Ethanol and liver: Recent insights into the mechanisms of ethanol-induced fatty liver[J]. Jinyao Liu. World Journal of Gastroenterology. 2014(40)
博士论文
[1]代偿期和失代偿期肝硬化病人的肠道菌群研究[D]. 李昂.浙江大学 2017
本文编号：3287805
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