基于网络药理学和蛋白质组学探究健脾复方胃肠安及活性化合物木犀草素的抗胃癌作用机制
发布时间:2021-07-26 14:52
以健脾为主的中药复方胃肠安(WCA)是上海市名中医、龙华医院肿瘤科邱佳信教授的临床验方,在改善胃癌患者脾虚证、延长生存期、降低根治术后复发转移、减轻化疗不良反应等方面具有确切的临床疗效。实验研究表明基于胃癌“脾虚”病机的复方胃肠安具有明确的抗致突变作用,能在胃癌的起始和启动阶段起到阻断作用;抑制人胃癌裸小鼠皮下移植瘤的生长和原位移植瘤的转移;抑制胃癌细胞的增殖;诱导胃癌细胞的凋亡;抑制胃癌细胞的侵袭和转移及上皮间质转化;调节免疫等作用。目的:从中药复方研究的整体角度出发,采用网络药理学方法研究复方胃肠安的核心化学成分,作用靶点及信号通路;蛋白质组学技术分析复方胃肠安作用人胃癌裸小鼠皮下移植瘤模型后差异蛋白的变化;采用网络药理学与蛋白质组学联合分析,筛选网络中复方胃肠安共同作用的潜在靶点及信号通路;同时研究复方胃肠安中重要活性化合物木犀草素抗胃癌的潜在作用机制。方法:1.运用网络药理学研究方法,构建化合物-靶标、靶标-疾病及靶标-通路等多水平多层次的网络,利用Cytoscape软件,构建HIPPIE(Human Interated ProteinProtein Interaction r...
【文章来源】:上海中医药大学上海市
【文章页数】:138 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
复方胃肠安中药-化学成分热图
82.3复方胃肠安靶标的生物功能分析2.3.1基因本体(GO)富集分析对复方胃肠安的306个作用靶标及胃癌相关疾病靶标进行基因本体的富集分析,按照1.2.4的方法,发现复方胃肠安在分子功能(MF)水平显著关联的GO术语有117个,与胃癌有显著关联的GO术语有72个;在生物过程(BP)水平,与复方胃肠安显著相关的GO术语有1578个,与胃癌有显著关联的GO术语有1104个;在细胞组件(CC)水平,与复方胃肠安显著关联的GO术语有71个,与胃癌有显著相关的GO术语有54个。图2,图3,图4分别为按P值排序,取前10个关联程度最高的GO术语。复方胃肠安靶标与胃癌显著共关联的前30个GO术语,见图5所示。GO分析的MF水平,复方胃肠安靶标与胃癌在转录因子结合(transcriptionfactorbinding)、磷脂酰肌醇3激酶活性(phosphatidylinositol3-kinaseactivity)显著相关。见图2所示。图2复方胃肠安靶标与疾病前10个关联程度最高的GO术语(MF)Fig.2GOterminology(MF)withthehighestcorrelationbetweenthetargetofWCAandthetop10diseases.
在 GO 分析的 BP 水平,复方胃肠安靶标与疾病靶标显示出了较多的重叠性,主要集中在腺体发育(gland development)、ERBB2 信号通路(ERBB2 signaling pathway)、磷脂酰肌醇 3 激酶信号转导(phosphatidylinositol 3-kinase signaling)、肌醇脂介导信号(inositol lipid-mediated signaling)、蛋白质导入细胞核的调控(regulation of protein import into nucleus)、核质转运的正调控(positive regulation of nucleocytoplasmic transport)、蛋白调控(regulation of protein import)、核质转运的调控(regulation of nucleocytoplasmic transport)、细胞凋亡的负调控(negative regulation of cell adnesion),见图 3 所示。
【参考文献】:
期刊论文
[1]Performance of risk stratification systems for gastrointestinal stromal tumors: A multicenter study[J]. Tao Chen,Liang-Ying Ye,Xing-Yu Feng,Hai-Bo Qiu,Peng Zhang,Yi-Xin Luo,Li-Yi Yuan,Xin-Hua Chen,Yan-Feng Hu,Hao Liu,Yong Li,Kai-Xiong Tao,Jiang Yu,Guo-Xin Li. World Journal of Gastroenterology. 2019(10)
[2]基于网络药理学的含水蛭经方抗肿瘤机制研究[J]. 曾洁,麦荣云,阮景晟,鞠佳霓,王宗玉,陈闯. 广西医学. 2019(04)
[3]Luteolin induces hippocampal neurogenesis in the Ts65Dn mouse model of Down syndrome[J]. Wen-Bo Zhou,Zong-Ning Miao,Bin Zhang,Wei Long,Fang-Xiu Zheng,Jing Kong,Bin Yu. Neural Regeneration Research. 2019(04)
[4]基于网络药理学的康莱特注射液3种主要成分抗肿瘤机制研究[J]. 王博龙. 中国现代应用药学. 2019(01)
[5]黄芪-莪术药对基于网络药理学的抗大肠癌分子机制[J]. 刘夫艳,唐德才,谭喜莹. 中国实验方剂学杂志. 2019(13)
[6]利用定量蛋白组学的方法研究甲异靛诱导K562细胞凋亡的机制[J]. 毛新荷,徐颖茜,邢海燕,田征,唐克晶,刘璐,饶青,王敏,王建祥. 中国实验血液学杂志. 2018(06)
[7]胃肠安颗粒剂与汤剂抑制人胃癌裸鼠皮下移植瘤生长、淋巴结转移作用比较及对RUFY3,SNAI1,VEGF和EMT蛋白的影响[J]. 李佳,陈伟霞,李朝燕,赵爱光. 中国实验方剂学杂志. 2019(05)
[8]基于iTRAQ技术的慢性心力衰竭气虚血瘀证及气阴两虚证组差异蛋白质组学研究[J]. 孟永梅,王伟. 世界中医药. 2018(09)
[9]基于生物信息学方法分析复方苦参注射液治疗肝癌的分子生物学机制[J]. 黄坤,陈伟伟,刘锐,刘承利. 山西医科大学学报. 2018(09)
[10]健脾中药胃肠安对胃癌MKN45细胞侵袭迁移能力的影响[J]. 陈伟霞,牛垚飞,陈彬,丁亚杰,唐亚荣,赵爱光. 中华中医药学刊. 2018(09)
本文编号:3303773
【文章来源】:上海中医药大学上海市
【文章页数】:138 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
复方胃肠安中药-化学成分热图
82.3复方胃肠安靶标的生物功能分析2.3.1基因本体(GO)富集分析对复方胃肠安的306个作用靶标及胃癌相关疾病靶标进行基因本体的富集分析,按照1.2.4的方法,发现复方胃肠安在分子功能(MF)水平显著关联的GO术语有117个,与胃癌有显著关联的GO术语有72个;在生物过程(BP)水平,与复方胃肠安显著相关的GO术语有1578个,与胃癌有显著关联的GO术语有1104个;在细胞组件(CC)水平,与复方胃肠安显著关联的GO术语有71个,与胃癌有显著相关的GO术语有54个。图2,图3,图4分别为按P值排序,取前10个关联程度最高的GO术语。复方胃肠安靶标与胃癌显著共关联的前30个GO术语,见图5所示。GO分析的MF水平,复方胃肠安靶标与胃癌在转录因子结合(transcriptionfactorbinding)、磷脂酰肌醇3激酶活性(phosphatidylinositol3-kinaseactivity)显著相关。见图2所示。图2复方胃肠安靶标与疾病前10个关联程度最高的GO术语(MF)Fig.2GOterminology(MF)withthehighestcorrelationbetweenthetargetofWCAandthetop10diseases.
在 GO 分析的 BP 水平,复方胃肠安靶标与疾病靶标显示出了较多的重叠性,主要集中在腺体发育(gland development)、ERBB2 信号通路(ERBB2 signaling pathway)、磷脂酰肌醇 3 激酶信号转导(phosphatidylinositol 3-kinase signaling)、肌醇脂介导信号(inositol lipid-mediated signaling)、蛋白质导入细胞核的调控(regulation of protein import into nucleus)、核质转运的正调控(positive regulation of nucleocytoplasmic transport)、蛋白调控(regulation of protein import)、核质转运的调控(regulation of nucleocytoplasmic transport)、细胞凋亡的负调控(negative regulation of cell adnesion),见图 3 所示。
【参考文献】:
期刊论文
[1]Performance of risk stratification systems for gastrointestinal stromal tumors: A multicenter study[J]. Tao Chen,Liang-Ying Ye,Xing-Yu Feng,Hai-Bo Qiu,Peng Zhang,Yi-Xin Luo,Li-Yi Yuan,Xin-Hua Chen,Yan-Feng Hu,Hao Liu,Yong Li,Kai-Xiong Tao,Jiang Yu,Guo-Xin Li. World Journal of Gastroenterology. 2019(10)
[2]基于网络药理学的含水蛭经方抗肿瘤机制研究[J]. 曾洁,麦荣云,阮景晟,鞠佳霓,王宗玉,陈闯. 广西医学. 2019(04)
[3]Luteolin induces hippocampal neurogenesis in the Ts65Dn mouse model of Down syndrome[J]. Wen-Bo Zhou,Zong-Ning Miao,Bin Zhang,Wei Long,Fang-Xiu Zheng,Jing Kong,Bin Yu. Neural Regeneration Research. 2019(04)
[4]基于网络药理学的康莱特注射液3种主要成分抗肿瘤机制研究[J]. 王博龙. 中国现代应用药学. 2019(01)
[5]黄芪-莪术药对基于网络药理学的抗大肠癌分子机制[J]. 刘夫艳,唐德才,谭喜莹. 中国实验方剂学杂志. 2019(13)
[6]利用定量蛋白组学的方法研究甲异靛诱导K562细胞凋亡的机制[J]. 毛新荷,徐颖茜,邢海燕,田征,唐克晶,刘璐,饶青,王敏,王建祥. 中国实验血液学杂志. 2018(06)
[7]胃肠安颗粒剂与汤剂抑制人胃癌裸鼠皮下移植瘤生长、淋巴结转移作用比较及对RUFY3,SNAI1,VEGF和EMT蛋白的影响[J]. 李佳,陈伟霞,李朝燕,赵爱光. 中国实验方剂学杂志. 2019(05)
[8]基于iTRAQ技术的慢性心力衰竭气虚血瘀证及气阴两虚证组差异蛋白质组学研究[J]. 孟永梅,王伟. 世界中医药. 2018(09)
[9]基于生物信息学方法分析复方苦参注射液治疗肝癌的分子生物学机制[J]. 黄坤,陈伟伟,刘锐,刘承利. 山西医科大学学报. 2018(09)
[10]健脾中药胃肠安对胃癌MKN45细胞侵袭迁移能力的影响[J]. 陈伟霞,牛垚飞,陈彬,丁亚杰,唐亚荣,赵爱光. 中华中医药学刊. 2018(09)
本文编号:3303773
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