长链非编码RNA GCMA对胃癌转移的调控作用及相关机制研究
发布时间：2021-08-31 04:07
研究背景:胃癌是世界上常见的恶性肿瘤之一,其预后较差,死亡率高。尽管近年来胃镜技术的发展大大提高了早期胃癌的诊断率并进一步改善了早期胃癌患者的生存率,但进展期胃癌患者仍缺乏有效的治疗手段,生存率仍较差。胃癌的浸润和转移是造成晚期胃癌患者复发及预后不良的主要原因。胃癌的浸润和转移是多阶段,多因素调控的复杂过程,其分子机制仍不是很清楚。深入探索胃癌浸润和转移的分子机制有助于提供有效的治疗靶点,并改善胃癌患者的预后。长链非编码RNA（long noncoding RNA,lncRNA）是一类长度大于200个核苷酸,缺乏可识别的开放阅读框（open reading frame,ORF）,且不具有蛋白质编码能力的RNA分子。已有研究表明lncRNA在肿瘤的发生发展中发挥着重要的作用,其调控方式包括介导染色质重塑及组蛋白修饰、转录及转录后水平的调控等。虽然关于lncRNA的研究进展迅猛,但绝大部分lncRNA的功能仍然是不清楚的,与胃癌转移相关的lncRNA的报道更是少数。本研究通过胃癌组织lncRNA表达谱芯片筛选出与胃癌转移显著相关的lncRNA GCMA,随后在独立胃癌组织样本中检测GCMA...
【文章来源】：山东大学山东省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：154 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１：?ＬｎｃＲＮＡＧＣＭＡ是一种与胃癌转移相关的ＩｎｃＲＮＡ
?＾．ＧＣＭＡ?ｈｉｇｈ??卜?ｉ：?ｊｉ??＾?４０?ＡＵＣ＝０．７０７１?１?＾?Ｌ〇ｇ，ａ？￣?ｈ?．?Ｉ?Ｌｏｓ．ａｎＺ?＼?＿??Ｐ＝〇〇〇７７?２０．?ｐ＾〇３３〇?１?？■?Ｓ：〇〇＾ｐ５????Ｈａｚａｒｄ?ＲａｔＫ３＝３?９５４??Ｈａａｒｄ?ＲａｔＫ＞＝３?４６１??０?２０?４０?６０?８０?１?００?０?１２?２４?３６?４８?６０?〇?１２?２４?３６?４８?６０??１－Ｓｐｅｃｉｆｉｃｉｔｙ％?ｍｏｎｔｈ?ｍｏｎｔｈ??图２：?ＧＣＭＡ与淋巴结转移及预后的相关性??Ａ．?ＲＯＣ曲线显示结果显示ＧＣＭＡ可较好地区分出发生淋巴结转移的胃癌组织和未发生淋??巴结转移的胃癌组织（曲线下面积为０．７０７１，?９５°／〇Ｃ丨为０．５８０７－０．８３３４，尸＝０．００７７）。．?Ｂ．??Ｋａｐｌａｎ－Ｍｅｉｅｒ生存曲线分析显示ＧＣＭＡ高表达的患者ＯＳ较差（ＨＲ＝３．９５４，Ｚ＾Ｏ．０３３０）。??Ｃ．?Ｋａｐｌａｎ－Ｍｅｉｅｒ生存曲线分析显示ＧＣＭＡ高表达的患者ＤＦＳ较差（ＨＲ＝３．４６ｌ，Ｐ＝０．０４７５）。??１．３?ＧＣＭＡ的基因学特征??我们在Ｅｎｓｅｍｂｌ和ＮＣＢ１基因数据库网站上检索了?ＧＣＭＡ的基因学特征。??结果显示，ＧＣＭＡ?（ＥＮＳＴ０００００４５丨６１８或ＡＰ００１４７６）位于人的２１号染色体长??臂末端，由２个外显子构成，转录本长度为２１９８个核苷酸，属于基因间ＩｎｃＲＮＡ??（图?３Ａ－Ｃ）。Ｃ．ＰＡＴ?（Ｃｏｄｉｎｇ?Ｐｏｔｅｎｔｉａｌ?Ａｓｓｅｓｓｍｅｎｔ?Ｔｏｏｌ）生物信息学软件分析表明??ＧＣＭＡ不具有编码蛋白质的能力（图３Ｄ）。??Ａ?
ＧＣＭＡ?（ＥＮＳＴ０００００４５１６１８或ＡＴＯＯ丨４７６）位??于人的２丨号染色体长臂末端，全长为２１９８个核苷酸，属于基因间ＩｎｃＲＮＡ。Ｄ．?ＣＰＡＴ软件??分析表明ＧＣＭＡ不具有编码蛋白质的能力。??１．４?ＧＣＭＡ的细胞内定位和稳定性分析??随后，我们通过荧光原位杂交实验（ＦＩＳＨ实验）检测了?ＧＣＭＡ在胃癌细胞中??的定位。结果显示，阳性对照Ｕ６在胃癌细胞系ＢＧＣ８２３和ＭＫＮ４５中定位于细胞核??中，１８Ｓ定位于细胞质中，而ＩｎｃＲＮＡＧＣＭＡ定位于细胞质和细胞核中（图４Ａ－Ｂ）。??为检测ＧＣＭＡ在胃癌细胞中的稳定性，我们进行了放线菌素Ｄ加药实验并于处理??后的Ｏｈ、０．５ｈ、ｌｈ、２ｈ和４ｈ收集细胞进行ＲＴ－ｑＰＣＲ检测ＧＣＭＡ和Ｃ－ＭＹＣ?（阳性??对照）的表达量。结果显示，与Ｃ－ＭＹＣ相比，ＧＣＭＡ在胃癌细胞中可长久稳定??存在（图４Ｃ－Ｄ）。??Ａ?Ｃｙ３?ＤＡＰＩ?Ｍｅｒｇｅｄ?°?Ｃｙ３?ＤＡＰＩ?Ｍｅｒｇｅｄ??ｍｍｍ?ｅｂｂ??Ｃ?Ｄ??＾?０１１?一?Ｃ－ＭＹＣ?ｃ?１ｎ??？２?ｉ???一?ＧＣＭＡ?〇?—?Ｃ－ＭＹＣ??？?＊?ＩＳ?—?ＧＣＭＡ??卜”?！?０１－??ｉ?ｉ?°?０１－??＞?０．００１?－?；??１?ｉ???１?〇．〇〇＞■??Ｓｉ?４?ｓ：??０?０００１?ｉ?ｏ＇ｓ?！?Ｊ?ｉ?〇〇〇°ｌ１?ｈ?ｏ＇，?＼?＼??ＡｔｃＤ?（ｈ）?ＡｔｃＤ?（ｈ）??图４：?ＧＣＭＡ的细胞内定位和稳定性??Ａ－Ｂ．?ＦＩＳＨ实验结果显示ＧＣＭＡ在胃癌细胞系ＢＧＣ８２３?（Ａ）和ＭＫＮ４５?（Ｂ）中定位于细
【参考文献】：
期刊论文
[1]Advanced gastric cancer:Current treatment landscape and future perspectives[J]. Antonia Digklia,Anna Dorothea Wagner. World Journal of Gastroenterology. 2016(08)
[2]Characteristics of gastric cancer in Asia[J]. Rubayat Rahman,Akwi W Asombang,Jamal A Ibdah. World Journal of Gastroenterology. 2014(16)
[3]Treatment options in patients with metastatic gastric cancer:Current status and future perspectives[J]. Ahmet Bilici. World Journal of Gastroenterology. 2014(14)
[4]Clinical significance of lymph node metastasis in gastric cancer[J]. Jing-Yu Deng,Han Liang. World Journal of Gastroenterology. 2014(14)
本文编号：3374158
【文章来源】：山东大学山东省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：154 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１：?ＬｎｃＲＮＡＧＣＭＡ是一种与胃癌转移相关的ＩｎｃＲＮＡ
?＾．ＧＣＭＡ?ｈｉｇｈ??卜?ｉ：?ｊｉ??＾?４０?ＡＵＣ＝０．７０７１?１?＾?Ｌ〇ｇ，ａ？￣?ｈ?．?Ｉ?Ｌｏｓ．ａｎＺ?＼?＿??Ｐ＝〇〇〇７７?２０．?ｐ＾〇３３〇?１?？■?Ｓ：〇〇＾ｐ５????Ｈａｚａｒｄ?ＲａｔＫ３＝３?９５４??Ｈａａｒｄ?ＲａｔＫ＞＝３?４６１??０?２０?４０?６０?８０?１?００?０?１２?２４?３６?４８?６０?〇?１２?２４?３６?４８?６０??１－Ｓｐｅｃｉｆｉｃｉｔｙ％?ｍｏｎｔｈ?ｍｏｎｔｈ??图２：?ＧＣＭＡ与淋巴结转移及预后的相关性??Ａ．?ＲＯＣ曲线显示结果显示ＧＣＭＡ可较好地区分出发生淋巴结转移的胃癌组织和未发生淋??巴结转移的胃癌组织（曲线下面积为０．７０７１，?９５°／〇Ｃ丨为０．５８０７－０．８３３４，尸＝０．００７７）。．?Ｂ．??Ｋａｐｌａｎ－Ｍｅｉｅｒ生存曲线分析显示ＧＣＭＡ高表达的患者ＯＳ较差（ＨＲ＝３．９５４，Ｚ＾Ｏ．０３３０）。??Ｃ．?Ｋａｐｌａｎ－Ｍｅｉｅｒ生存曲线分析显示ＧＣＭＡ高表达的患者ＤＦＳ较差（ＨＲ＝３．４６ｌ，Ｐ＝０．０４７５）。??１．３?ＧＣＭＡ的基因学特征??我们在Ｅｎｓｅｍｂｌ和ＮＣＢ１基因数据库网站上检索了?ＧＣＭＡ的基因学特征。??结果显示，ＧＣＭＡ?（ＥＮＳＴ０００００４５丨６１８或ＡＰ００１４７６）位于人的２１号染色体长??臂末端，由２个外显子构成，转录本长度为２１９８个核苷酸，属于基因间ＩｎｃＲＮＡ??（图?３Ａ－Ｃ）。Ｃ．ＰＡＴ?（Ｃｏｄｉｎｇ?Ｐｏｔｅｎｔｉａｌ?Ａｓｓｅｓｓｍｅｎｔ?Ｔｏｏｌ）生物信息学软件分析表明??ＧＣＭＡ不具有编码蛋白质的能力（图３Ｄ）。??Ａ?
ＧＣＭＡ?（ＥＮＳＴ０００００４５１６１８或ＡＴＯＯ丨４７６）位??于人的２丨号染色体长臂末端，全长为２１９８个核苷酸，属于基因间ＩｎｃＲＮＡ。Ｄ．?ＣＰＡＴ软件??分析表明ＧＣＭＡ不具有编码蛋白质的能力。??１．４?ＧＣＭＡ的细胞内定位和稳定性分析??随后，我们通过荧光原位杂交实验（ＦＩＳＨ实验）检测了?ＧＣＭＡ在胃癌细胞中??的定位。结果显示，阳性对照Ｕ６在胃癌细胞系ＢＧＣ８２３和ＭＫＮ４５中定位于细胞核??中，１８Ｓ定位于细胞质中，而ＩｎｃＲＮＡＧＣＭＡ定位于细胞质和细胞核中（图４Ａ－Ｂ）。??为检测ＧＣＭＡ在胃癌细胞中的稳定性，我们进行了放线菌素Ｄ加药实验并于处理??后的Ｏｈ、０．５ｈ、ｌｈ、２ｈ和４ｈ收集细胞进行ＲＴ－ｑＰＣＲ检测ＧＣＭＡ和Ｃ－ＭＹＣ?（阳性??对照）的表达量。结果显示，与Ｃ－ＭＹＣ相比，ＧＣＭＡ在胃癌细胞中可长久稳定??存在（图４Ｃ－Ｄ）。??Ａ?Ｃｙ３?ＤＡＰＩ?Ｍｅｒｇｅｄ?°?Ｃｙ３?ＤＡＰＩ?Ｍｅｒｇｅｄ??ｍｍｍ?ｅｂｂ??Ｃ?Ｄ??＾?０１１?一?Ｃ－ＭＹＣ?ｃ?１ｎ??？２?ｉ???一?ＧＣＭＡ?〇?—?Ｃ－ＭＹＣ??？?＊?ＩＳ?—?ＧＣＭＡ??卜”?！?０１－??ｉ?ｉ?°?０１－??＞?０．００１?－?；??１?ｉ???１?〇．〇〇＞■??Ｓｉ?４?ｓ：??０?０００１?ｉ?ｏ＇ｓ?！?Ｊ?ｉ?〇〇〇°ｌ１?ｈ?ｏ＇，?＼?＼??ＡｔｃＤ?（ｈ）?ＡｔｃＤ?（ｈ）??图４：?ＧＣＭＡ的细胞内定位和稳定性??Ａ－Ｂ．?ＦＩＳＨ实验结果显示ＧＣＭＡ在胃癌细胞系ＢＧＣ８２３?（Ａ）和ＭＫＮ４５?（Ｂ）中定位于细
【参考文献】：
期刊论文
[1]Advanced gastric cancer:Current treatment landscape and future perspectives[J]. Antonia Digklia,Anna Dorothea Wagner. World Journal of Gastroenterology. 2016(08)
[2]Characteristics of gastric cancer in Asia[J]. Rubayat Rahman,Akwi W Asombang,Jamal A Ibdah. World Journal of Gastroenterology. 2014(16)
[3]Treatment options in patients with metastatic gastric cancer:Current status and future perspectives[J]. Ahmet Bilici. World Journal of Gastroenterology. 2014(14)
[4]Clinical significance of lymph node metastasis in gastric cancer[J]. Jing-Yu Deng,Han Liang. World Journal of Gastroenterology. 2014(14)
本文编号：3374158
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