内源性博尔纳样核蛋白样序列EBLN2在胶质瘤细胞中的作用及机制研究
发布时间：2021-10-16 21:49
背景胶质瘤是最常见的原发性恶性脑肿瘤类型,具有复发率高,死亡率高,生存期短,缺乏有效的治疗策略的特点。即使包括手术,放疗和化疗在内的多种治疗手段已有飞速发展,胶质瘤患者的中位生存期仍未有显著提高。寻找、鉴定新的肿瘤靶标仍是胶质瘤研究中亟待解决的关键问题。研究发现,内源性病毒序列（endogenous viral elements,EVEs）与人类癌症疾病密切相关,EVEs已被证实在实体肿瘤诸如黑色素瘤、乳腺癌、卵巢癌、畸胎癌、肉瘤、膀胱癌等中发挥重要作用,并可作为多种癌症疾病的生物标志物或免疫学靶标。因此,针对人类EVEs的创新研究不仅可以加深我们对EVEs与人类疾病关系的理解,同时也有助于我们探寻新的癌症靶标,为癌症的诊断与靶向治疗提供新的思路。内源性博尔纳样核蛋白样序列（endogenous borna-like N elements,EBLNs）是由博尔纳病病毒（borna disease virus,BoDV）衍生而来的EVEs。迄今为止,在人类基因组中共发现7个EBLN（EBLN1EBLN7）,其中EBLN2被认为与癌症的关系最为密切。然而,尚未有研究对...
【文章来源】：重庆医科大学重庆市
【文章页数】：119 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
EBLN2在胶质瘤中的表达水平及与患者预后生存关系
重庆医科大学博士研究生学位论文25图1.2EBLN2在胶质瘤常见突变基因病人中的表达AEBLN2在IDH突变的胶质瘤患者中低表达；BEBLN2在EGFR突变的胶质瘤患者中的表达；CEBLN2在ATRX突变胶质瘤患者中的表达；DEBLN2在TP53突变的胶质瘤患者中的表达。*p<0.05，nsp>0.05。Figure1.2EBLN2expressioninpatientswithgliomacommonmutationgenes.AEBLN2lowexpressioninIDH-mutatedgliomapatients;BEBLN2expressioninEGFR-mutatedgliomapatients;CEBLN2expressioninATRXmutantgliomapatients;DEBLN2expressioninTP53mutantgliomapatients.*p<0.05,nsp>0.05.2.4EBLN2可作为预测神经元型GBM的潜在标志物为进一步探讨EBLN2在胶质瘤中表达分布特点，我们评估了TCGA基于基因表达及改变情况定义的GBM的四种分子亚型：经典型(classical)、神经元型(neural)、间质型(mesenchymal)和前神经元型(proneural)中EBLN2的表达模式。结果（图1.3A）显示，在CGGA数据集中，与其他亚型相比EBLN2表达在神经元型胶质瘤中显著下调（p<0.0001）。为了进一步验证这一发现，我们对EBLN2表达和神经元型分子亚型进行了ROC分析，比较预测模型的特异性和敏感性，曲线下面积（Area
重庆医科大学博士研究生学位论文26UnderCurve，AUC）为70.3%（图1.3B）。以上结果表明EBLN2低表达可作为预测神经元型GBM的潜在标志物。图1.3AEBLN2在CGGA数据集不同TCGA分子亚型中的表达；BEBLN2表达的ROC曲线可预测CGGA数据集中的Neural亚型。****p<0.0001。Figure1.3EBLN2expressionindifferentTCGAmolecularsubtypesoftheCGGADataset;BROCcurveofEBLN2expressiontopredictNeuralsubtypesintheCGGADataset.****p<0.0001.2.5EBLN2表达高相关基因的功能分析为了探讨EBLN2可能在胶质瘤的发生发展中参与的生物学过程，我们采用Pearson相关分析对CGGA数据集中325例患者的全基因组基因进行分析，富集与EBLN2表达高度相关的基因。结果显示共有767个基因（R>0.6，P<0.05）与EBLN2表达正相关（图1.4A）。我们进一步对与EBLN2表达高相关的基因功能进行GO功能分析（图1.4B和C）。GO功能分析发现，与EBLN2表达高相关的基因生物学功能主要富集在：对血管管径的调节、调节血管大孝血管直径调节、抗原受体介导的信号通路调控、氯离子跨膜转运、被动跨膜转运蛋白活性、G蛋白偶联神经递质受体活性等，提示EBLN2可能通过参与调控肿瘤血管生成途径进而在胶质瘤的发生发展中发挥作用。
本文编号：3440553
【文章来源】：重庆医科大学重庆市
【文章页数】：119 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
EBLN2在胶质瘤中的表达水平及与患者预后生存关系
重庆医科大学博士研究生学位论文25图1.2EBLN2在胶质瘤常见突变基因病人中的表达AEBLN2在IDH突变的胶质瘤患者中低表达；BEBLN2在EGFR突变的胶质瘤患者中的表达；CEBLN2在ATRX突变胶质瘤患者中的表达；DEBLN2在TP53突变的胶质瘤患者中的表达。*p<0.05，nsp>0.05。Figure1.2EBLN2expressioninpatientswithgliomacommonmutationgenes.AEBLN2lowexpressioninIDH-mutatedgliomapatients;BEBLN2expressioninEGFR-mutatedgliomapatients;CEBLN2expressioninATRXmutantgliomapatients;DEBLN2expressioninTP53mutantgliomapatients.*p<0.05,nsp>0.05.2.4EBLN2可作为预测神经元型GBM的潜在标志物为进一步探讨EBLN2在胶质瘤中表达分布特点，我们评估了TCGA基于基因表达及改变情况定义的GBM的四种分子亚型：经典型(classical)、神经元型(neural)、间质型(mesenchymal)和前神经元型(proneural)中EBLN2的表达模式。结果（图1.3A）显示，在CGGA数据集中，与其他亚型相比EBLN2表达在神经元型胶质瘤中显著下调（p<0.0001）。为了进一步验证这一发现，我们对EBLN2表达和神经元型分子亚型进行了ROC分析，比较预测模型的特异性和敏感性，曲线下面积（Area
重庆医科大学博士研究生学位论文26UnderCurve，AUC）为70.3%（图1.3B）。以上结果表明EBLN2低表达可作为预测神经元型GBM的潜在标志物。图1.3AEBLN2在CGGA数据集不同TCGA分子亚型中的表达；BEBLN2表达的ROC曲线可预测CGGA数据集中的Neural亚型。****p<0.0001。Figure1.3EBLN2expressionindifferentTCGAmolecularsubtypesoftheCGGADataset;BROCcurveofEBLN2expressiontopredictNeuralsubtypesintheCGGADataset.****p<0.0001.2.5EBLN2表达高相关基因的功能分析为了探讨EBLN2可能在胶质瘤的发生发展中参与的生物学过程，我们采用Pearson相关分析对CGGA数据集中325例患者的全基因组基因进行分析，富集与EBLN2表达高度相关的基因。结果显示共有767个基因（R>0.6，P<0.05）与EBLN2表达正相关（图1.4A）。我们进一步对与EBLN2表达高相关的基因功能进行GO功能分析（图1.4B和C）。GO功能分析发现，与EBLN2表达高相关的基因生物学功能主要富集在：对血管管径的调节、调节血管大孝血管直径调节、抗原受体介导的信号通路调控、氯离子跨膜转运、被动跨膜转运蛋白活性、G蛋白偶联神经递质受体活性等，提示EBLN2可能通过参与调控肿瘤血管生成途径进而在胶质瘤的发生发展中发挥作用。
本文编号：3440553
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