口腔及肠道菌群与胃癌化疗的基础与临床研究初探
发布时间：2021-11-04 00:18
研究背景:人体共生菌群的相关研究尚在初级阶段,“正常菌群”范畴仍不清晰,但已能够筛选出大量与疾病相关的微生物。胃癌相关的菌群研究集中在胃部和幽门螺杆菌,近期研究提示了其他细菌也可能参与胃癌的发生发展,口腔可能是某些致病菌的储存地,结肠菌群与恶性肿瘤的化疗敏感性和毒副作用有关。为了确定胃癌病人的菌群与健康人相比有何特点,以及化疗、营养治疗对菌群的影响,我们设计了临床研究和随机对照动物实验,对胃癌病人的口腔与粪便菌群、化疗病人及小鼠的粪便菌群进行初探,试图寻找与疾病、化疗副反应相关的菌种。第一部分正常人与胃癌病人的消化道菌群差异目的:探究健康人与胃癌病人唾液、粪便菌群差异方法:收集健康对照组（n=26）与初诊胃癌病人（n=19）的唾液、粪便样本,对其中细菌的16S rDNAV3-V4进行提取、测序,OTU聚类后对比在线数据库Silva 132进行物种注释,分析4组样本物种组成特点与差异。结果:唾液、粪便中的细菌均主要由厚壁菌门（50%-70%）、拟杆菌门（15-20%）、变形菌门（9-18%）、放线菌门（2-9%）组成。相比健康人,胃癌组唾液中的放线菌科、消化链球菌科丰度更高,胃癌组粪便中...
【文章来源】：北京协和医学院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章页数】：110 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１．１胃癌组、健康对照组唾液及粪便的ＯＴＵ重叠情况??注：①Ｈｓａｉ－健康对照组唾液，Ｈｆｅｃ－健康对照组粪便，ＧＣｓａｌ－胃癌组唾液，ＧＣｆｅｃ－胃癌组??
图１．２胃癌组、健康对照组唾液及粪便样本的稀释性曲线??（２）?ａ多样性指数??将全部样本按照样本最低序列数进行抽平，然后计算其ａ多样性指数（结果??见表１．４）。８９个样本的文库覆盖率（ｇｏｏｄｓ＿ｃｏｖｅｒａｇｅ）均在９９％以上，说明??此测序量己经可以使物种数量达到饱和，对每个样本的代表性较好。????表１．４各样本物种数量及物种多样性指数???样本名称?ｃｈａｏｌ?ｇｏｏｄｓ＿ｃｏｖｅｒａｇｅ?ｏｂｓｅｒｖｅｄ＿ｓｐｅｃｉｅｓ?ｓｈａｎｎｏｎ??
Ｃｌａｓｓｉｆｉｅｒ算法将每个ＯＴＵ的代表序列归类到相应物种，并进行样本中每个物种??相对丰度的计算。??图１．６至图１．１１展示了门水平上４组样本的平均物种丰度（只显示相对丰??度＞１％的物种）。在门水平上，唾液、粪便中的细菌均主要由厚壁菌门??（Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ）、拟杆菌门（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｔｅｓ）、变形菌门（Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ）、??放线菌门（Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ）组成，这４个菌门总相对丰度之和超过９０％。厚壁??菌门是丰度最高的物种，在唾液和粪便中的相对丰度都占据支配地位（唾液中接??近４８．８０％，粪便中７１．８２％）。丰度次高的物种是拟杆菌门，在粪便及唾液中??相对丰度达到１５－２０％。变形菌门、放线菌门的丰度紧随其后，分别占９－１８％和??２－９％。??Ｈｓａｌ??ｐ一Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ?ｐ＿Ｐａｔｅｓｃｉｂａｃｔｅｒｉａ?＃?ｐ＿Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ?ｐ—Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｔｅｓ?ｐ—Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉａ??ｐ一Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ?＃?ｏｔｈｅｒ??ｏｔｈｅｒ．?０．９２％?ｐ—Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ：?８．６１％??ｐ＿Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ：?１７．５１％?ｙＰ＿Ｐａｔｅｓｃｉｂａｃｔｅｒｉａ：?１．７３％??ｊ?ｊｉｋ??ｐ＿Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｔｅｓ：?１９．２１％??ｐ＿Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ：?４８．８０％??图１．６健康对照组唾液菌群的物种组成（门水平）??３０??
【参考文献】：
期刊论文
[1]中国城市癌症早诊早治项目进展[J]. 陈万青,李霓,石菊芳,任建松,陈宏达,李江,代敏,赫捷. 中国肿瘤. 2019(01)
[2]接纳与承诺疗法在胃癌根治术后化疗患者中的应用效果[J]. 吴雪,闵贝贝. 中华现代护理杂志. 2018 (29)
[3]营养支持对肠道菌群与肠黏膜免疫的影响[J]. 王继伟,王新颖. 肠外与肠内营养. 2017(05)
[4]人类口腔微生物组学研究:现状、挑战及机遇[J]. 周学东,徐健,施文元. 微生物学报. 2017(06)
[5]化疗药物对胃癌患者肠道菌群谱的影响及益生菌干预作用的临床研究[J]. 许春进,韩敏,徐峰,王胜. 中华消化病与影像杂志(电子版). 2016(04)
[6]恶性肿瘤患者死亡焦虑与焦虑、抑郁的相关性研究[J]. 丁娜,胡成文,陶艳,陈淑娟. 医学与哲学（B）. 2015(09)
[7]100例肿瘤患者的抑郁焦虑情绪调查分析[J]. 彭娟,周录娇,周航,殷茜. 重庆医学. 2015(14)
[8]胃黏膜菌群与幽门螺杆菌的相关性[J]. 刘素梅,王正强,于新娟,王莉莉,贾盛佼,董全江. 中国微生态学杂志. 2014(05)
[9]莫匹罗星锂盐改良MRS检测双歧杆菌的应用研究[J]. 蔡芷荷,宋曼丹,周蔼怡,陈秋霞,严纪文,朱海明,帅惠萍,苏丽春,何天文. 中国卫生检验杂志. 2011(06)
[10]ZUNG氏抑郁自评量表（SDS）作为外科住院患者抑郁障碍常规筛查工具的可行性研究[J]. 王汝展,刘兰芬,葛红敏,韩建波. 精神医学杂志. 2009(04)
博士论文
[1]肥胖对肠屏障和炎症的影响及干预研究[D]. 曹战江.北京协和医学院 2014
[2]合生元对胃肠手术后肠粘膜屏障功能保护作用的基础与临床研究[D]. 赵明利.北京协和医学院 2009
硕士论文
[1]肿瘤相关抑郁、焦虑的发生及影响因素研究[D]. 李丹.河北医科大学 2015
[2]胃癌化疗期患者心理困扰影响因素及预实验干预研究[D]. 金梅.安徽医科大学 2015
本文编号：3474621
【文章来源】：北京协和医学院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章页数】：110 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１．１胃癌组、健康对照组唾液及粪便的ＯＴＵ重叠情况??注：①Ｈｓａｉ－健康对照组唾液，Ｈｆｅｃ－健康对照组粪便，ＧＣｓａｌ－胃癌组唾液，ＧＣｆｅｃ－胃癌组??
图１．２胃癌组、健康对照组唾液及粪便样本的稀释性曲线??（２）?ａ多样性指数??将全部样本按照样本最低序列数进行抽平，然后计算其ａ多样性指数（结果??见表１．４）。８９个样本的文库覆盖率（ｇｏｏｄｓ＿ｃｏｖｅｒａｇｅ）均在９９％以上，说明??此测序量己经可以使物种数量达到饱和，对每个样本的代表性较好。????表１．４各样本物种数量及物种多样性指数???样本名称?ｃｈａｏｌ?ｇｏｏｄｓ＿ｃｏｖｅｒａｇｅ?ｏｂｓｅｒｖｅｄ＿ｓｐｅｃｉｅｓ?ｓｈａｎｎｏｎ??
Ｃｌａｓｓｉｆｉｅｒ算法将每个ＯＴＵ的代表序列归类到相应物种，并进行样本中每个物种??相对丰度的计算。??图１．６至图１．１１展示了门水平上４组样本的平均物种丰度（只显示相对丰??度＞１％的物种）。在门水平上，唾液、粪便中的细菌均主要由厚壁菌门??（Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ）、拟杆菌门（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｔｅｓ）、变形菌门（Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ）、??放线菌门（Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ）组成，这４个菌门总相对丰度之和超过９０％。厚壁??菌门是丰度最高的物种，在唾液和粪便中的相对丰度都占据支配地位（唾液中接??近４８．８０％，粪便中７１．８２％）。丰度次高的物种是拟杆菌门，在粪便及唾液中??相对丰度达到１５－２０％。变形菌门、放线菌门的丰度紧随其后，分别占９－１８％和??２－９％。??Ｈｓａｌ??ｐ一Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ?ｐ＿Ｐａｔｅｓｃｉｂａｃｔｅｒｉａ?＃?ｐ＿Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ?ｐ—Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｔｅｓ?ｐ—Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉａ??ｐ一Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ?＃?ｏｔｈｅｒ??ｏｔｈｅｒ．?０．９２％?ｐ—Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ：?８．６１％??ｐ＿Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ：?１７．５１％?ｙＰ＿Ｐａｔｅｓｃｉｂａｃｔｅｒｉａ：?１．７３％??ｊ?ｊｉｋ??ｐ＿Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｔｅｓ：?１９．２１％??ｐ＿Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ：?４８．８０％??图１．６健康对照组唾液菌群的物种组成（门水平）??３０??
【参考文献】：
期刊论文
[1]中国城市癌症早诊早治项目进展[J]. 陈万青,李霓,石菊芳,任建松,陈宏达,李江,代敏,赫捷. 中国肿瘤. 2019(01)
[2]接纳与承诺疗法在胃癌根治术后化疗患者中的应用效果[J]. 吴雪,闵贝贝. 中华现代护理杂志. 2018 (29)
[3]营养支持对肠道菌群与肠黏膜免疫的影响[J]. 王继伟,王新颖. 肠外与肠内营养. 2017(05)
[4]人类口腔微生物组学研究:现状、挑战及机遇[J]. 周学东,徐健,施文元. 微生物学报. 2017(06)
[5]化疗药物对胃癌患者肠道菌群谱的影响及益生菌干预作用的临床研究[J]. 许春进,韩敏,徐峰,王胜. 中华消化病与影像杂志(电子版). 2016(04)
[6]恶性肿瘤患者死亡焦虑与焦虑、抑郁的相关性研究[J]. 丁娜,胡成文,陶艳,陈淑娟. 医学与哲学（B）. 2015(09)
[7]100例肿瘤患者的抑郁焦虑情绪调查分析[J]. 彭娟,周录娇,周航,殷茜. 重庆医学. 2015(14)
[8]胃黏膜菌群与幽门螺杆菌的相关性[J]. 刘素梅,王正强,于新娟,王莉莉,贾盛佼,董全江. 中国微生态学杂志. 2014(05)
[9]莫匹罗星锂盐改良MRS检测双歧杆菌的应用研究[J]. 蔡芷荷,宋曼丹,周蔼怡,陈秋霞,严纪文,朱海明,帅惠萍,苏丽春,何天文. 中国卫生检验杂志. 2011(06)
[10]ZUNG氏抑郁自评量表（SDS）作为外科住院患者抑郁障碍常规筛查工具的可行性研究[J]. 王汝展,刘兰芬,葛红敏,韩建波. 精神医学杂志. 2009(04)
博士论文
[1]肥胖对肠屏障和炎症的影响及干预研究[D]. 曹战江.北京协和医学院 2014
[2]合生元对胃肠手术后肠粘膜屏障功能保护作用的基础与临床研究[D]. 赵明利.北京协和医学院 2009
硕士论文
[1]肿瘤相关抑郁、焦虑的发生及影响因素研究[D]. 李丹.河北医科大学 2015
[2]胃癌化疗期患者心理困扰影响因素及预实验干预研究[D]. 金梅.安徽医科大学 2015
本文编号：3474621
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