p65/MIR17HG信号网络在结直肠癌发生发展中的免疫调控机制研究
发布时间：2021-11-12 11:54
研究背景与目的结直肠癌（Colorectal cancer,CRC）是世界上仅次于肺癌和乳腺癌的第三大常见肿瘤,在我国结直肠癌发病率和死亡率呈逐步上升趋势,位列恶性肿瘤发病及死亡第五位。深入研究结直肠癌发生发展的机制,是早期发现、早期诊断和早期治疗、降低结直肠癌发病率和死亡率的关键。越来越多的研究表明,长链非编码RNA（lncRNA）与结直肠癌的发生发展密切相关。但大部分传统的生物学研究仅以单个lncRNA的功能为重点,很难对生物系统的整体进行更为全面的阐述。因此,lncRNA在结直肠癌发生、发展中的具体机制仍需要进一步探讨。本课题利用加权基因共表达网络分析（Weighted gene co-expression network analysis,WGCNA）方法探索与结直肠癌发生发展密切相关的基因模块,并通过构建转录因子调控网络等策略筛选与结直肠癌相关的关键lncRNA分子MIR17HG,探讨lncRNA MIR17HG对结直肠癌细胞生物学表型的影响及分子机制,同时对lncRNA MIR17HG在结直肠癌免疫治疗中的作用及可能机制进行了初步的探索。为阐明结直肠癌发病机制、发现结直肠癌...
【文章来源】：东南大学江苏省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：174 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１－３结直肠组织祥本差异ＩｎｃＲＮＡ火山图??（Ｘ轴表示差异倍数，Ｙ轴表示Ｐ值，红色部分基固表示尸＜?０．０５，变化倍数为２??
?东南大学博士学位论文???１－４）。与ｉＢ常组织相比，在结直肠腺瘤组织中上调的ＩｎｃＲＮＡ共１，００９条，ｍＲＮＡ??共９５７条；下调的ＩｎｃＲＮＡ共９５６条，ｍＲＮＡ共１，１７７条。与常组织相比，在??结直肠癌组织中上调的ＩｎｃＲＮＡ共３６７条，ｍＲＮＡ共１，６３１条，下调的ＩｎｃＲＮＡ??共７４８条，ｍＲＮＡ共Ｗ１条。??Ａ?Ｂ??ＣＯ??？?■?．．?００??一①?．??０?？?．?？？？？？？？？?（Ｉ）??５?３?０?２?４?６￣?－６?－４?－２?０?２?４?６??ｌｏｇ２ＦｏｌｄＣｈａｎｇｅ?ｌｏｇ２ＦｏｌｄＣｈａｎｇｅ??图１－３结直肠组织祥本差异ＩｎｃＲＮＡ火山图??（Ｘ轴表示差异倍数，Ｙ轴表示Ｐ值，红色部分基固表示尸＜?０．０５，变化倍数为２??倍。Ａ为结直肠癌组织ＫＳ■．正常组织，Ｂ为结直肠腺瘤组织ＫＳ■．正常组织）??Ａ?Ｂ??Ｏ??００?■??．寸－．ｖ?ｖ＇ｌＳ?■?Ｓ＇?＇?Ｐ；?－?？??图１－４结直肠组织样本差异ｍＲＮＡ火山图??（Ｘ轴表示差异倍数，Ｙ轴表示Ｐ值，红色部分基因表示Ｐ＜?０．０５，变化倍数为２??倍＾?Ａ为结直肠癌组织ＶＳ．正常组织，Ｂ为结直肠腺瘤组织ＫＳ■．正常组织）??１８??
?．第鑕麗肠癌ＩｎｃＲＮＡ与ｍＲＮＡ：！；片的生物慎擧学分析???２结果??２．１加权基因，共表达网络分析??２．１．１离群样本删除的去除??图１－５表示样本聚类分析结果及对应临床信息。Ｏｕｔｌｉｅｒ为红色，表示样本连??接度筛选阈值小于－２．５，需踢出；黑色表示样本连接度筛选阈值大于－２．５，无需剔??除。由图可见，未发现明显离群样本，所有样本可进行后续分析分组为红色表??示为结直肠腺瘤组，粉红色为结直肠癌组织，Ｓ色为结直肠癌患者癌旁组织。性??别红色表示男性，白色表示女性。年龄越大，颜色越深。??Ｓａｍｐｌｅ?ｄｅｎｄｒｏｇｒａｍ?ａｎｄ?ｔｒａｉｔ?ｈｅａｔｍａｐ??卜??ｄ?￣｜????ＣＤ?＿?????ｄ?－??ｉｎ?＿??ｏ?￣??寸?—?????ｄ?￣??Ｓ＞?ｏ?￣?Ｉ—??Ｘ?Ｉ?ｏｏ??＾?－?丨?ｊ—ｉ—．?召???１??５?－?ｒｉ?Ｉ?＾?＾＾１?Ａ??ＩＩ?ｚ?ｗ?＾?ｐＵ?｜?ｒｎ??§?Ｊ§?ｉ?㈥?ｈ?ｉ?Ｊ?＾??Ｚ?Ｚ?ａ?闵?１１?１?１?＾?＾?〇??ｒｏ?（〇?〇）?ｉｎ?ｏ?ｃｏ?Ｏ?ｗ??〇?〇?Ｐ芑?云芑?°??Ｏｕｔｌｉｅｒ??Ｇｒｏｕｐ??■?■Ｉ?ｊ?Ｍｌ??＾?ｉｓ?Ｉ?ｅ?ｉ＾ｒ??图１－５结直肠组织样本聚类结果及对应样本信息??２．１．２软阈值筛选??利＿＿厨Ｐｉｃｋｓｏｆｔｔｈｒｅｓｈｏｌｄ涵数计算满足无，Ｒ慶分布构建需求．的软阈值参数Ｐ。??图１－６?Ａ?＆示不同软阈值对应的ｌｏｇ（ｋ）和ｌｏｇ（ｐ（ｋ））的相关系数的平方即ＳＦＴ．Ｒｓｑ?
【参考文献】：
期刊论文
[1]Genetic and epigenetic biomarkers for diagnosis, prognosis and treatment of colorectal cancer[J]. Fabio Coppedè,Angela Lopomo,Roberto Spisni,Lucia Migliore. World Journal of Gastroenterology. 2014(04)
本文编号：3490862
【文章来源】：东南大学江苏省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：174 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１－３结直肠组织祥本差异ＩｎｃＲＮＡ火山图??（Ｘ轴表示差异倍数，Ｙ轴表示Ｐ值，红色部分基固表示尸＜?０．０５，变化倍数为２??
?东南大学博士学位论文???１－４）。与ｉＢ常组织相比，在结直肠腺瘤组织中上调的ＩｎｃＲＮＡ共１，００９条，ｍＲＮＡ??共９５７条；下调的ＩｎｃＲＮＡ共９５６条，ｍＲＮＡ共１，１７７条。与常组织相比，在??结直肠癌组织中上调的ＩｎｃＲＮＡ共３６７条，ｍＲＮＡ共１，６３１条，下调的ＩｎｃＲＮＡ??共７４８条，ｍＲＮＡ共Ｗ１条。??Ａ?Ｂ??ＣＯ??？?■?．．?００??一①?．??０?？?．?？？？？？？？？?（Ｉ）??５?３?０?２?４?６￣?－６?－４?－２?０?２?４?６??ｌｏｇ２ＦｏｌｄＣｈａｎｇｅ?ｌｏｇ２ＦｏｌｄＣｈａｎｇｅ??图１－３结直肠组织祥本差异ＩｎｃＲＮＡ火山图??（Ｘ轴表示差异倍数，Ｙ轴表示Ｐ值，红色部分基固表示尸＜?０．０５，变化倍数为２??倍。Ａ为结直肠癌组织ＫＳ■．正常组织，Ｂ为结直肠腺瘤组织ＫＳ■．正常组织）??Ａ?Ｂ??Ｏ??００?■??．寸－．ｖ?ｖ＇ｌＳ?■?Ｓ＇?＇?Ｐ；?－?？??图１－４结直肠组织样本差异ｍＲＮＡ火山图??（Ｘ轴表示差异倍数，Ｙ轴表示Ｐ值，红色部分基因表示Ｐ＜?０．０５，变化倍数为２??倍＾?Ａ为结直肠癌组织ＶＳ．正常组织，Ｂ为结直肠腺瘤组织ＫＳ■．正常组织）??１８??
?．第鑕麗肠癌ＩｎｃＲＮＡ与ｍＲＮＡ：！；片的生物慎擧学分析???２结果??２．１加权基因，共表达网络分析??２．１．１离群样本删除的去除??图１－５表示样本聚类分析结果及对应临床信息。Ｏｕｔｌｉｅｒ为红色，表示样本连??接度筛选阈值小于－２．５，需踢出；黑色表示样本连接度筛选阈值大于－２．５，无需剔??除。由图可见，未发现明显离群样本，所有样本可进行后续分析分组为红色表??示为结直肠腺瘤组，粉红色为结直肠癌组织，Ｓ色为结直肠癌患者癌旁组织。性??别红色表示男性，白色表示女性。年龄越大，颜色越深。??Ｓａｍｐｌｅ?ｄｅｎｄｒｏｇｒａｍ?ａｎｄ?ｔｒａｉｔ?ｈｅａｔｍａｐ??卜??ｄ?￣｜????ＣＤ?＿?????ｄ?－??ｉｎ?＿??ｏ?￣??寸?—?????ｄ?￣??Ｓ＞?ｏ?￣?Ｉ—??Ｘ?Ｉ?ｏｏ??＾?－?丨?ｊ—ｉ—．?召???１??５?－?ｒｉ?Ｉ?＾?＾＾１?Ａ??ＩＩ?ｚ?ｗ?＾?ｐＵ?｜?ｒｎ??§?Ｊ§?ｉ?㈥?ｈ?ｉ?Ｊ?＾??Ｚ?Ｚ?ａ?闵?１１?１?１?＾?＾?〇??ｒｏ?（〇?〇）?ｉｎ?ｏ?ｃｏ?Ｏ?ｗ??〇?〇?Ｐ芑?云芑?°??Ｏｕｔｌｉｅｒ??Ｇｒｏｕｐ??■?■Ｉ?ｊ?Ｍｌ??＾?ｉｓ?Ｉ?ｅ?ｉ＾ｒ??图１－５结直肠组织样本聚类结果及对应样本信息??２．１．２软阈值筛选??利＿＿厨Ｐｉｃｋｓｏｆｔｔｈｒｅｓｈｏｌｄ涵数计算满足无，Ｒ慶分布构建需求．的软阈值参数Ｐ。??图１－６?Ａ?＆示不同软阈值对应的ｌｏｇ（ｋ）和ｌｏｇ（ｐ（ｋ））的相关系数的平方即ＳＦＴ．Ｒｓｑ?
【参考文献】：
期刊论文
[1]Genetic and epigenetic biomarkers for diagnosis, prognosis and treatment of colorectal cancer[J]. Fabio Coppedè,Angela Lopomo,Roberto Spisni,Lucia Migliore. World Journal of Gastroenterology. 2014(04)
本文编号：3490862
本文链接：https://www.wllwen.com/shoufeilunwen/yxlbs/3490862.html
教材专著
