血清microRNA在结肠癌中表达变化的临床研究

发布时间：2021-11-28 03:07

　　第一部分结肠癌患者血清差异表达miRNAs的初步筛选目的:通过芯片初步筛选结肠癌患者血清中差异表达的miRNAs。方法:采用中国科学院苏州纳米技术与纳米仿生研究所开发的miRNA Uni Tag?微阵列芯片,检测3例结肠癌患者血清样本和3例健康对照血清中miRNAs的表达情况,分析结肠癌血清中差异表达的miRNAs。结果:miRNA Uni Tag?微阵列芯片杂交结果显示,根据改变倍数≧1.5且P值<0.05筛选在结肠癌患者血清中差异表达的miRNAs。结肠癌患者共有87种血清miRNAs差异表达,其中上调表达有39个,下调表达有48个。结论:成功筛选出结肠癌患者血清中差异表达miRNAs。第二部分初步评价血清miRNA表达谱在结肠癌诊断和预后判断中的作用目的:初步探讨血清miRNA表达谱在结肠癌诊断和预后判断中的作用。方法:（1）采用Real-time PCR对芯片中差异表达最明显（表达变化前5位）的miRNAs在训练集（40例结肠癌患者vs.40例正常对照）和验证集（60例结肠癌患者vs.60例正常对照）中进行验证,构建结肠癌血清miRNA表达谱。（2）对血清miRNA表达谱... 

【文章来源】：苏州大学江苏省 211工程院校

【文章页数】：110 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

miRNAUniTag微阵列芯片探针差异倍数柱状图

第一部分血清microRNA在结肠癌中表达变化的临床研究8如图1所示为miRNAUniTag微阵列芯片所有基因探针与分组比对中的信号差异情况。图中横坐标通过log2代表差异的倍数，纵坐标为探针数目。通常来讲，其分布应该为正态分布，即比对中的上/下调基因基本一致。在本次实验中，结肠癌组/正常对照组的上/下调基因大致相当，表明本芯片的检测结果较理想。3miRNAUniTag微阵列芯片结肠癌对比正常对照血清组的差异表达基因火山图(见图2)图2miRNAUniTag微阵列芯片结肠癌/正常对照血清的火山图图2所示为分组比对中差异基因探针的分布。横坐标表示差异倍数（Foldchange,log2），纵坐标以-log(p值)进行表示，代表差异的显著性。蓝色和红色虚线表示p值及倍数筛选的阈值。图中各点分别代表一个检出的基因探针（除了控制探针及flagged探针之外）。结肠癌组/正常对照组的差异表达基因筛选阈值为Foldchange绝对值≧1.5（红线），且P-value＜0.05（蓝线），差异探针为左上方和右上方的点。4结肠癌患者血清中差异表达的miRNA的芯片表达谱通过数据的对比分析可知，按照改变倍数大于等于1.5且P值小于0.05来做为筛选，相比正常血清样品，结肠癌患者的血清中存在差异表达的miRNA，一共有87种，其中上调表达有39个，下调表达有48个（见表3）。采用层次聚类（hierarchicalclusteringanalysis）分析，对差异表达的87种miRNA绘制热图，结果见图3，表3。

血清microRNA在结肠癌中表达变化的临床研究第一部分9图33例结肠癌患者血清标本，3例正常人血清标本miRNA芯片结果热图，绿色表示miRNA低表达，红色表示miRNA高表达。（筛选条件为改变倍数大于等于1.5倍，P值<0.05,Ca:结肠癌血清T：正常人血清）


本文编号：3523579