抑郁症外周血特异lncRNAs的筛选与验证

发布时间：2017-05-21 20:09

  本文关键词：抑郁症外周血特异lncRNAs的筛选与验证，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：目的:抑郁症是人类常见的精神障碍之一,其发病及病理机制迄今未明。非编码RNA作为重要的表观遗传学调控机制之一,在其中发挥重要作用。长链非编码RNA(lncRNA)是一种数量最多、具有强大的基因调控功能的非编码RNA。研究显示,lncRNA参与神经可塑性调节,同时在其他精神疾病中存在异常表达,结合“抑郁症是一种神经可塑性障碍的精神疾病”的既往发现,我们提出“抑郁症存在异常的lncRNAs表达及调控”的科学假说。本研究中,我们在抑郁症外周血中开展了对抑郁症特异lncRNAs的筛选及验证工作。方法:1.初筛差异lncRNAs:收集抑郁症与正常对照各10例,在其外周血中利用生物芯片进行lncRNAs与mRNAs的表达谱分析,筛选出组间差异的lncRNAs与mRNAs;2.确定候选lncRNAs:通过构建差异lncRNAs与m RNAs的共表达网络,确定抑郁症的候选lncRNAs;3.验证特异lncRNAs:选择抗抑郁疗效确切的抑郁症及对照各27例,分析候选lncRNAs在患者治疗前后的表达变化及与临床指标的相关性,确定抑郁症特异lncRNAs。结果:1.初筛差异lncRNAs:1)芯片初筛结果发现抑郁症存在特异的lncRNAs和mRNAs表达谱。患者组与对照组相比,共发现2007条差异lncRNAs有统计学意义(p0.05),其中包括1556条上调lncRNAs和441条下调lncRNAs。此外,有1799条差异lncRNAs为反义lncRNA。同时发现1766条差异mRNAs有统计学意义(p0.05),其中包括759条上调mrnas和1007条下调mrnas。2)为了对芯片检测的准确性进行验证,我们在原样本中对lncrna-fr344886,chr21:39641845-39641964,chr17:78355675-78355935,chr17:78354412-78354623进行realtimepcr检测,结果显示与芯片结果基本一致。2.确定候选lncrnas:1)建立差异lncrnas和mrnas的共表达网络(r≥o.94),病例组共纳入125条lncrnas与374条mrnas,形成499个节点和1050对相关关系,其中包括802个负相关关系对和248个正相关关系对;对照组共纳入111条lncrnas与193条mrnas,形成304个节点和415对相关关系,其中包括346个负相关关系对和70个正相关关系对。可见,病例组中mrnas与lncrnas的相互调控关系更加复杂,两组中mrnas与lncrnas的负性调控占主导作用。2)在以上共表达网络中筛选既往报道与抑郁相关的mrnas,将与其存在共表达关系的lncrnas作为抑郁症的候选lncrnas。在进一步构建的抑郁相关差异mrnas与lncrnas的共表达子网络中,将病例组中“度”最高的lncrnaschr10:874695-874794,chr10:75873456-75873642,chr3:47048304-47048512,确定为抑郁症的候选lncrnas。3)此外,对差异mrnas的go与pathway分析发现,抑郁症的差异基因主要与物质新陈代谢的基本过程与神经发育障碍疾病有关。3.验证特异lncrnas:另外收集抑郁症患者50例,选择抗抑郁疗效确定的27例,在其治疗8周前后的外周血中,检测三个候选lncrnas的表达变化,并分析其与临床特征的关系。结果显示,与对照组相比,患者组在治疗前lncrnachr10:874695-874794表达明显降低(p=0.0001),而治疗后明显升高(p=0.001);同时发现治疗前后的表达水平均与hamd总分呈负相关(r=-0.588,p=0.001;r=-0.552,p=0.003);治疗前的表达水平与患者注意功能呈正相关(r=-0.61,p=0.003)。chr10:75873456-75873642的表达水平虽然在治疗前与对照组无明显差异,但在治疗后明显升高(p=0.005),且与治疗后即刻记忆呈正相关。结论:本研究首次发现抑郁症外周血中存在特异的lncRNAs表达谱,并通过与mRNAs的共表达分析确定了抑郁症相关的候选lncRNAs,经临床验证后发现lncRNA chr10:874695-874794参与了抑郁症的发病及治疗过程,并与抑郁严重程度及注意功能相关。这一发现将为抑郁症发病机制的研究提供新的思路和参考依据。未来需要扩大样本及通过功能学实验进一步验证。
【关键词】：抑郁症 长链非编码RNA 生物芯片 共表达
【学位授予单位】：山西医科大学
【学位级别】：博士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R749.4
【目录】：

• 中文摘要5-8
• 英文摘要8-11
• 常用缩写词中英文对照表11-13
• 前言13-31
• 1 材料与方法31-47
• 1.1 临床资料收集及评定31-33
• 1.2 实验室研究材料33-36
• 1.3 实验方法36-47
• 2 结果47-71
• 2.1 外周血lncRNA与mRNA的芯片扫描结果47-52
• 2.2 差异mRNAs与lncRNAs的生物信息学分析52-65
• 2.3 抑郁症特异lncRNAs的临床验证及意义65-71
• 3 讨论71-78
• 3.1 关于研究方法的考虑71-72
• 3.2 抑郁症特异的mRNAs与lncRNAs表达谱分析72-76
• 3.3 抑郁症特异lncRNAs的临床验证及意义76-78
• 4 结论78-80
• 参考文献80-104
• 综述104-112
• 参考文献109-112
• 致谢112-113
• 在学期间承担/参与的科研课题与研究成果113-115
• 个人简历115

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前1条

1 翟金国;陈敏;赵靖平;国效峰;苏中华;王克勤;;山东省抑郁障碍患者的经济负担研究[J];中国卫生经济;2011年10期

  本文关键词：抑郁症外周血特异lncRNAs的筛选与验证，由笔耕文化传播整理发布。

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本文编号：384690