生物力诱导肿瘤再生细胞形成机制研究
发布时间:2023-10-21 10:47
力学微环境会随着肿瘤生长和发展改变并对肿瘤产生影响,胞外基质的力学性质既能影响肿瘤恶性表型,又能促进肿瘤的进程,影响肿瘤的侵袭转移。利用软纤维蛋白胶构建的体外三维培养系统可以高效的筛选出具有自我更新能力的高致瘤性肿瘤再生细胞(Tumor repopulating cells,TRCs)。肿瘤再生细胞已经在抗癌药物的筛选、肿瘤免疫治疗等研究中崭露头角,细胞应力纤维骨架、Sox 2基因表达、组蛋白甲基化水平等因素都对肿瘤再生细胞的形成有重要影响,但力学微环境影响肿瘤再生细胞形成的机制并没有系统的阐明。本课题以人类肿瘤细胞系HeLa细胞为研究对象,对肿瘤再生细胞形成的时序性样本进行转录组测序(RNA-Seq,miRNA-Seq)及全基因组DNA甲基化测序,并构建转录因子、miRNA、靶基因的共调控网络,结合差异表达基因的GO和KEGG通路的富集分析,寻找肿瘤再生细胞形成中关键的转录因子、miRNA及通路,并结合实验验证系统探讨生物力诱导肿瘤再生细胞形成的可能机制。主要研究内容及结果如下:(1)在90 Pa三维软胶中培养的肿瘤再生细胞与普通平板培养的细胞相比,具有更强的侵袭转移能力,并且干性基...
【文章页数】:142 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
摘要
Abstract
1 绪论
1.1 引言
1.2 肿瘤力学微环境
1.3 肿瘤再生细胞
1.4 生物信息学研究细胞调控分子网络
1.5 本文研究内容
2 生物力诱导肿瘤再生细胞形成
2.1 引言
2.2 材料与仪器
2.3 实验方法
2.4 结果与讨论
2.5 本章小结
3 肿瘤再生细胞形成的差异基因分析
3.1 引言
3.2 实验方法
3.3 结果与讨论
3.4 本章小结
4 肿瘤再生细胞关键基因通路分析
4.1 引言
4.2 材料与仪器
4.3 实验方法
4.4 结果与讨论
4.5 本章小结
5 肿瘤再生细胞中CCT3作用研究
5.1 引言
5.2 材料与仪器
5.3 实验方法
5.4 结果与讨论
5.5 本章小结
6 肿瘤再生细胞中全基因组DNA甲基化动态变化
6.1 引言
6.2 材料与仪器
6.3 实验方法
6.4 结果与讨论
6.5 本章小结
7 总结与展望
7.1 全文总结与讨论
7.2 研究展望
致谢
参考文献
附录 Ⅰ 攻读博士学位期间发表的论文
附录 Ⅱ 主要缩略词表
本文编号:3855683
【文章页数】:142 页
【学位级别】:博士
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摘要
Abstract
1 绪论
1.1 引言
1.2 肿瘤力学微环境
1.3 肿瘤再生细胞
1.4 生物信息学研究细胞调控分子网络
1.5 本文研究内容
2 生物力诱导肿瘤再生细胞形成
2.1 引言
2.2 材料与仪器
2.3 实验方法
2.4 结果与讨论
2.5 本章小结
3 肿瘤再生细胞形成的差异基因分析
3.1 引言
3.2 实验方法
3.3 结果与讨论
3.4 本章小结
4 肿瘤再生细胞关键基因通路分析
4.1 引言
4.2 材料与仪器
4.3 实验方法
4.4 结果与讨论
4.5 本章小结
5 肿瘤再生细胞中CCT3作用研究
5.1 引言
5.2 材料与仪器
5.3 实验方法
5.4 结果与讨论
5.5 本章小结
6 肿瘤再生细胞中全基因组DNA甲基化动态变化
6.1 引言
6.2 材料与仪器
6.3 实验方法
6.4 结果与讨论
6.5 本章小结
7 总结与展望
7.1 全文总结与讨论
7.2 研究展望
致谢
参考文献
附录 Ⅰ 攻读博士学位期间发表的论文
附录 Ⅱ 主要缩略词表
本文编号:3855683
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