胃癌分子分型及AKR1C2与5-FU/DDP敏感性关系的研究

发布时间：2024-12-11 06:08

　　胃癌是一种基因异质性肿瘤,其发生率和死亡率位于消化系统肿瘤的第二位。目前,胃癌的分型以Lauran分型应用最为广泛。随着基因测序技术的发展,新的分型形式如分子分型应势被提出,且随着人们对胃癌分子特征及临床意义的认识的深入,发现目前的分子分型体系并不能满足临床的应用,因此急需新的分型系统去进行补充和完善。另外,胃癌的治疗策略单一,药物靶标少、疗效差,从而使得胃癌的治愈率一直很低。因此本论文主要针对以上两个问题来开展研究。本研究主要利用TCGA分型系统中2014和2018数据集各亚型(CIN,EBV,GS,MSI)的RNA-seq数据,对胃癌中肿瘤与正常样本以及四个亚型间进行差异表达分析,再将各个比较组的差异表达基因进行取交集分析。最终,筛选出了74个在各亚型中具有差异表达,且低突变率的涉及多个生物学过程的基因;另外,这些基因甲基化状态与表达状态呈负相关,且基因之间没有很强的相互作用关系。基于无监督层次聚类的分类方法,利用以上筛选出来的74个差异表达基因将TCGA数据集中的样本分成了三种亚型:A亚型,B亚型和C亚型,而将ACRG数据集中的分成两种亚型:A亚型和B亚型;随后,分别对两数据集中各...

【文章页数】：177 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

图1.2胃癌的分子机制及其生物标志物Figure1.2Molecularmechanismsandbiomarkersingastriccancer

图1.2胃癌的分子机制及其生物标志物Figure1.2Molecularmechanismsandbiomarkersingastriccancer附注：该表格引自2018ASCOEducationalBOOK:WhatWillWeExpectFromNov....

图1.3AKRs家族系统发育树

图1.3AKRs家族系统发育树Figure1.3PhylogenetictreeofhumanAKRs二醇脱氢酶2，与家族成员AKR1C1，AKR1C源性，都位于10号染色体上，它们的序列有8-9个长度一致的内含子组成，因此有学者。通过转录组测序分析AK....

图1.4AKR1C2剪切异构体

图1.4AKR1C2剪切异构体Figure1.4ThespliceisoformsofAKR1C2[129]AKR1C2的表达异常会引起雄性激素分泌紊乱，月经前期综合征及子宫内膜异位等症状，在卵巢和子宫内膜中它的过表达会加快孕酮的代谢，且会促进前列腺癌，膀胱癌，乳....

图2.1TCGA数据库中胃癌样本信息Figure2.1SampleinformationofgastriccancerinTCGAdatabase

第二章74个差异表达基因的筛选癌种及多平台所得的分子分型，在宏观角度解释了各自的特了其具有的临床意义，但是对于临床的应用却是比较困难的太多，且是在不同分子水平上（SNV，CNV，RNA及甲基化素太多且检测指标多和不明确是目前该分子分型在临床应用。因此本章主要目的就是基于以上....

本文编号：4016308