基于高通量测序分析不同硒源对鸡肠道微生物的影响
发布时间：2021-09-22 06:58
硒是人类不可或缺的微元素,它具有增强免疫、清除自由基、预防肿瘤和肝病等功能。硒又分为无机硒和有机硒。无机硒主要是指亚硒酸钠,一种含硒的盐,它有较大的毒性、生物利用率较低,不利于人和动物对硒的吸收。无机硒价格很便宜,因此经常会被添加到动物饲料中,但目前许多国家已禁止在食品中添加亚硒酸钠。有机硒主要以含硒蛋白的形式存在,最常见的是酵母硒,以及近年来新研制出的纳米硒和络合硒。相比无机硒,有机硒的毒性小、利用率高而且不会对环境造成污染,更有利于机体对硒的吸收。本研究从山西省平遥县国青同盈禽业有限公司按照分别饲喂无机硒、酵母硒、纳米硒、络合硒的蛋鸡,检测了8周龄后的多项生理生化指标,并利用高通量测序技术分析肠道微生物多样性。得到的结论如下:（1）在饲喂8周后,饲喂酵母硒的蛋硒沉积量最高,无机硒次之,而络合硒和纳米硒达不到很好的富硒效果。相比无机硒,酵母硒可以显著提高血浆谷胱甘肽过氧化物酶的活性并降低血浆丙二醛含量,具有极佳的抗氧化效果;纳米硒在提升蛋鸡的抗氧化性能方面等同或者优于酵母硒。酵母硒可以显著提高平均蛋重,而对其他指标均无显著影响。不同硒源对蛋重、蛋白高度、蛋黄率、蛋清率和蛋壳率都没有显...
【文章来源】：山西大学山西省
【文章页数】：63 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
ITS高通量测序序列长度分布图
基于高通量测序分析不同硒源对鸡肠道微生物的影响143.3.2稀释性曲线分析sobs指数所对应的稀释曲线不仅能够反映群落的丰富度，还可表明测序数据量的深度情况。将12份样品真菌群落的指数值汇总后，进行稀释曲线的绘制。从图3.2可以看出，抽取数据量不断增大，每组样品所对应的曲线基本趋于平缓，这表明测序的深度足以囊括所有的物种。从该曲线可以看出，只要对每组样品的50000条序列进行测序就可以覆到所有的真菌，而事实上平均每组样品我们分析了69776条序列，因此，本次对12份样品中微生物多样性的分析已基本覆盖整个阶段，结果可信度高。图3.2不同硒源组Alpha多样性指数稀释曲线Figure3.2Alphadiversityindexdilutioncurvesfordifferentseleniumsourcegroups3.3.3Alpha多样性分析sobs指数在这里用来表示实际观测到真菌菌属的数目，由图3.3可知，IS（无机硒）组的sobs指数相较其他三组更高，其菌属的数目也相应较多；IS和NS（纳米硒）组的shannon指数高于YS（酵母硒）和CS（络合硒）组，所以IS和NS组的群落多样性大于其他两组（图3.4）。
第三章蛋鸡粪便样品的真菌多样性分析15图3.3不同硒源组的sobs指数图Figure3.3Sobsindexchartofdifferentseleniumsourcegroups图3.4不同硒源组的shannon指数图Figure3.4Shannonindexofdifferentseleniumsourcegroups3.3.4物种Venn图分析为了比较各样品间真菌组成情况及其组分丰度的差异，将无机硒（IS）、酵母硒（YS）、络合硒（CS）和纳米硒（NS）这4组样品做Venn图分析，由图3.5可知，4组样品分别获得219、181、187、和184个OTU，它们共有的OTU为103个，无机硒（IS）和酵母硒组（YS）共有的OTU数最多，为146个，酵母硒（YS）和纳米硒组（NS）仅共有130个OTU；IS组的独有OTU最多，为44个，而YS组的独有的OTU仅有14个，CS和NS组独有的OTU数较为接近，分别为23和24个。说明向饲料中添加不同硒源时，蛋鸡粪便中的真菌OTU具有一定的差异。
【参考文献】：
期刊论文
[1]饲粮中添加湿基发酵豆粕对蛋鸡产蛋性能、养分代谢率和蛋品质的影响[J]. 李彬,何开蓉,张遨然,胡声迪,富相奎,孙群,朱正鹏. 饲料工业. 2020(05)
[2]纳米硒的生物学功能及在养殖中的应用研究进展[J]. 苏文,杨辉. 饲料研究. 2020(01)
[3]饲料中亚硝酸盐的测定方法分析[J]. 刘晓莉,陈超,唐坤. 广州化工. 2019(23)
[4]硒添加水平对鲤鱼生长性能、硒沉积及抗氧化的影响[J]. 李少觐. 中国饲料. 2019(20)
[5]酵母硒对817肉鸡生产性能和免疫器官指数影响的研究[J]. 王娜. 家禽科学. 2019(10)
[6]发酵饲料对仔鸡肠道微生物群落多样性影响[J]. 张孟阳,毕付提,李洁,郭宏,马鑫,王德培. 中国家禽. 2019(13)
[7]高通量测序研究早期断奶仔猪粪便菌群的结构性差异[J]. 崔君,刘志鹏,殷茵,李留安,金天明,柳巨雄. 中国兽医杂志. 2019(06)
[8]SPF鸡和商品蛋鸡粪便菌群及大肠杆菌抗药性的比较分析[J]. 朱见深,王曦,张印,王怀中,张庆,骆延波,李璐璐,胡明,戴美学,刘玉庆,齐静. 家禽科学. 2019(05)
[9]树鼩肠道菌群多样性与功能预测研究[J]. 杨学芳,李波,郑红,曹雪,王利梅. 安徽农业科学. 2019(08)
[10]不同硒源对蛋鸡蛋品质、血清及蛋黄抗氧化指标的影响[J]. 吉莹利,林雪,杨婷,刘碧凡,王耀东,赵玉蓉. 中国家禽. 2019(08)
硕士论文
[1]硒对蛋鸡生产性能、血清生化指标及组织硒含量的影响[D]. 石雕.西北农林科技大学 2019
[2]基于高通量测序研究铜、汞和铅对鸡盲肠微生物多样性的影响[D]. 刘国辉.江西农业大学 2017
[3]蛋鸡肠道微生物菌群结构特征与产蛋水平关联性研究[D]. 张亚楠.河南农业大学 2016
[4]饲粮中添加益生菌对蛋鸡早期生长、养分利用及肠道菌群的影响[D]. 行浩.扬州大学 2016
[5]不同硒源对鸡生长性能、抗氧化和肉品质的影响[D]. 杨志勇.南京农业大学 2014
本文编号：3403344
【文章来源】：山西大学山西省
【文章页数】：63 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
ITS高通量测序序列长度分布图
基于高通量测序分析不同硒源对鸡肠道微生物的影响143.3.2稀释性曲线分析sobs指数所对应的稀释曲线不仅能够反映群落的丰富度，还可表明测序数据量的深度情况。将12份样品真菌群落的指数值汇总后，进行稀释曲线的绘制。从图3.2可以看出，抽取数据量不断增大，每组样品所对应的曲线基本趋于平缓，这表明测序的深度足以囊括所有的物种。从该曲线可以看出，只要对每组样品的50000条序列进行测序就可以覆到所有的真菌，而事实上平均每组样品我们分析了69776条序列，因此，本次对12份样品中微生物多样性的分析已基本覆盖整个阶段，结果可信度高。图3.2不同硒源组Alpha多样性指数稀释曲线Figure3.2Alphadiversityindexdilutioncurvesfordifferentseleniumsourcegroups3.3.3Alpha多样性分析sobs指数在这里用来表示实际观测到真菌菌属的数目，由图3.3可知，IS（无机硒）组的sobs指数相较其他三组更高，其菌属的数目也相应较多；IS和NS（纳米硒）组的shannon指数高于YS（酵母硒）和CS（络合硒）组，所以IS和NS组的群落多样性大于其他两组（图3.4）。
第三章蛋鸡粪便样品的真菌多样性分析15图3.3不同硒源组的sobs指数图Figure3.3Sobsindexchartofdifferentseleniumsourcegroups图3.4不同硒源组的shannon指数图Figure3.4Shannonindexofdifferentseleniumsourcegroups3.3.4物种Venn图分析为了比较各样品间真菌组成情况及其组分丰度的差异，将无机硒（IS）、酵母硒（YS）、络合硒（CS）和纳米硒（NS）这4组样品做Venn图分析，由图3.5可知，4组样品分别获得219、181、187、和184个OTU，它们共有的OTU为103个，无机硒（IS）和酵母硒组（YS）共有的OTU数最多，为146个，酵母硒（YS）和纳米硒组（NS）仅共有130个OTU；IS组的独有OTU最多，为44个，而YS组的独有的OTU仅有14个，CS和NS组独有的OTU数较为接近，分别为23和24个。说明向饲料中添加不同硒源时，蛋鸡粪便中的真菌OTU具有一定的差异。
【参考文献】：
期刊论文
[1]饲粮中添加湿基发酵豆粕对蛋鸡产蛋性能、养分代谢率和蛋品质的影响[J]. 李彬,何开蓉,张遨然,胡声迪,富相奎,孙群,朱正鹏. 饲料工业. 2020(05)
[2]纳米硒的生物学功能及在养殖中的应用研究进展[J]. 苏文,杨辉. 饲料研究. 2020(01)
[3]饲料中亚硝酸盐的测定方法分析[J]. 刘晓莉,陈超,唐坤. 广州化工. 2019(23)
[4]硒添加水平对鲤鱼生长性能、硒沉积及抗氧化的影响[J]. 李少觐. 中国饲料. 2019(20)
[5]酵母硒对817肉鸡生产性能和免疫器官指数影响的研究[J]. 王娜. 家禽科学. 2019(10)
[6]发酵饲料对仔鸡肠道微生物群落多样性影响[J]. 张孟阳,毕付提,李洁,郭宏,马鑫,王德培. 中国家禽. 2019(13)
[7]高通量测序研究早期断奶仔猪粪便菌群的结构性差异[J]. 崔君,刘志鹏,殷茵,李留安,金天明,柳巨雄. 中国兽医杂志. 2019(06)
[8]SPF鸡和商品蛋鸡粪便菌群及大肠杆菌抗药性的比较分析[J]. 朱见深,王曦,张印,王怀中,张庆,骆延波,李璐璐,胡明,戴美学,刘玉庆,齐静. 家禽科学. 2019(05)
[9]树鼩肠道菌群多样性与功能预测研究[J]. 杨学芳,李波,郑红,曹雪,王利梅. 安徽农业科学. 2019(08)
[10]不同硒源对蛋鸡蛋品质、血清及蛋黄抗氧化指标的影响[J]. 吉莹利,林雪,杨婷,刘碧凡,王耀东,赵玉蓉. 中国家禽. 2019(08)
硕士论文
[1]硒对蛋鸡生产性能、血清生化指标及组织硒含量的影响[D]. 石雕.西北农林科技大学 2019
[2]基于高通量测序研究铜、汞和铅对鸡盲肠微生物多样性的影响[D]. 刘国辉.江西农业大学 2017
[3]蛋鸡肠道微生物菌群结构特征与产蛋水平关联性研究[D]. 张亚楠.河南农业大学 2016
[4]饲粮中添加益生菌对蛋鸡早期生长、养分利用及肠道菌群的影响[D]. 行浩.扬州大学 2016
[5]不同硒源对鸡生长性能、抗氧化和肉品质的影响[D]. 杨志勇.南京农业大学 2014
本文编号：3403344
本文链接：https://www.wllwen.com/shoufeilunwen/zaizhiyanjiusheng/3403344.html
