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不同山羊品种朊蛋白基因多态性及其与血液免疫性状的关联分析

发布时间:2025-03-19 05:56
  朊蛋白基因(PRNP)是调控朊蛋白表达的重要基因,存在高度的变异性,研究发现山羊PRNP基因编码区存在10个氨基酸变异位点(102,127,143,146,154,211,218,219,222和240)和三个同义代替位点(42,125和138),PRNP基因位于山羊13号染色体,研究发现山羊PRNP基因遗传多样性与痒病的抗病性/易感性显著相关。本试验以山东省规模化山羊养殖场为试验羊只,共采集851只山羊的血样,包括3个品种即鲁波山羊464只、莱芜黑山羊131只和崂山奶山羊256只,按年龄分为三组即1岁以下组、1岁-2岁组和2岁以上组。采取的技术路线是:首先,选取60只鲁波山羊提取DNA、设计引物和混池测序,找出所研究群体中该基因可能存在的多态性位点;对每只山羊的DNA样品进行测序,利用Chromas 2按照测序峰图再为每个多态位点进行基因型判定;用Pop Gen 32和SPSS 22分析PRNP基因多态位点和品种等对血液性状的效应值,找出与血液性状有关联的优势基因型。试验结果如下:1、在所研究群体中共发现11个SNP多态位点,其中有3个SNP位点(NH1、NH2和3’UTR)为首次发现...

【文章页数】:74 页

【学位级别】:硕士

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ABSTRACT
1 前言
    1.1 鲁波山羊、崂山奶山羊和莱芜黑山羊的特点
        1.1.1 鲁波山羊的特点
        1.1.2 崂山奶山羊的特点
        1.1.3 莱芜黑山羊的特点
        1.1.4 鲁波山羊、崂山奶山羊和莱芜黑山羊的抗病性状
    1.2 PRNP基因的研究进展
    1.3 朊蛋白
        1.3.1 朊蛋白基因和蛋白的结构
        1.3.2 朊蛋白基因的表达调控
    1.4 PRNP基因与山羊、绵羊痒病
        1.4.1 痒病研究进展
        1.4.2 PRNP基因与绵羊痒病
        1.4.3 PRNP基因与山羊痒病
    1.5 目的意义
2 材料与方法
    2.1 试验材料
        2.1.1 试验样品的采集
        2.1.2 试验仪器设备
        2.1.3 试验试剂及来源
        2.1.4 主要数据库及生物学软件
        2.1.5 常用试剂配制
    2.2 试验方法
        2.2.1 血常规的测定
        2.2.2 血液基因组DNA的提取
        2.2.3 PRNP基因的克隆及多态性分析
3 结果与分析
    3.1 混池测序结果以及基因分型
        3.1.1 混池测序结果
        3.1.2 混池测序基因分型
    3.2 不同山羊所有位点等位基因及基因型频率
    3.3 血常规测定结果
    3.4 血液基因组DNA提取结果
    3.5 三个品种山羊的所有位点多态性分析
        3.5.1 三个品种山羊的所有位点遗传变异统计值
        3.5.2 三个品种山羊的所有位点杂合度统计值
        3.5.3 三个品种山羊的所有位点F-统计量和基因流统计值
        3.5.4 三个品种山羊之间Nei氏遗传相似度和遗传距离
    3.6 不同因素与各项血液指标之间的显著性分析
    3.7 品种和年龄与不同位点两两交互作用与各项血液指标之间的显著性分析
4 讨论
    4.1 筛选目的片段
    4.2 不同山羊对羊痒病的易感性
    4.3 不同山羊品种内与品种间的遗传距离
    4.4 血液免疫指标与机体抗病力的关系
    4.5 不同因素与血液免疫指标的关系
5 结论
6 创新点
参考文献
致谢



本文编号:4036770

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