藻蓝色素蛋白抑制A549细胞活性机制的miRNA转录组学分析

发布时间：2022-01-24 05:14

　　藻蓝色素蛋白是我国认可的天然食用色素,可用于多种低温食品的着色;它同时也是一种优良的功能性色素蛋白。许多研究表明,藻蓝蛋白具有显著的肿瘤抑制作用,能够抑制非小细胞肺癌的增殖和迁移。为深入探究藻蓝蛋白抑制非小细胞肺癌活性的调控机制,本研究以A549细胞为代表,采用高通量小分子RNA转录组测序技术对藻蓝蛋白处理前后的细胞进行miRNA的筛选分析。结果表明,已知和新预测的miRNA被成功测序;通过统计学分析筛选得到了136个藻蓝蛋白处理后具有表达差异的miRNA,其中74个显著上调,62个显著下调。根据这些差异miRNA在不同样本中的表达情况,可以聚类为4类不同的表达模式;实时荧光定量聚合酶链式反应对上述miRNA进行表达量的验证,与转录组测序结果相吻合;此外,miRNA靶基因的Gene Ontology注释和功能富集分析结果显示,与细胞增殖信号转导调控过程相关的靶蛋白例如PAK4、MAPK13、RASSF10等均被预测为差异miRNA的全新靶点,可能在藻蓝蛋白抑制非小细胞肺癌增殖过程中起到重要的调控作用。不同于传统的mRNA转录组测序,本研究采用小分子miRNA测序深入探究了藻蓝蛋白抑制肺... 

【文章来源】：食品科学. 2020,41(21)北大核心EICSCD

【文章页数】：8 页

【部分图文】：

藻蓝蛋白对A549细胞体外增殖活性的影响

部分差异mi RNA的q PCR验证

2.7 mi RNA的靶基因功能分析结果使用mi Randa软件对筛选出的mi RNA进行靶基因的预测分析，共预测得到了5 186个潜在的靶基因。首先对这些靶基因进行了GO注释分析，结果如图7所示。GO注释可将基因分为三大类：生物过程、细胞组分和分子功能。在生物过程中，靶基因功能主要集中在代谢调控、应激反应和信号转导等；在细胞组分和分子功能中，主要集中在分子相互作用以及酶催化活性等。GO功能注释提供了靶基因的功能分类，但缺乏具体的功能信息，因此，为全面分析受到藻蓝蛋白调控mi RNA靶基因的功能，又对这些基因进行了GO富集分析（图8）。结果显示，细胞活动相关的许多生物学过程都在GO富集分析中出现显著性差异，主要包括细胞离子转运过程、细胞膜结构的调控过程、细胞增殖信号转导调控过程、细胞骨架系统形态发生过程等。藻蓝蛋白对A549细胞具有明显的增殖抑制作用，而GO富集分析中细胞增殖信号转导过程与本研究相一致，进一步表明了测序结果的准确性。

【参考文献】：
期刊论文
[1]肺癌分子生物学研究进展[J]. 代水平,汪周峰,李为民.  肿瘤防治研究. 2018(10)
[2]肺癌的流行病学及治疗现状[J]. 姚晓军,刘伦旭.  现代肿瘤医学. 2014(08)



本文编号：3605926