分枝杆菌噬菌体Guo1环状基因组特征及生物学特性分析

发布时间：2017-04-23 22:01

  本文关键词：分枝杆菌噬菌体Guo1环状基因组特征及生物学特性分析，，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：【目的】初步研究分枝杆菌噬菌体Guo1环状基因组特征及生物学特性。【方法】采用鸟枪法和重叠群组装策略完成Guo1全基因组测序;使用DNAStar、t RNAscan-SE、Promoter predictions、TRF、Glimmer、BLAST软件分别对噬菌体的一般基因组学特征、t RNA、启动子、串联重复序列和编码基因进行分析;运用BLAST软件检索与Guo1基因组相似的噬菌体并构建系统进化树,推断Guo1的分群;测定最佳感染复数、一步生长曲线以及对紫外线、氯仿、酒精、温度、p H的敏感性。【结果】噬菌体Guo1的基因组为全长40 086 nt的环状双链DNA,属于G群分枝杆菌噬菌体;含有59个推定基因,7个启动子序列和3个串联重复序列;Guo1对紫外线有较强抵抗性,对酒精、氯仿和高温敏感,最适温度为37°C,最适p H为7.0,最佳感染复数为0.01,潜伏期120 min,裂解期120 min,裂解量为47个。【结论】Guo1是首次发现的具有环状双链DNA结构的G群分枝杆菌噬菌体,完成了Guo1的全基因组测序,并初步分析了Guo1的基因组特征和生物学特性。
【作者单位】： 重庆医科大学附属第一医院呼吸与危重症医学科;
【关键词】： Guo 分枝杆菌噬菌体G群 环状基因组 生物学特性
【基金】：国家“十二五”重大专项课题(No.2012ZX10003-009) 国家临床重点专科专项经费资助项目(No.卫办医政函[2012]649号)
【分类号】：Q93
【正文快照】： 2012年WHO公布的疫情显示:2011年全球新增结核病人900万,值得注意的是印度和中国的耐药结核占到全世界的60%[1],我国也是全球第二大结核病高负担国家,发病人数一直位于甲、乙类传染病前列[2]。结核病治疗面临着易复发和病程迁延两大难题,临床上常采用长疗程化疗来彻底清除结核

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本文编号：323059